FuNGI

A0A1L9NDS5

Protein Details

Accession

A0A1L9NDS5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-50	GSNGPPPLRIRRPKVADPLVRPKRRPAMRPPAPTSA	Hydrophilic
131-153	ESQFTRPVRLQRRDPRARPNDAN	Hydrophilic
514-537	GTDTSRKKGKSKHPSSQPTPQPPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-44	LRIRRPKVADPLVRPKRRPAMRP
410-432	EKREKEARRVLGKKVRKALQKRE
472-510	KNKKEPSKGNLTPSGRSRHADPTKKGSAAAPRKRLGSPS
517-526	TSRKKGKSKH

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTTPTNDQTLKTPTGSNGPPPLRIRRPKVADPLVRPKRRPAMRPPAPTSAANGASRMPNSRPVTSGQLPGARAEKSLTPKNDFSANGFSGPLLSENYVDYPIVTTRRALREGLKHHIARFTSKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARPNDANVERGQLNSKPGSEQSTQMDELEREELEARKAAREKERADNMAQIAPSVGSAPKRHNAPKQKTQQVTKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLENTGKMRMIPVEKWYRFSAKNTFKALTIEEAERLMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQRKELEQFARQQKVYAGKQGTPGGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKNEKDYEEEELREKREKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDEESSDDSEAERQKEEEEGKAEEDKNKKEPSKGNLTPSGRSRHADPTKKGSAAAPRKRLGSPSDASGTDTSRKKGKSKHPSSQPTPQPPSRPMSPSASSLPVSKKRVRNVLAGGAGSASDVDGGAGSGGEMSESGKVKKLKLNPPSVASQSVTPQGSRAGSPAPLGSKSFSGSRASSPESLRGPTRISTPGPSGSAQGFPTPAEIHAAIPQSGIGSSDLLRIFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGSLKET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.38
3	0.39
4	0.42
5	0.41
6	0.47
7	0.5
8	0.58
9	0.6
10	0.67
11	0.69
12	0.7
13	0.75
14	0.76
15	0.81
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.82
22	0.77
23	0.76
24	0.76
25	0.76
26	0.75
27	0.75
28	0.75
29	0.77
30	0.84
31	0.81
32	0.79
33	0.74
34	0.67
35	0.6
36	0.56
37	0.51
38	0.41
39	0.36
40	0.3
41	0.3
42	0.31
43	0.31
44	0.26
45	0.31
46	0.35
47	0.36
48	0.35
49	0.35
50	0.42
51	0.41
52	0.43
53	0.38
54	0.38
55	0.36
56	0.37
57	0.37
58	0.29
59	0.26
60	0.24
61	0.25
62	0.29
63	0.36
64	0.39
65	0.42
66	0.43
67	0.45
68	0.48
69	0.43
70	0.4
71	0.39
72	0.35
73	0.3
74	0.28
75	0.25
76	0.2
77	0.2
78	0.17
79	0.11
80	0.11
81	0.1
82	0.11
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.11
87	0.11
88	0.14
89	0.16
90	0.16
91	0.17
92	0.23
93	0.28
94	0.3
95	0.31
96	0.35
97	0.41
98	0.46
99	0.51
100	0.53
101	0.5
102	0.5
103	0.54
104	0.48
105	0.48
106	0.49
107	0.48
108	0.48
109	0.47
110	0.52
111	0.55
112	0.63
113	0.62
114	0.62
115	0.61
116	0.61
117	0.63
118	0.59
119	0.56
120	0.54
121	0.47
122	0.47
123	0.45
124	0.46
125	0.52
126	0.57
127	0.62
128	0.65
129	0.75
130	0.79
131	0.82
132	0.83
133	0.81
134	0.82
135	0.77
136	0.74
137	0.74
138	0.66
139	0.64
140	0.54
141	0.49
142	0.41
143	0.37
144	0.33
145	0.24
146	0.26
147	0.23
148	0.23
149	0.21
150	0.22
151	0.27
152	0.25
153	0.26
154	0.26
155	0.28
156	0.28
157	0.26
158	0.27
159	0.21
160	0.21
161	0.2
162	0.15
163	0.12
164	0.13
165	0.14
166	0.13
167	0.16
168	0.15
169	0.19
170	0.23
171	0.28
172	0.34
173	0.4
174	0.43
175	0.49
176	0.55
177	0.52
178	0.5
179	0.49
180	0.43
181	0.38
182	0.33
183	0.24
184	0.18
185	0.15
186	0.13
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.13
191	0.17
192	0.21
193	0.27
194	0.34
195	0.42
196	0.51
197	0.57
198	0.64
199	0.71
200	0.75
201	0.76
202	0.77
203	0.75
204	0.71
205	0.68
206	0.6
207	0.53
208	0.47
209	0.41
210	0.37
211	0.31
212	0.26
213	0.24
214	0.24
215	0.23
216	0.23
217	0.23
218	0.22
219	0.21
220	0.22
221	0.19
222	0.2
223	0.24
224	0.25
225	0.28
226	0.27
227	0.26
228	0.25
229	0.24
230	0.21
231	0.17
232	0.18
233	0.18
234	0.19
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.18
239	0.16
240	0.13
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.07
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.09
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.1
264	0.12
265	0.13
266	0.19
267	0.29
268	0.29
269	0.33
