Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9TSH4

Protein Details
Accession A0A1L9TSH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-64GSQYSKDAVKRKRADQEKRQRKARLLQRYEKEKIKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-64VKRKRADQEKRQRKARLLQRYEKEKIKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Amino Acid Sequences MNREIPGFYYDPEKKKYFAIQANHKSAPGSQYSKDAVKRKRADQEKRQRKARLLQRYEKEKIKKAACLEHPLMQARREIGALPATSSVEHEQRGLAYASQFRRKQLHQFEPWPDQYTIKHIVRNPRSGILIASGHRGGESSVSVCFPDCDQEKWTYNRTMERLLFKEPYRLSSLSLSHTGYLLATMDSGPDGDSFLAPRMLPDPDEGGDYRWPPFFSHPIRIHTTSSLWCSSPSPTGDMPRFAVGTSEGLYTLEGFGSYWALSKKPFPNDKSIGNPKRRRPDSSHTQITAVEWLSSDVIAAGLKDSTIFLHDIRSGGSAARLQHPHAVTKIRKLDPYRIVVAGINSLQMYDIRYPPNNLQRNPNPNAKHHASTRPYLNFSNHSPEIIPDFDLSPELGILATSSDDRKVQLFSLRTGEQIVSPLTRYQYRDSIKSICFESGSSSSHGPQTPSLLVCSEATVDEWNW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.53
4 0.53
5 0.53
6 0.56
7 0.6
8 0.67
9 0.74
10 0.7
11 0.63
12 0.55
13 0.49
14 0.44
15 0.41
16 0.36
17 0.3
18 0.34
19 0.37
20 0.43
21 0.48
22 0.52
23 0.53
24 0.59
25 0.65
26 0.67
27 0.74
28 0.78
29 0.81
30 0.83
31 0.86
32 0.86
33 0.89
34 0.9
35 0.86
36 0.84
37 0.83
38 0.82
39 0.82
40 0.8
41 0.81
42 0.81
43 0.83
44 0.82
45 0.81
46 0.79
47 0.76
48 0.76
49 0.7
50 0.67
51 0.64
52 0.66
53 0.63
54 0.63
55 0.58
56 0.55
57 0.55
58 0.55
59 0.52
60 0.44
61 0.41
62 0.34
63 0.32
64 0.26
65 0.22
66 0.18
67 0.19
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.17
81 0.16
82 0.14
83 0.14
84 0.2
85 0.25
86 0.34
87 0.35
88 0.37
89 0.43
90 0.45
91 0.52
92 0.55
93 0.59
94 0.58
95 0.64
96 0.66
97 0.68
98 0.67
99 0.62
100 0.53
101 0.45
102 0.38
103 0.37
104 0.39
105 0.33
106 0.35
107 0.34
108 0.44
109 0.48
110 0.54
111 0.5
112 0.45
113 0.43
114 0.39
115 0.36
116 0.28
117 0.25
118 0.19
119 0.19
120 0.17
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.09
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.17
138 0.22
139 0.27
140 0.3
141 0.34
142 0.33
143 0.34
144 0.37
145 0.37
146 0.38
147 0.37
148 0.39
149 0.37
150 0.36
151 0.38
152 0.33
153 0.38
154 0.33
155 0.32
156 0.31
157 0.3
158 0.27
159 0.27
160 0.28
161 0.23
162 0.25
163 0.22
164 0.18
165 0.17
166 0.16
167 0.12
168 0.1
169 0.08
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.16
202 0.21
203 0.22
204 0.3
205 0.32
206 0.36
207 0.4
208 0.41
209 0.39
210 0.33
211 0.32
212 0.24
213 0.24
214 0.21
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.17
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.14
251 0.19
252 0.26
253 0.34
254 0.35
255 0.43
256 0.45
257 0.48
258 0.5
259 0.56
260 0.57
261 0.6
262 0.65
263 0.65
264 0.72
265 0.73
266 0.7
267 0.67
268 0.68
269 0.68
270 0.69
271 0.69
272 0.59
273 0.56
274 0.5
275 0.43
276 0.36
277 0.26
278 0.17
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.18
308 0.19
309 0.19
310 0.24
311 0.25
312 0.26
313 0.27
314 0.33
315 0.3
316 0.37
317 0.44
318 0.42
319 0.47
320 0.48
321 0.54
322 0.52
323 0.54
324 0.49
325 0.41
326 0.39
327 0.34
328 0.31
329 0.24
330 0.17
331 0.13
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.1
337 0.11
338 0.14
339 0.18
340 0.2
341 0.23
342 0.3
343 0.4
344 0.45
345 0.45
346 0.51
347 0.56
348 0.63
349 0.65
350 0.67
351 0.61
352 0.57
353 0.63
354 0.59
355 0.55
356 0.52
357 0.56
358 0.52
359 0.53
360 0.56
361 0.53
362 0.52
363 0.5
364 0.49
365 0.43
366 0.43
367 0.46
368 0.38
369 0.34
370 0.3
371 0.28
372 0.28
373 0.25
374 0.22
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.14
380 0.1
381 0.09
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.07
389 0.08
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.14
394 0.15
395 0.17
396 0.23
397 0.24
398 0.25
399 0.31
400 0.3
401 0.29
402 0.3
403 0.28
404 0.21
405 0.21
406 0.2
407 0.16
408 0.17
409 0.19
410 0.21
411 0.25
412 0.28
413 0.31
414 0.38
415 0.41
416 0.44
417 0.46
418 0.5
419 0.47
420 0.47
421 0.44
422 0.37
423 0.32
424 0.28
425 0.29
426 0.25
427 0.26
428 0.25
429 0.25
430 0.25
431 0.3
432 0.32
433 0.29
434 0.27
435 0.3
436 0.31
437 0.29
438 0.29
439 0.24
440 0.24
441 0.22
442 0.21
443 0.17
444 0.13
445 0.14