Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NSY4

Protein Details
Accession C0NSY4    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37DILSSRRTARRTSQRRRDTRSTRASHNHydrophilic
107-135SKTQIDRGLSKRKKKRKGKGKGKGRLFPLBasic
279-306ATKASAGSRRSRNRRGRNVGRPKPKSIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-131LSKRKKKRKGKGKGKGR
273-303QPKPVSATKASAGSRRSRNRRGRNVGRPKPK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MADKLDKSLDDILSSRRTARRTSQRRRDTRSTRASHNIAPVGGVKKTVRNAKSTSKSIPTGPSMGLGESKIIVSGLPSDVGEANIKHSYHSPRRIQTDATRSHMSFSKTQIDRGLSKRKKKRKGKGKGKGRLFPLALDPVIVSRAESCPAYYVRLMPCDICKAEKRHILIARYTLLCLHLANRNVARHVEYFHKSAGPVKKVMLTYNQNGTSRGIASITFVRPDTAAKAAKELNGLLIDKRPIKIEVVLDASRAPTVPAVKPLTERVAQPKPQPKPVSATKASAGSRRSRNRRGRNVGRPKPKSIAELDAEMEDYFPSSNTAPAATNGAAQPAAAGGEDLGMDEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.33
4 0.35
5 0.39
6 0.47
7 0.53
8 0.6
9 0.7
10 0.75
11 0.8
12 0.87
13 0.91
14 0.91
15 0.89
16 0.88
17 0.88
18 0.82
19 0.79
20 0.78
21 0.73
22 0.67
23 0.65
24 0.56
25 0.46
26 0.41
27 0.38
28 0.32
29 0.28
30 0.27
31 0.22
32 0.25
33 0.31
34 0.39
35 0.37
36 0.4
37 0.45
38 0.51
39 0.58
40 0.58
41 0.57
42 0.54
43 0.54
44 0.52
45 0.51
46 0.44
47 0.38
48 0.33
49 0.3
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.16
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.12
69 0.1
70 0.13
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.21
75 0.29
76 0.36
77 0.45
78 0.49
79 0.51
80 0.57
81 0.58
82 0.58
83 0.56
84 0.57
85 0.53
86 0.51
87 0.49
88 0.44
89 0.44
90 0.43
91 0.38
92 0.32
93 0.31
94 0.35
95 0.32
96 0.33
97 0.35
98 0.34
99 0.36
100 0.39
101 0.47
102 0.45
103 0.54
104 0.63
105 0.69
106 0.77
107 0.82
108 0.86
109 0.86
110 0.9
111 0.91
112 0.92
113 0.92
114 0.91
115 0.89
116 0.84
117 0.77
118 0.71
119 0.6
120 0.5
121 0.42
122 0.35
123 0.27
124 0.21
125 0.17
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.12
138 0.11
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.16
143 0.14
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.16
148 0.19
149 0.22
150 0.27
151 0.3
152 0.31
153 0.34
154 0.38
155 0.37
156 0.33
157 0.31
158 0.29
159 0.25
160 0.23
161 0.16
162 0.13
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.15
175 0.16
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.24
183 0.28
184 0.25
185 0.23
186 0.23
187 0.26
188 0.26
189 0.27
190 0.27
191 0.25
192 0.26
193 0.31
194 0.33
195 0.3
196 0.31
197 0.3
198 0.25
199 0.21
200 0.18
201 0.13
202 0.09
203 0.1
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.16
215 0.19
216 0.2
217 0.21
218 0.21
219 0.19
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.22
235 0.21
236 0.2
237 0.19
238 0.18
239 0.16
240 0.14
241 0.12
242 0.08
243 0.12
244 0.13
245 0.19
246 0.21
247 0.22
248 0.24
249 0.26
250 0.29
251 0.27
252 0.29
253 0.3
254 0.36
255 0.4
256 0.46
257 0.52
258 0.53
259 0.61
260 0.61
261 0.55
262 0.54
263 0.58
264 0.59
265 0.53
266 0.51
267 0.44
268 0.47
269 0.47
270 0.45
271 0.41
272 0.4
273 0.47
274 0.54
275 0.61
276 0.65
277 0.74
278 0.8
279 0.87
280 0.89
281 0.9
282 0.91
283 0.93
284 0.92
285 0.93
286 0.88
287 0.83
288 0.79
289 0.71
290 0.65
291 0.58
292 0.54
293 0.46
294 0.42
295 0.38
296 0.31
297 0.29
298 0.24
299 0.2
300 0.13
301 0.11
302 0.08
303 0.07
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.14
311 0.18
312 0.16
313 0.18
314 0.17
315 0.18
316 0.16
317 0.15
318 0.13
319 0.1
320 0.1
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06