Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9N4B3

Protein Details
Accession A0A1L9N4B3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-189LYESMKREMKKKERKKKWEPYVRKTVPKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-180KREMKKKERKKKWE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MVPQVKQEPDSQTPYIKPDPYIKQDPDSKDTVLADIDDEDLYEDAGDLDFSAANQSVWLSRLPRSLWEHWAHLSNSAGDDDEEIQIGTMRIEGTQNDLKRVSLRINAREDNRDIPKDYLLQRQTITSENVSHLTQNTYLFTERDLPGHENRMVVFGEARSALYESMKREMKKKERKKKWEPYVRKTVPKQTALVGSVSEEFNCLPVENEEFRRLSEKKALEALKPKRETVFIDKIPGKMLQPRNALPGEKGAFVQATRPAKPKAQENKTTRMPQNELLDLIYQCFREYKYWPFKNLKARLRQPEAYLKQTLEMVAHLVKAGDFAMTWELKPEARESNYANAMYSDAKDELAPGDYNFEDGSEEEATPSGMMTDNDEGQFENVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.44
4 0.41
5 0.44
6 0.49
7 0.52
8 0.59
9 0.56
10 0.57
11 0.62
12 0.65
13 0.61
14 0.56
15 0.49
16 0.43
17 0.41
18 0.34
19 0.27
20 0.21
21 0.17
22 0.14
23 0.14
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.04
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.13
46 0.13
47 0.16
48 0.2
49 0.21
50 0.27
51 0.34
52 0.36
53 0.42
54 0.43
55 0.43
56 0.41
57 0.45
58 0.39
59 0.34
60 0.31
61 0.24
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.13
81 0.19
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.23
86 0.24
87 0.26
88 0.23
89 0.24
90 0.3
91 0.33
92 0.4
93 0.44
94 0.46
95 0.48
96 0.48
97 0.48
98 0.47
99 0.43
100 0.39
101 0.35
102 0.33
103 0.34
104 0.35
105 0.37
106 0.33
107 0.32
108 0.3
109 0.3
110 0.3
111 0.27
112 0.26
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.19
133 0.2
134 0.25
135 0.24
136 0.2
137 0.19
138 0.2
139 0.18
140 0.15
141 0.13
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.11
151 0.11
152 0.17
153 0.21
154 0.21
155 0.27
156 0.36
157 0.45
158 0.54
159 0.63
160 0.69
161 0.76
162 0.85
163 0.9
164 0.92
165 0.92
166 0.92
167 0.91
168 0.88
169 0.88
170 0.83
171 0.8
172 0.73
173 0.71
174 0.66
175 0.59
176 0.52
177 0.42
178 0.39
179 0.32
180 0.28
181 0.19
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.09
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.1
194 0.11
195 0.13
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.26
203 0.25
204 0.24
205 0.3
206 0.31
207 0.3
208 0.39
209 0.43
210 0.45
211 0.46
212 0.45
213 0.4
214 0.4
215 0.4
216 0.39
217 0.4
218 0.32
219 0.37
220 0.37
221 0.36
222 0.36
223 0.33
224 0.26
225 0.26
226 0.31
227 0.32
228 0.34
229 0.35
230 0.37
231 0.38
232 0.38
233 0.3
234 0.3
235 0.25
236 0.21
237 0.2
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.16
242 0.17
243 0.19
244 0.21
245 0.26
246 0.28
247 0.31
248 0.34
249 0.42
250 0.46
251 0.51
252 0.58
253 0.59
254 0.64
255 0.68
256 0.73
257 0.67
258 0.63
259 0.58
260 0.54
261 0.53
262 0.46
263 0.39
264 0.32
265 0.3
266 0.23
267 0.21
268 0.18
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.18
275 0.27
276 0.36
277 0.41
278 0.48
279 0.53
280 0.59
281 0.66
282 0.72
283 0.7
284 0.7
285 0.74
286 0.76
287 0.77
288 0.73
289 0.68
290 0.69
291 0.66
292 0.6
293 0.54
294 0.45
295 0.38
296 0.36
297 0.31
298 0.21
299 0.16
300 0.14
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.17
318 0.19
319 0.21
320 0.24
321 0.28
322 0.29
323 0.35
324 0.38
325 0.37
326 0.34
327 0.28
328 0.26
329 0.24
330 0.22
331 0.18
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.12
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.15
344 0.14
345 0.12
346 0.11
347 0.15
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.11
354 0.11
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.12
359 0.15
360 0.18
361 0.18
362 0.19
363 0.19