Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9THK4

Protein Details
Accession A0A1L9THK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-115EGNLPGPKKRPRAPRNIERSSTHydrophilic
580-611SVEERARREYNKQRRKKKRRMAAIRRSQEEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-108PKKRPRAPR
586-604RREYNKQRRKKKRRMAAIR
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12.833, cyto_nucl 3.333, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR033443  PPR_long  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF17177  PPR_long  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MSRKRFKPDQLWHYLCPALGTPKRHIVTLPATRRRCAPSTPLGAIPRCLRRPYSSTSAKRSYDQSQQTQEHIHLDGGAEELSHNNDEYSEACDEGNLPGPKKRPRAPRNIERSSTGRLENLLAKKAEQSPNIINATQILRVLIRDRGIRPETRHYKALVQCHTDPRFGSPFMVRKLLAEMEQNDVPIDAGTLHSALQAVAVHPNFVLRADLLRTLRDRWFPLSPDGWHYVVAGLIREHQFELAMDHIAHMERKVIEVKPWLHSMLIYYLCDVKEFDQIIELMESRLSQGYQISKKLWNHVLEEAAFARHRDLTRFLWKRFVEVDRTPPRPYLTNLVLQMASHTRDKELLKSITNILGPSVDDEAKDYEMMSKASIKSGGLYAAFQTLSDMQDAGHEVVSRSTQAIRAHCVQNKIHPRNVWNVLKELKNDGENVPLACARVVVYLCTAAAVDDPFAVDDGIAFYKELHTLCGRHPDTATFNSLISMCRVGKNAESAMFMVKEMATLGVIPDAQTFEHLMLMCVDTGNFESSYLYLKDLRARGFHLSDNARLDIQSVCAKSNDEFAVKLKADPGLCPQGAMSVEERARREYNKQRRKKKRRMAAIRRSQEEDEDDFDAYEPGLSIPQDLLGKANQILRDAMGIRKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.51
3 0.42
4 0.35
5 0.34
6 0.33
7 0.36
8 0.37
9 0.45
10 0.46
11 0.45
12 0.43
13 0.4
14 0.44
15 0.5
16 0.55
17 0.55
18 0.58
19 0.59
20 0.64
21 0.64
22 0.58
23 0.53
24 0.5
25 0.49
26 0.53
27 0.55
28 0.55
29 0.55
30 0.52
31 0.52
32 0.51
33 0.51
34 0.49
35 0.5
36 0.47
37 0.48
38 0.51
39 0.54
40 0.57
41 0.58
42 0.61
43 0.66
44 0.7
45 0.66
46 0.64
47 0.62
48 0.58
49 0.58
50 0.58
51 0.57
52 0.58
53 0.58
54 0.58
55 0.55
56 0.51
57 0.44
58 0.37
59 0.29
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.21
83 0.2
84 0.21
85 0.25
86 0.33
87 0.41
88 0.49
89 0.56
90 0.59
91 0.65
92 0.74
93 0.8
94 0.83
95 0.85
96 0.85
97 0.8
98 0.74
99 0.68
100 0.63
101 0.56
102 0.47
103 0.38
104 0.3
105 0.3
106 0.32
107 0.32
108 0.31
109 0.27
110 0.26
111 0.3
112 0.36
113 0.39
114 0.34
115 0.35
116 0.34
117 0.4
118 0.42
119 0.37
120 0.3
121 0.27
122 0.27
123 0.22
124 0.19
125 0.13
126 0.11
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.16
131 0.2
132 0.21
133 0.28
134 0.32
135 0.36
136 0.39
137 0.47
138 0.52
139 0.52
140 0.53
141 0.48
142 0.52
143 0.52
144 0.55
145 0.5
146 0.48
147 0.48
148 0.54
149 0.54
150 0.48
151 0.43
152 0.4
153 0.38
154 0.32
155 0.31
156 0.27
157 0.31
158 0.32
159 0.34
160 0.29
161 0.26
162 0.28
163 0.27
164 0.23
165 0.21
166 0.19
167 0.2
168 0.21
169 0.2
170 0.17
171 0.16
172 0.14
173 0.1
174 0.09
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.05
195 0.07
196 0.08
197 0.13
198 0.13
199 0.16
200 0.18
201 0.2
202 0.24
203 0.26
204 0.27
205 0.26
206 0.29
207 0.29
208 0.31
209 0.31
210 0.28
211 0.29
212 0.3
213 0.26
214 0.23
215 0.21
216 0.17
217 0.15
218 0.14
219 0.1
220 0.07
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.2
244 0.22
245 0.23
246 0.24
247 0.23
248 0.2
249 0.19
250 0.18
251 0.16
252 0.15
253 0.12
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.1
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.13
277 0.15
278 0.17
279 0.19
280 0.24
281 0.25
282 0.3
283 0.33
284 0.3
285 0.29
286 0.29
287 0.28
288 0.23
289 0.23
290 0.18
291 0.14
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.15
299 0.18
300 0.28
301 0.34
302 0.33
303 0.39
304 0.38
305 0.39
306 0.39
307 0.37
308 0.32
309 0.28
310 0.37
311 0.36
312 0.39
313 0.38
314 0.36
315 0.35
316 0.31
317 0.31
318 0.27
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.23
323 0.21
324 0.19
325 0.19
326 0.14
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.22
335 0.22
336 0.21
337 0.23
338 0.23
339 0.21
340 0.21
341 0.18
342 0.13
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.12
390 0.15
391 0.16
392 0.2
393 0.24
394 0.3
395 0.32
396 0.36
397 0.33
398 0.38
399 0.48
400 0.48
401 0.48
402 0.45
403 0.45
404 0.47
405 0.55
406 0.51
407 0.42
408 0.41
409 0.41
410 0.41
411 0.4
412 0.35
413 0.29
414 0.25
415 0.26
416 0.22
417 0.21
418 0.19
419 0.18
420 0.16
421 0.14
422 0.13
423 0.11
424 0.11
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.13
455 0.15
456 0.17
457 0.27
458 0.27
459 0.27
460 0.27
461 0.28
462 0.3
463 0.31
464 0.33
465 0.23
466 0.22
467 0.21
468 0.21
469 0.19
470 0.15
471 0.17
472 0.14
473 0.15
474 0.17
475 0.17
476 0.18
477 0.21
478 0.21
479 0.19
480 0.19
481 0.18
482 0.18
483 0.17
484 0.16
485 0.13
486 0.11
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.08
502 0.11
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.1
508 0.09
509 0.09
510 0.07
511 0.09
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.14
518 0.13
519 0.14
520 0.14
521 0.16
522 0.23
523 0.26
524 0.29
525 0.27
526 0.3
527 0.33
528 0.33
529 0.34
530 0.35
531 0.34
532 0.36
533 0.37
534 0.36
535 0.3
536 0.28
537 0.27
538 0.2
539 0.2
540 0.21
541 0.18
542 0.18
543 0.19
544 0.21
545 0.2
546 0.25
547 0.24
548 0.2
549 0.2
550 0.21
551 0.28
552 0.27
553 0.27
554 0.23
555 0.25
556 0.24
557 0.24
558 0.29
559 0.3
560 0.29
561 0.28
562 0.26
563 0.26
564 0.26
565 0.26
566 0.21
567 0.2
568 0.23
569 0.28
570 0.3
571 0.31
572 0.35
573 0.37
574 0.45
575 0.49
576 0.58
577 0.64
578 0.73
579 0.79
580 0.86
581 0.93
582 0.95
583 0.95
584 0.94
585 0.94
586 0.95
587 0.96
588 0.95
589 0.95
590 0.93
591 0.87
592 0.82
593 0.72
594 0.65
595 0.59
596 0.51
597 0.43
598 0.36
599 0.31
600 0.25
601 0.24
602 0.21
603 0.15
604 0.12
605 0.09
606 0.08
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.12
612 0.14
613 0.13
614 0.15
615 0.14
616 0.17
617 0.19
618 0.23
619 0.21
620 0.22
621 0.22
622 0.21
623 0.24
624 0.23