270	0.34
271	0.36
272	0.35
273	0.38
274	0.41
275	0.39
276	0.45
277	0.46
278	0.44
279	0.4
280	0.4
281	0.36
282	0.29
283	0.23
284	0.17
285	0.14
286	0.13
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.17
294	0.26
295	0.34
296	0.4
297	0.44
298	0.47
299	0.52
300	0.53
301	0.51
302	0.52
303	0.48
304	0.43
305	0.48
306	0.52
307	0.47
308	0.48
309	0.51
310	0.42
311	0.39
312	0.41
313	0.35
314	0.3
315	0.3
316	0.35
317	0.36
318	0.39
319	0.38
320	0.34
321	0.34
322	0.37
323	0.36
324	0.34
325	0.29
326	0.26
327	0.29
328	0.3
329	0.27
330	0.2
331	0.19
332	0.12
333	0.1
334	0.09
335	0.06
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.09
354	0.09
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.06
361	0.05
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.08
368	0.11
369	0.14
370	0.17
371	0.24
372	0.31
373	0.32
374	0.4
375	0.46
376	0.51
377	0.52
378	0.5
379	0.44
380	0.43
381	0.41
382	0.36
383	0.33
384	0.26
385	0.25
386	0.24
387	0.23
388	0.18
389	0.19
390	0.21
391	0.19
392	0.18
393	0.19
394	0.21
395	0.23
396	0.27
397	0.27
398	0.27
399	0.33
400	0.38
401	0.42
402	0.49
403	0.54
404	0.58
405	0.61
406	0.64
407	0.65
408	0.67
409	0.65
410	0.63
411	0.62
412	0.61
413	0.66
414	0.69
415	0.71
416	0.74
417	0.73
418	0.76
419	0.73
420	0.69
421	0.63
422	0.59
423	0.51
424	0.43
425	0.4
426	0.32
427	0.28
428	0.26
429	0.23
430	0.17
431	0.15
432	0.13
433	0.13
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.11
442	0.15
443	0.17
444	0.17
445	0.15
446	0.14
447	0.14
448	0.18
449	0.2
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.19
454	0.23
455	0.24
456	0.26
457	0.3
458	0.31
459	0.35
460	0.41
461	0.41
462	0.44
463	0.49
464	0.49
465	0.54
466	0.55
467	0.54
468	0.56
469	0.56
470	0.54
471	0.53
472	0.53
473	0.45
474	0.42
475	0.39
476	0.41
477	0.48
478	0.52
479	0.51
480	0.53
481	0.56
482	0.55
483	0.52
484	0.45
485	0.46
486	0.48
487	0.52
488	0.52
489	0.49
490	0.52
491	0.52
492	0.52
493	0.45
494	0.41
495	0.34
496	0.3
497	0.31
498	0.28
499	0.29
500	0.27
501	0.26
502	0.27
503	0.28
504	0.27
505	0.3
506	0.33
507	0.37
508	0.45
509	0.53
510	0.58
511	0.64
512	0.72
513	0.76
514	0.83
515	0.83
516	0.84
517	0.82
518	0.81
519	0.79
520	0.74
521	0.69
522	0.64
523	0.63
524	0.58
525	0.52
526	0.46
527	0.45
528	0.42
529	0.4
530	0.39
531	0.36
532	0.32
533	0.32
534	0.36
535	0.38
536	0.42
537	0.47
538	0.5
539	0.54
540	0.62
541	0.61
542	0.59
543	0.56
544	0.55
545	0.5
546	0.43
547	0.36
548	0.27
549	0.23
550	0.17
551	0.12
552	0.06
553	0.04
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.04
566	0.08
567	0.1
568	0.11
569	0.17
570	0.2
571	0.24
572	0.31
573	0.39
574	0.45
575	0.52
576	0.61
577	0.59
578	0.6
579	0.61
580	0.58
581	0.52
582	0.43
583	0.36
584	0.3
585	0.32
586	0.29
587	0.24
588	0.22
589	0.22
590	0.22
591	0.21
592	0.2
593	0.16
594	0.16
595	0.17
596	0.19
597	0.18
598	0.19
599	0.2
600	0.2
601	0.19
602	0.2
603	0.21
604	0.21
605	0.22
606	0.22
607	0.24
608	0.28
609	0.31
610	0.33
611	0.33
612	0.37
613	0.35
614	0.37
615	0.36
616	0.34
617	0.32
618	0.29
619	0.32
620	0.3
621	0.3
622	0.31
623	0.32
624	0.33
625	0.33
626	0.32
627	0.3
628	0.27
629	0.27
630	0.24
631	0.22
632	0.19
633	0.17
634	0.19
635	0.17
636	0.16
637	0.17
638	0.16
639	0.16
640	0.19
641	0.21
642	0.18
643	0.17
644	0.17
645	0.14
646	0.13
647	0.13
648	0.09
649	0.09
650	0.09
651	0.14
652	0.16
653	0.16
654	0.18
655	0.2
656	0.22
657	0.23
658	0.27
659	0.26
660	0.32
661	0.39
662	0.45
663	0.46
664	0.55
665	0.63
666	0.64
667	0.63
668	0.56
669	0.5
670	0.45
671	0.49
672	0.45
673	0.39
674	0.37
675	0.35
676	0.35
677	0.33
678	0.32
679	0.25
680	0.19
681	0.17
682	0.18
683	0.21
684	0.22
685	0.23
686	0.29
687	0.31
688	0.3
689	0.34

A0A1L9NDS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer