FuNGI

A0A1L9NCX5

Protein Details

Accession

A0A1L9NCX5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1154-1179	IRDPIICPFVPKRRRQRNPVGLMDPQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 12, nucl 5.5, cyto_nucl 5.5, cyto 4.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MEIETESIHSASQAKMGLLSHTLVSSPIIQWILPAHLRSKDQNDVVFVGERHLQIKEAVSGVHLEEVTTKNDFDSCIMAAKVINVSTELPWEEEMKLAASNSTLRASSDLRQDLPPQILVLSLASKELVFLYFSNASGQFVYHRRPLPNDVSAFERFGRNIAVEPRSRAVAVSASSDYFGIFVLKRPPVIQAQMTQNRLDPIAEERFFRVEGDIIAMEFLYPKSEDGDKITLLLLIAQDQLTQAVCYEWDANESLRLATPRVTKKVLPLEDRLPTMLIPLTKTSSFMLVTTTSITVYQNKLDPQRLPSRYPLPVYEKESQKSPLWTRWARPLRNWLYNQKHDDIYLCREDGEITYLGIGTDGELENQAHLGQLCCDVDAAFDILDIGYEGGDLLLAAGTTGDGGLFVQKARDHPRCVQKFMNWTPVTDSVVVKSEDTVPSDIATDRLFVCSASSFSRGAVVELRHGVEAQIGLIVALEELSGTRDIWTMPDGTTGGVFVLTSDPMSSLLLYLPADFGEELCAIDEAESGLDSSTQTLAAGCTVLGAILQVTDKTICVGTTPEMPGYRFEVDPGQTIAVAAVDGPASLIAAVVRTQDEVHLHVKKLTSDGQHQLLDLAPPSLIQHEPVCMTMENLDSSLFLFLGTSNGRVLVYRISESISFLLEATVNVGSENDISRAIDSIAIIRKADKVSPRMCTILCGLRSGILVPFGLLLDRENPDAPIALTQVTPQQLGHTSVKVQGKGEFALLTCGQGFWQASCNGGQADYSLQRIWVTDQNNPAYHPKSIHSFSISSSGSQEMDGLSNTLFCVADGQLMICTLEQGTKTVPRRIDLPGSASRLAYSRYLKSLIVVYSQTEYDTDADPIKRYTRPFIEFVDPDMQHSLIDSLENPLDDDPHPWRPQGAAGEKISCILEWTPRKGDEEYHFIVIGTSRKNQQERGRVIFLQAYRDPSKPSRIECSVKYIHKFEGPVFAIAPYGAFTLMVSTGHEIVPLEPKFSQTRWVRAARYSVLSPAVLITAREPYLYMTTSRESLMVLKATEDKLTLHAYDRQKHDGLAHVYIGGKLNLILCSSRGGRVSLLTENSVTETNKMLPTALCEAHLPSSVMRLSSGSDKSPLSTSSQVFYGTAMNGTIYRFLTIGEKEWRLLRLLQDLCIRDPIICPFVPKRRRQRNPVGLMDPQPSQMHIDGDILSRLLIRGSSYLMQMLSKETFGGPAAAGIRSEQGIPEQFAELTRHVLGETSDAVASVMRWLQRILPVDV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.17
4	0.18
5	0.17
6	0.18
7	0.15
8	0.14
9	0.14
10	0.12
11	0.13
12	0.14
13	0.12
14	0.15
15	0.15
16	0.14
17	0.15
18	0.16
19	0.2
20	0.21
21	0.23
22	0.23
23	0.28
24	0.32
25	0.37
26	0.42
27	0.45
28	0.46
29	0.46
30	0.45
31	0.42
32	0.4
33	0.38
34	0.31
35	0.26
36	0.26
37	0.24
38	0.23
39	0.22
40	0.21
41	0.19
42	0.21
43	0.21
44	0.17
45	0.16
46	0.15
47	0.16
48	0.16
49	0.17
50	0.14
51	0.11
52	0.15
53	0.17
54	0.19
55	0.19
56	0.18
57	0.16
58	0.17
59	0.18
60	0.15
61	0.16
62	0.14
63	0.16
64	0.16
65	0.16
66	0.15
67	0.16
68	0.17
69	0.14
70	0.14
71	0.12
72	0.14
73	0.14
74	0.17
75	0.16
76	0.15
77	0.16
78	0.17
79	0.16
80	0.16
81	0.16
82	0.14
83	0.14
84	0.13
85	0.12
86	0.11
87	0.13
88	0.14
89	0.15
90	0.15
91	0.14
92	0.18
93	0.2
94	0.23
95	0.3
96	0.32
97	0.32
98	0.35
99	0.37
100	0.38
101	0.38
102	0.34
103	0.25
104	0.22
105	0.19
106	0.17
107	0.15
108	0.12
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.14
119	0.15
120	0.15
121	0.18
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.17
126	0.17
127	0.2
128	0.25
129	0.29
130	0.34
131	0.36
132	0.41
133	0.47
134	0.49
135	0.52
136	0.49
137	0.44
138	0.43
139	0.42
140	0.4
141	0.34
142	0.3
143	0.23
144	0.22
145	0.22
146	0.18
147	0.2
148	0.24
149	0.28
150	0.28
151	0.32
152	0.32
153	0.32
154	0.31
155	0.28
156	0.23
157	0.2
158	0.18
159	0.18
160	0.18
161	0.16
162	0.17
163	0.16
164	0.15
165	0.11
166	0.1
167	0.09
168	0.09
169	0.12
170	0.18
171	0.2
172	0.21
173	0.21
174	0.25
175	0.27
176	0.31
177	0.3
178	0.3
179	0.38
180	0.45
181	0.47
182	0.44
183	0.41
184	0.38
185	0.36
186	0.3
187	0.21
188	0.19
189	0.25
190	0.25
191	0.24
192	0.25
193	0.26
194	0.26
195	0.26
196	0.21
197	0.14
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.11
211	0.13
212	0.14
213	0.18
214	0.21
215	0.19
216	0.19
217	0.19
218	0.17
219	0.15
220	0.14
221	0.1
222	0.08
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.08
234	0.09
235	0.08
236	0.1
237	0.11
238	0.11
239	0.13
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.14
244	0.13
245	0.17
246	0.25
247	0.3
248	0.34
249	0.37
250	0.36
251	0.43
252	0.51
253	0.53
254	0.49
255	0.47
256	0.47
257	0.48
258	0.47
259	0.41
260	0.32
261	0.25
262	0.22
263	0.2
264	0.15
265	0.13
266	0.14
267	0.17
268	0.16
269	0.18
270	0.17
271	0.17
272	0.16
273	0.15
274	0.15
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.12
279	0.1
280	0.11
281	0.12
282	0.14
283	0.15
284	0.17
285	0.18
286	0.22
287	0.27
288	0.3
289	0.32
290	0.35
291	0.43
292	0.45
293	0.45
294	0.47
295	0.48
296	0.48
297	0.47
298	0.46
299	0.44
300	0.45
301	0.48
302	0.5
303	0.49
304	0.47
305	0.48
306	0.46
307	0.42
308	0.44
309	0.42
310	0.41
311	0.44
312	0.47
313	0.46
314	0.53
315	0.59
316	0.55
317	0.56
318	0.6
319	0.59
320	0.63
321	0.65
322	0.65
323	0.64
324	0.69
325	0.69
326	0.61
327	0.55
328	0.47
329	0.45
330	0.38
331	0.35
332	0.29
333	0.25
334	0.21
335	0.21
336	0.21
337	0.18
338	0.17
339	0.12
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.04
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.06
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.02
378	0.03
379	0.02
380	0.02
381	0.02
382	0.02
383	0.02
384	0.02
385	0.02
386	0.02
387	0.02
388	0.02
389	0.02
390	0.02
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.06
395	0.08
396	0.13
397	0.21
398	0.27
399	0.31
400	0.38
401	0.49
402	0.51
403	0.55
404	0.55
405	0.51
406	0.55
407	0.54
408	0.57
409	0.46
410	0.43
411	0.41
412	0.39
413	0.37
414	0.29
415	0.25
416	0.16
417	0.19
418	0.19
419	0.15
420	0.14
421	0.15
422	0.14
423	0.16
424	0.15
425	0.12
426	0.12
427	0.13
428	0.12
429	0.11
430	0.1
431	0.09
432	0.08
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.09
439	0.1
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.14
444	0.13
445	0.14
446	0.16
447	0.14
448	0.14
449	0.15
450	0.16
451	0.13
452	0.13
453	0.12
454	0.09
455	0.08
456	0.06
457	0.05
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.03
463	0.03
464	0.02
465	0.02
466	0.02
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.06
483	0.05
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.05
503	0.05
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.03
516	0.03
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.02
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.04
543	0.05
544	0.06
545	0.07
546	0.09
547	0.1
548	0.11
549	0.12
550	0.12
551	0.13
552	0.15
553	0.16
554	0.13
555	0.13
556	0.14
557	0.14
558	0.15
559	0.14
560	0.11
561	0.09
562	0.09
563	0.08
564	0.06
565	0.05
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.02
572	0.02
573	0.02
574	0.02
575	0.02
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.05
582	0.06
583	0.07
584	0.09
585	0.13
586	0.15
587	0.15
588	0.17
589	0.18
590	0.17
591	0.19
592	0.2
593	0.17
594	0.19
595	0.22
596	0.23
597	0.23
598	0.22
599	0.2
600	0.17
601	0.15
602	0.11
603	0.08
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.08
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.07
621	0.07
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.04
627	0.04
628	0.03
629	0.05
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.07
637	0.07
638	0.08
639	0.08
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.1
644	0.1
645	0.08
646	0.07
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.05
651	0.06
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.06
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.05
667	0.08
668	0.1
669	0.1
670	0.1
671	0.11
672	0.13
673	0.13
674	0.16
675	0.17
676	0.21
677	0.24
678	0.27
679	0.28
680	0.27
681	0.27
682	0.25
683	0.23
684	0.23
685	0.2
686	0.18
687	0.16
688	0.15
689	0.15
690	0.14
691	0.12
692	0.08
693	0.07
694	0.06
695	0.06
696	0.05
697	0.05
698	0.04
699	0.05
700	0.06
701	0.07
702	0.08
703	0.08
704	0.09
705	0.09
706	0.09
707	0.09
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.07
713	0.09
714	0.1
715	0.1
716	0.09
717	0.1
718	0.11
719	0.15
720	0.16
721	0.14
722	0.14
723	0.2
724	0.23
725	0.22
726	0.22
727	0.2
728	0.2
729	0.19
730	0.19
731	0.14
732	0.11
733	0.13
734	0.12
735	0.1
736	0.09
737	0.08
738	0.07
739	0.09
740	0.09
741	0.06
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.11
746	0.12
747	0.1
748	0.1
749	0.09
750	0.06
751	0.09
752	0.09
753	0.1
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.1
758	0.12
759	0.15
760	0.16
761	0.18
762	0.23
763	0.26
764	0.27
765	0.28
766	0.3
767	0.27
768	0.27
769	0.24
770	0.21
771	0.23
772	0.24
773	0.24
774	0.22
775	0.21
776	0.2
777	0.25
778	0.24
779	0.18
780	0.18
781	0.17
782	0.15
783	0.14
784	0.13
785	0.07
786	0.08
787	0.07
788	0.07
789	0.06
790	0.06
791	0.05
792	0.06
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.06
799	0.07
800	0.06
801	0.06
802	0.07
803	0.05
804	0.05
805	0.04
806	0.06
807	0.06
808	0.07
809	0.08
810	0.15
811	0.19
812	0.24
813	0.25
814	0.25
815	0.27
816	0.3
817	0.33
818	0.27
819	0.29
820	0.28
821	0.31
822	0.31
823	0.28
824	0.25
825	0.22
826	0.22
827	0.21
828	0.2
829	0.18
830	0.19
831	0.21
832	0.21
833	0.21
834	0.22
835	0.18
836	0.17
837	0.16
838	0.14
839	0.14
840	0.14
841	0.13
842	0.1
843	0.11
844	0.1
845	0.11
846	0.11
847	0.13
848	0.14
849	0.15
850	0.16
851	0.19
852	0.21
853	0.22
854	0.27
855	0.3
856	0.33
857	0.34
858	0.36
859	0.39
860	0.36
861	0.38
862	0.39
863	0.32
864	0.3
865	0.29
866	0.25
867	0.18
868	0.18
869	0.15
870	0.07
871	0.08
872	0.07
873	0.08
874	0.08
875	0.08
876	0.09
877	0.08
878	0.1
879	0.1
880	0.13
881	0.15
882	0.22
883	0.23
884	0.23
885	0.24
886	0.22
887	0.26
888	0.3
889	0.29
890	0.27
891	0.28
892	0.29
893	0.29
894	0.29
895	0.25
896	0.18
897	0.16
898	0.11
899	0.18
900	0.21
901	0.25
902	0.28
903	0.29
904	0.32
905	0.31
906	0.36
907	0.32
908	0.35
909	0.33
910	0.31
911	0.3
912	0.26
913	0.26
914	0.22
915	0.22
916	0.17
917	0.18
918	0.22
919	0.28
920	0.31
921	0.38
922	0.44
923	0.5
924	0.54
925	0.58
926	0.57
927	0.51
928	0.5
929	0.47
930	0.4
931	0.36
932	0.32
933	0.31
934	0.3
935	0.31
936	0.34
937	0.33
938	0.4
939	0.38
940	0.4
941	0.41
942	0.44
943	0.48
944	0.45
945	0.49
946	0.48
947	0.5
948	0.51
949	0.46
950	0.42
951	0.4
952	0.4
953	0.33
954	0.35
955	0.3
956	0.27
957	0.24
958	0.22
959	0.19
960	0.17
961	0.16
962	0.08
963	0.07
964	0.06
965	0.05
966	0.05
967	0.06
968	0.06
969	0.06
970	0.06
971	0.07
972	0.09
973	0.09
974	0.09
975	0.09
976	0.09
977	0.17
978	0.17
979	0.18
980	0.17
981	0.2
982	0.23
983	0.23
984	0.32
985	0.28
986	0.36
987	0.4
988	0.46
989	0.46
990	0.46
991	0.51
992	0.45
993	0.44
994	0.37
995	0.32
996	0.28
997	0.25
998	0.22
999	0.17
1000	0.15
1001	0.11
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.11
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.12
1009	0.14
1010	0.15
1011	0.15
1012	0.15
1013	0.17
1014	0.18
1015	0.18
1016	0.16
1017	0.14
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.16
1021	0.14
1022	0.15
1023	0.18
1024	0.19
1025	0.19
1026	0.17
1027	0.15
1028	0.16
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.17
1032	0.24
1033	0.3
1034	0.37
1035	0.41
1036	0.44
1037	0.42
1038	0.42
1039	0.41
1040	0.41
1041	0.37
1042	0.32
1043	0.28
1044	0.24
1045	0.23
1046	0.24
1047	0.24
1048	0.16
1049	0.12
1050	0.11
1051	0.12
1052	0.11
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.1
1056	0.14
1057	0.15
1058	0.17
1059	0.17
1060	0.18
1061	0.17
1062	0.19
1063	0.22
1064	0.22
1065	0.23
1066	0.21
1067	0.2
1068	0.2
1069	0.21
1070	0.21
1071	0.19
1072	0.15
1073	0.16
1074	0.18
1075	0.18
1076	0.18
1077	0.18
1078	0.15
1079	0.19
1080	0.22
1081	0.21
1082	0.18
1083	0.18
1084	0.2
1085	0.2
1086	0.22
1087	0.19
1088	0.14
1089	0.18
1090	0.18
1091	0.17
1092	0.16
1093	0.14
1094	0.15
1095	0.2
1096	0.23
1097	0.2
1098	0.22
1099	0.22
1100	0.24
1101	0.25
1102	0.24
1103	0.23
1104	0.27
1105	0.26
1106	0.25
1107	0.26
1108	0.25
1109	0.22
1110	0.22
1111	0.19
1112	0.14
1113	0.13
1114	0.11
1115	0.11
1116	0.11
1117	0.11
1118	0.13
1119	0.12
1120	0.12
1121	0.11
1122	0.12
1123	0.16
1124	0.16
1125	0.21
1126	0.25
1127	0.26
1128	0.27
1129	0.3
1130	0.31
1131	0.29
1132	0.3
1133	0.28
1134	0.31
1135	0.31
1136	0.34
1137	0.37
1138	0.38
1139	0.37
1140	0.38
1141	0.35
1142	0.26
1143	0.27
1144	0.27
1145	0.25
1146	0.23
1147	0.27
1148	0.31
1149	0.41
1150	0.5
1151	0.58
1152	0.64
1153	0.71
1154	0.81
1155	0.86
1156	0.89
1157	0.89
1158	0.89
1159	0.88
1160	0.82
1161	0.77
1162	0.71
1163	0.64
1164	0.54
1165	0.47
1166	0.38
1167	0.31
1168	0.29
1169	0.24
1170	0.21
1171	0.19
1172	0.19
1173	0.17
1174	0.18
1175	0.18
1176	0.14
1177	0.13
1178	0.12
1179	0.11
1180	0.1
1181	0.09
1182	0.09
1183	0.09
1184	0.13
1185	0.14
1186	0.15
1187	0.17
1188	0.17
1189	0.17
1190	0.16
1191	0.19
1192	0.17
1193	0.15
1194	0.16
1195	0.14
1196	0.15
1197	0.15
1198	0.15
1199	0.11
1200	0.12
1201	0.14
1202	0.13
1203	0.13
1204	0.13
1205	0.14
1206	0.13
1207	0.14
1208	0.11
1209	0.15
1210	0.17
1211	0.19
1212	0.2
1213	0.19
1214	0.19
1215	0.21
1216	0.24
1217	0.2
1218	0.21
1219	0.19
1220	0.18
1221	0.17
1222	0.17
1223	0.15
1224	0.15
1225	0.15
1226	0.13
1227	0.12
1228	0.12
1229	0.12
1230	0.11
1231	0.11
1232	0.11
1233	0.13
1234	0.13
1235	0.14
1236	0.15
1237	0.18
1238	0.24

A0A1L9NCX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer