FuNGI

C0P0D6

Protein Details

Accession

C0P0D6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
111-131	AATTRSSRDARKKQKGRGGAE	Hydrophilic
155-176	DLLGAGKRKRKHQEHNTNIFNP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
98-128	GPRRRRPAAAAAAAATTRSSRDARKKQKGRG

Subcellular Location(s)

extr 17, cyto 3, nucl 2, plas 2, pero 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046349 C1-like_sf IPR007198 Ssl1-like IPR004595 TFIIH_C1-like_dom IPR012170 TFIIH_SSL1/p44 IPR036465 vWFA_dom_sf IPR013087 Znf_C2H2_type IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
Pfam	View protein in Pfam PF07975 C1_4 PF04056 Ssl1
PROSITE	View protein in PROSITE PS00028 ZINC_FINGER_C2H2_1

Amino Acid Sequences

MLLLLVLLFVEVHLRVKLLFSQSAPSLACYTNQLRPASWQTSSPPSEDHITAIYTLTSMSDSDDEYVAHASDHDLDDVLDEDDDDDDDELDARPSASGPRRRRPAAAAAAAATTRSSRDARKKQKGRGGAEWEVSRTWETLVESADGTISATVEDLLGAGKRKRKHQEHNTNIFNPSSHTPTHGTREVLIIFGALLSSDPGDIHQTITALVADKIRISIIGLAAQVAICRDLCARTNNGDDTVYGVALNEQHFRELFMDVTAPPVTTVAPTSTPTASSANGPKTTTTNTTASSLLMMGFPSLTLTTTPTPSLCACHSKPSRAGYLCCRCNAKVCTLPSSCPCCGLTLILSTHLARSYHHLFPLMNWVEVSWRRAARKRSASCFACGVGFPRMPKLVSGEPEETAKAAVGVGVSVSGRYECPVCECHFCIDCDVFAHEVVHNCPGCQSGVVQQQRLNGNGVADEMDTG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.12
4	0.16
5	0.19
6	0.22
7	0.21
8	0.25
9	0.26
10	0.3
11	0.28
12	0.26
13	0.24
14	0.22
15	0.22
16	0.23
17	0.27
18	0.29
19	0.35
20	0.34
21	0.31
22	0.37
23	0.44
24	0.42
25	0.39
26	0.36
27	0.35
28	0.42
29	0.44
30	0.39
31	0.33
32	0.31
33	0.34
34	0.32
35	0.28
36	0.21
37	0.2
38	0.19
39	0.18
40	0.14
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.07
45	0.07
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.11
50	0.11
51	0.11
52	0.11
53	0.12
54	0.1
55	0.09
56	0.09
57	0.08
58	0.1
59	0.11
60	0.1
61	0.1
62	0.09
63	0.1
64	0.11
65	0.1
66	0.07
67	0.06
68	0.06
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.14
83	0.22
84	0.32
85	0.4
86	0.49
87	0.58
88	0.6
89	0.63
90	0.61
91	0.62
92	0.6
93	0.55
94	0.46
95	0.38
96	0.36
97	0.33
98	0.28
99	0.19
100	0.11
101	0.09
102	0.11
103	0.13
104	0.2
105	0.31
106	0.42
107	0.53
108	0.64
109	0.72
110	0.77
111	0.82
112	0.83
113	0.79
114	0.77
115	0.74
116	0.67
117	0.63
118	0.55
119	0.48
120	0.39
121	0.34
122	0.26
123	0.18
124	0.14
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.08
134	0.07
135	0.06
136	0.05
137	0.04
138	0.04
139	0.04
140	0.04
141	0.03
142	0.03
143	0.04
144	0.05
145	0.08
146	0.11
147	0.17
148	0.2
149	0.29
150	0.39
151	0.48
152	0.58
153	0.67
154	0.75
155	0.8
156	0.86
157	0.84
158	0.77
159	0.69
160	0.58
161	0.47
162	0.38
163	0.3
164	0.24
165	0.17
166	0.18
167	0.19
168	0.22
169	0.27
170	0.27
171	0.26
172	0.23
173	0.25
174	0.22
175	0.19
176	0.16
177	0.1
178	0.07
179	0.06
180	0.05
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.04
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.06
206	0.05
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.05
218	0.06
219	0.08
220	0.1
221	0.12
222	0.14
223	0.16
224	0.16
225	0.17
226	0.16
227	0.14
228	0.14
229	0.12
230	0.1
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.07
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.11
242	0.1
243	0.09
244	0.07
245	0.08
246	0.07
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.13
263	0.12
264	0.14
265	0.18
266	0.19
267	0.21
268	0.21
269	0.2
270	0.21
271	0.23
272	0.23
273	0.23
274	0.21
275	0.2
276	0.22
277	0.21
278	0.19
279	0.17
280	0.14
281	0.1
282	0.08
283	0.07
284	0.05
285	0.05
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.11
295	0.11
296	0.13
297	0.13
298	0.15
299	0.15
300	0.21
301	0.21
302	0.3
303	0.33
304	0.36
305	0.41
306	0.41
307	0.47
308	0.42
309	0.45
310	0.45
311	0.51
312	0.5
313	0.48
314	0.49
315	0.42
316	0.46
317	0.45
318	0.42
319	0.39
320	0.38
321	0.42
322	0.4
323	0.43
324	0.42
325	0.46
326	0.4
327	0.35
328	0.33
329	0.27
330	0.26
331	0.24
332	0.18
333	0.15
334	0.16
335	0.15
336	0.16
337	0.15
338	0.15
339	0.16
340	0.15
341	0.12
342	0.19
343	0.23
344	0.24
345	0.25
346	0.26
347	0.23
348	0.24
349	0.34
350	0.29
351	0.24
352	0.21
353	0.2
354	0.24
355	0.26
356	0.28
357	0.23
358	0.26
359	0.32
360	0.39
361	0.46
362	0.5
363	0.59
364	0.64
365	0.65
366	0.71
367	0.67
368	0.63
369	0.59
370	0.49
371	0.4
372	0.32
373	0.28
374	0.24
375	0.24
376	0.22
377	0.23
378	0.25
379	0.24
380	0.24
381	0.27
382	0.27
383	0.28
384	0.33
385	0.31
386	0.3
387	0.31
388	0.3
389	0.25
390	0.2
391	0.16
392	0.1
393	0.08
394	0.08
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.09
405	0.1
406	0.1
407	0.14
408	0.18
409	0.21
410	0.25
411	0.27
412	0.32
413	0.33
414	0.34
415	0.35
416	0.32
417	0.29
418	0.25
419	0.25
420	0.21
421	0.19
422	0.19
423	0.17
424	0.18
425	0.2
426	0.25
427	0.23
428	0.22
429	0.22
430	0.22
431	0.21
432	0.19
433	0.18
434	0.19
435	0.29
436	0.34
437	0.37
438	0.38
439	0.43
440	0.46
441	0.46
442	0.41
443	0.33
444	0.28
445	0.25
446	0.24
447	0.18

C0P0D6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer