Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9MSC5

Protein Details
Accession A0A1L9MSC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-69GEPAHKKLKTNGRNTRNNDAQEHydrophilic
122-141ASGPREKEKRSKKINTYGLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-133PREKEKRSK
437-439KRK
450-458KPNGRKRRG
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11.333, cyto 5, cyto_nucl 4.333, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MARMTRSATARETALLAAQMQQKEAQPSKRATTATSGGRPMKRNGIVGEPAHKKLKTNGRNTRNNDAQELPHNLGSATLLSELQDKSAPIKLDTRDTTIKKEDIDALSDTLQSTVDKATRAASGPREKEKRSKKINTYGLTPGISPFPNWAHPTPDECEEVNRLLSTVHGEIVAPTTIPEPSLTVTGCGEVPSVLDALIRTLLSGATTGNNSAMAFNGLVQRFGILKEGVGKGSVDWDAVRRAPLKDVFEAIKRGGLADVKSKKIKAILDMVYEENQQRRDMLLKGSQDAPQDLLTKSEGGKQYEIACADQNFLSLNHLHSLTTEDAMVELVKYPGIGPKTAACVLLFCLQRPCFAVDTHIFRICKWLGWVPPDKATEITAFSHLEVRIPDHLKYSLHQLLIRHGKSCPRCRAITGQSSAGWEEGCVIDHLVKRTGKRKGGSMESTEEVKPNGRKRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.15
4 0.18
5 0.22
6 0.22
7 0.22
8 0.24
9 0.26
10 0.33
11 0.4
12 0.41
13 0.42
14 0.47
15 0.5
16 0.53
17 0.51
18 0.45
19 0.45
20 0.44
21 0.45
22 0.45
23 0.47
24 0.49
25 0.54
26 0.56
27 0.54
28 0.56
29 0.52
30 0.51
31 0.46
32 0.45
33 0.45
34 0.43
35 0.48
36 0.44
37 0.45
38 0.48
39 0.46
40 0.42
41 0.45
42 0.53
43 0.53
44 0.59
45 0.65
46 0.69
47 0.78
48 0.82
49 0.83
50 0.8
51 0.73
52 0.67
53 0.6
54 0.53
55 0.49
56 0.48
57 0.41
58 0.34
59 0.32
60 0.27
61 0.24
62 0.21
63 0.15
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.24
78 0.24
79 0.31
80 0.33
81 0.36
82 0.4
83 0.41
84 0.45
85 0.45
86 0.44
87 0.37
88 0.37
89 0.37
90 0.3
91 0.3
92 0.26
93 0.22
94 0.21
95 0.21
96 0.19
97 0.13
98 0.13
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.14
107 0.16
108 0.19
109 0.24
110 0.31
111 0.36
112 0.44
113 0.49
114 0.51
115 0.6
116 0.66
117 0.68
118 0.7
119 0.75
120 0.74
121 0.78
122 0.83
123 0.76
124 0.7
125 0.64
126 0.57
127 0.47
128 0.39
129 0.29
130 0.23
131 0.21
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.18
136 0.21
137 0.22
138 0.23
139 0.24
140 0.28
141 0.27
142 0.28
143 0.26
144 0.23
145 0.24
146 0.21
147 0.21
148 0.18
149 0.15
150 0.12
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.06
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.15
231 0.18
232 0.19
233 0.18
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.21
238 0.18
239 0.16
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.17
246 0.21
247 0.23
248 0.26
249 0.26
250 0.26
251 0.28
252 0.28
253 0.23
254 0.26
255 0.24
256 0.24
257 0.26
258 0.26
259 0.23
260 0.23
261 0.22
262 0.18
263 0.17
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.18
270 0.2
271 0.19
272 0.21
273 0.23
274 0.25
275 0.23
276 0.22
277 0.2
278 0.17
279 0.18
280 0.16
281 0.15
282 0.13
283 0.14
284 0.14
285 0.18
286 0.2
287 0.2
288 0.2
289 0.21
290 0.22
291 0.23
292 0.24
293 0.19
294 0.18
295 0.16
296 0.17
297 0.15
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.09
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.13
327 0.18
328 0.19
329 0.19
330 0.15
331 0.15
332 0.17
333 0.22
334 0.21
335 0.17
336 0.24
337 0.23
338 0.25
339 0.26
340 0.27
341 0.22
342 0.22
343 0.26
344 0.24
345 0.3
346 0.33
347 0.36
348 0.34
349 0.32
350 0.38
351 0.33
352 0.3
353 0.27
354 0.28
355 0.27
356 0.34
357 0.41
358 0.37
359 0.43
360 0.42
361 0.4
362 0.36
363 0.33
364 0.28
365 0.23
366 0.22
367 0.19
368 0.18
369 0.17
370 0.21
371 0.19
372 0.2
373 0.18
374 0.19
375 0.24
376 0.26
377 0.26
378 0.25
379 0.27
380 0.26
381 0.27
382 0.32
383 0.3
384 0.3
385 0.31
386 0.29
387 0.36
388 0.45
389 0.45
390 0.38
391 0.36
392 0.43
393 0.5
394 0.59
395 0.59
396 0.55
397 0.56
398 0.59
399 0.66
400 0.66
401 0.65
402 0.6
403 0.53
404 0.48
405 0.48
406 0.44
407 0.35
408 0.26
409 0.17
410 0.15
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.14
416 0.18
417 0.21
418 0.26
419 0.3
420 0.35
421 0.43
422 0.51
423 0.55
424 0.55
425 0.6
426 0.61
427 0.66
428 0.66
429 0.62
430 0.59
431 0.54
432 0.54
433 0.47
434 0.41
435 0.33
436 0.35
437 0.38
438 0.42