FuNGI

A0A1L9TRV1

Protein Details

Accession

A0A1L9TRV1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
294-313	HEARRRFRERSPPPRRNEGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
202-214	RRRFDGRELRRRR
244-255	RGRRRRGSGRRD
296-309	ARRRFRERSPPPRR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019416 NCBP3
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000340 F:RNA 7-methylguanosine cap binding
Pfam	View protein in Pfam PF10309 NCBP3

Amino Acid Sequences

MDIDMDLDLGPLPEPEPIETEQTLQATTATSADGNVADPQSAETQSEKVHIRGVDELTTDNIKEFASTYFTLEPPARIEWIDDTSANIVYSSPEVGLQALAALTHDGELQEGGAASETATPTVPGEIPIIRLRSAKVLTSHPDSVLQVRIAVKADKKKPRAYEASRFYMMHPEHDPRERLRRELETDRRRSGGGDSDGDYRRRRFDGRELRRRRDRDHDEGITASMYDDAPATDRSDADRDWDRGRRRRGSGRRDREQELFPDEGSKSGRLRHRSASPGRDTLMMEGGYIEERHEARRRFRERSPPPRRNEGRELFGSAEGDTNSRELFPNKTANTYLKKELFPSKVSNHRRSDAIDVADETADLFARRISLPLVDGAQDTNPKRSRNIELFPDSSRSEHTGRGVNIRGAAGEDQGFAIRGAAENGISIKGRGGASVRELFPSKYHNNTGKELFSDKIEGRGGPRRKAEDMFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.15
4	0.16
5	0.21
6	0.21
7	0.23
8	0.23
9	0.23
10	0.22
11	0.19
12	0.17
13	0.14
14	0.14
15	0.12
16	0.1
17	0.09
18	0.09
19	0.1
20	0.1
21	0.1
22	0.12
23	0.12
24	0.11
25	0.11
26	0.13
27	0.15
28	0.15
29	0.15
30	0.14
31	0.16
32	0.17
33	0.22
34	0.23
35	0.21
36	0.25
37	0.24
38	0.25
39	0.27
40	0.28
41	0.25
42	0.23
43	0.23
44	0.21
45	0.22
46	0.2
47	0.16
48	0.14
49	0.12
50	0.12
51	0.12
52	0.1
53	0.14
54	0.14
55	0.17
56	0.19
57	0.19
58	0.22
59	0.23
60	0.22
61	0.21
62	0.22
63	0.19
64	0.17
65	0.19
66	0.18
67	0.2
68	0.2
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.17
73	0.16
74	0.13
75	0.1
76	0.09
77	0.1
78	0.09
79	0.08
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.05
88	0.04
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.04
101	0.04
102	0.05
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.09
110	0.09
111	0.08
112	0.1
113	0.1
114	0.13
115	0.16
116	0.17
117	0.17
118	0.18
119	0.18
120	0.21
121	0.22
122	0.22
123	0.21
124	0.24
125	0.27
126	0.32
127	0.32
128	0.27
129	0.28
130	0.26
131	0.25
132	0.24
133	0.19
134	0.16
135	0.16
136	0.17
137	0.17
138	0.19
139	0.22
140	0.28
141	0.37
142	0.44
143	0.49
144	0.54
145	0.57
146	0.62
147	0.66
148	0.65
149	0.66
150	0.63
151	0.63
152	0.59
153	0.55
154	0.48
155	0.47
156	0.39
157	0.33
158	0.29
159	0.27
160	0.28
161	0.32
162	0.34
163	0.3
164	0.4
165	0.38
166	0.38
167	0.38
168	0.39
169	0.41
170	0.49
171	0.55
172	0.55
173	0.59
174	0.58
175	0.54
176	0.5
177	0.45
178	0.37
179	0.33
180	0.26
181	0.22
182	0.21
183	0.26
184	0.28
185	0.31
186	0.32
187	0.27
188	0.27
189	0.28
190	0.29
191	0.27
192	0.35
193	0.43
194	0.5
195	0.6
196	0.65
197	0.71
198	0.78
199	0.78
200	0.72
201	0.72
202	0.69
203	0.65
204	0.64
205	0.57
206	0.49
207	0.45
208	0.41
209	0.3
210	0.22
211	0.14
212	0.08
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.04
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.09
223	0.1
224	0.1
225	0.12
226	0.15
227	0.17
228	0.2
229	0.27
230	0.33
231	0.39
232	0.47
233	0.5
234	0.52
235	0.6
236	0.66
237	0.7
238	0.74
239	0.75
240	0.76
241	0.75
242	0.73
243	0.66
244	0.59
245	0.51
246	0.44
247	0.35
248	0.26
249	0.24
250	0.2
251	0.18
252	0.17
253	0.16
254	0.13
255	0.18
256	0.24
257	0.27
258	0.3
259	0.33
260	0.37
261	0.43
262	0.49
263	0.5
264	0.49
265	0.45
266	0.43
267	0.4
268	0.35
269	0.28
270	0.24
271	0.17
272	0.12
273	0.1
274	0.1
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.13
281	0.19
282	0.23
283	0.3
284	0.41
285	0.47
286	0.5
287	0.56
288	0.63
289	0.67
290	0.75
291	0.78
292	0.77
293	0.76
294	0.81
295	0.8
296	0.76
297	0.75
298	0.68
299	0.62
300	0.55
301	0.52
302	0.42
303	0.38
304	0.31
305	0.21
306	0.18
307	0.13
308	0.12
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.1
314	0.1
315	0.13
316	0.17
317	0.24
318	0.24
319	0.26
320	0.28
321	0.33
322	0.38
323	0.39
324	0.41
325	0.38
326	0.39
327	0.4
328	0.45
329	0.43
330	0.4
331	0.42
332	0.42
333	0.48
334	0.56
335	0.61
336	0.58
337	0.57
338	0.55
339	0.52
340	0.52
341	0.46
342	0.39
343	0.31
344	0.26
345	0.25
346	0.23
347	0.19
348	0.14
349	0.09
350	0.08
351	0.07
352	0.06
353	0.05
354	0.07
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.1
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.13
366	0.19
367	0.19
368	0.27
369	0.31
370	0.32
371	0.35
372	0.4
373	0.46
374	0.47
375	0.51
376	0.5
377	0.51
378	0.52
379	0.51
380	0.5
381	0.43
382	0.37
383	0.34
384	0.3
385	0.26
386	0.26
387	0.28
388	0.3
389	0.31
390	0.36
391	0.36
392	0.33
393	0.33
394	0.3
395	0.27
396	0.22
397	0.21
398	0.16
399	0.14
400	0.12
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.09
405	0.09
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.09
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.14
418	0.14
419	0.15
420	0.16
421	0.16
422	0.22
423	0.28
424	0.28
425	0.28
426	0.3
427	0.3
428	0.3
429	0.36
430	0.35
431	0.36
432	0.44
433	0.48
434	0.51
435	0.56
436	0.58
437	0.52
438	0.5
439	0.46
440	0.39
441	0.34
442	0.34
443	0.29
444	0.3
445	0.29
446	0.27
447	0.3
448	0.39
449	0.43
450	0.46
451	0.52
452	0.53
453	0.56

A0A1L9TRV1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer