Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9NC56

Protein Details
Accession A0A1L9NC56    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
994-1021QSYPDKSTPSPKKSKSPVSAKKTTRSPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1005-1015KKSKSPVSAKK
1032-1042GLKKPAKRGAK
Subcellular Location(s) mito 11.5, mito_nucl 10.333, nucl 8, cyto_nucl 7.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022765  Dna2/Cas4_DUF83  
IPR026851  Dna2/JHS1_DEXXQ-box  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR041677  DNA2/NAM7_AAA_11  
IPR014808  DNA_replication_fac_Dna2_N  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR011604  PDDEXK-like_dom_sf  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017116  F:single-stranded DNA helicase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0033567  P:DNA replication, Okazaki fragment processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13086  AAA_11  
PF13087  AAA_12  
PF01930  Cas_Cas4  
PF08696  Dna2  
CDD cd18041  DEXXQc_DNA2  
cd22318  DNA2_N-like  
cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MRGRRKRKSSSFESPGHCIVDDSRNMVILHPDHLVSATVVADSISCQRRAVLQDRIKYTSDLGKAQVFGNIFHEVFQEAIKLNKWDTNSLRTLIEGVTVKRIEDLYLIRMTIPEAVEYIMSRIPGVQAWAERFLRVKPSAESLVEDRGSSKMSLSINKLLEVEEHIWSPMYGLKGNVDATVQVACHDGESDKNLIIPLELKTGNRDTNQAHRAQTALYTLLLSDRYDVECTFGLLYYLETTKIFRIRGIRHELLQMIQQRNRIVGYMRQRTHLPPMAKKSSFCNKCYSKTPCFIYHKLADDGDGETSGLGDDFVNAMDHLTSDDRDFFRKWDDLLTKEEKNMIRFKRELWTMLSSEREALGRCFGNVVIDPSSSYEDKDGPKINRYRYTFVKKQPHSSFSFTESQLTLGEPIVVSDEKGHFALANGYVVQVSRRHITVAVDRRLHNARTRARGFDAERNQSFRGIMEILEDGASPSPAESDEEPVYRLDKDEFSNGMAIVRTNLVSMMERDLFQARQLRRLIVQREAPAFKTTASAYTLSESDKAALNVDQRQAIDKVMRAEDYALVLGMPGTGKTTTIAHIIRALVAQGKSVLLTSYTHTAVDNILLKIKDDNFRILRIGAPAKVHPDVQQFADLAAVPKTTMEELKASYEDSQVVATTCLGVSHGIFSQRMFDYCIVDEASQITLPVCLGPIRMARTFILVGDHYQLPPLVQNKEAQEGGLDVSLFKLLSDSHPESVVNLEHQYRMCEDIMLLSNTLIYSGRLKCGTADVAVRSLNIPNIGGLKQHHPSTFPQPHSQRQVCLGTSQGRCWLKDLVEPSAKTRLVNTDTLSIPALDVANGSRIVNPTEATICSRLVEAFISSGIPARSIGVIALYRSQLSLLKQNLSRYLPDLEMHTADKFQGRDKEVIILSCVRSNADKNVGDLLRDWRRVNVAFTRARTKLLVVGSKSTLRDGNELLGKYVKLVQERGWIYDLPRDAMTDHIFESEMVPSQSYPDKSTPSPKKSKSPVSAKKTTRSPFGPVQTRLSPTGLKKPAKRGAKLMSGGRVLGNRPVLQDMVNDLIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.67
3 0.59
4 0.49
5 0.4
6 0.35
7 0.35
8 0.31
9 0.29
10 0.26
11 0.27
12 0.27
13 0.27
14 0.29
15 0.22
16 0.23
17 0.21
18 0.21
19 0.18
20 0.18
21 0.18
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.08
30 0.15
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.26
36 0.33
37 0.38
38 0.41
39 0.44
40 0.51
41 0.56
42 0.6
43 0.56
44 0.51
45 0.47
46 0.44
47 0.41
48 0.36
49 0.33
50 0.32
51 0.32
52 0.31
53 0.31
54 0.24
55 0.21
56 0.22
57 0.23
58 0.2
59 0.19
60 0.19
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.11
66 0.13
67 0.16
68 0.17
69 0.19
70 0.22
71 0.24
72 0.29
73 0.33
74 0.37
75 0.38
76 0.38
77 0.37
78 0.34
79 0.33
80 0.25
81 0.25
82 0.22
83 0.19
84 0.24
85 0.24
86 0.23
87 0.24
88 0.24
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.18
93 0.2
94 0.2
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.16
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.18
116 0.24
117 0.24
118 0.25
119 0.26
120 0.26
121 0.31
122 0.3
123 0.3
124 0.26
125 0.31
126 0.33
127 0.33
128 0.34
129 0.29
130 0.32
131 0.3
132 0.28
133 0.23
134 0.21
135 0.21
136 0.18
137 0.16
138 0.15
139 0.18
140 0.22
141 0.26
142 0.32
143 0.31
144 0.32
145 0.32
146 0.27
147 0.25
148 0.25
149 0.22
150 0.17
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.2
189 0.24
190 0.28
191 0.27
192 0.3
193 0.28
194 0.36
195 0.41
196 0.4
197 0.38
198 0.35
199 0.34
200 0.3
201 0.28
202 0.21
203 0.16
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.14
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.26
233 0.3
234 0.38
235 0.46
236 0.44
237 0.42
238 0.44
239 0.42
240 0.35
241 0.36
242 0.35
243 0.32
244 0.33
245 0.34
246 0.32
247 0.33
248 0.32
249 0.28
250 0.23
251 0.24
252 0.31
253 0.37
254 0.38
255 0.39
256 0.41
257 0.42
258 0.48
259 0.48
260 0.44
261 0.42
262 0.49
263 0.55
264 0.54
265 0.53
266 0.52
267 0.56
268 0.56
269 0.51
270 0.52
271 0.49
272 0.52
273 0.6
274 0.6
275 0.56
276 0.56
277 0.59
278 0.59
279 0.61
280 0.59
281 0.57
282 0.54
283 0.51
284 0.47
285 0.42
286 0.33
287 0.27
288 0.25
289 0.19
290 0.14
291 0.1
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.12
311 0.13
312 0.16
313 0.17
314 0.17
315 0.2
316 0.21
317 0.21
318 0.24
319 0.27
320 0.26
321 0.31
322 0.36
323 0.32
324 0.32
325 0.37
326 0.32
327 0.33
328 0.38
329 0.36
330 0.36
331 0.36
332 0.37
333 0.38
334 0.38
335 0.36
336 0.32
337 0.32
338 0.28
339 0.29
340 0.29
341 0.22
342 0.21
343 0.19
344 0.16
345 0.13
346 0.12
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.14
364 0.16
365 0.2
366 0.25
367 0.24
368 0.32
369 0.37
370 0.42
371 0.47
372 0.49
373 0.5
374 0.52
375 0.59
376 0.59
377 0.62
378 0.67
379 0.62
380 0.67
381 0.68
382 0.65
383 0.6
384 0.57
385 0.5
386 0.44
387 0.46
388 0.36
389 0.33
390 0.27
391 0.23
392 0.19
393 0.17
394 0.13
395 0.08
396 0.08
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.07
408 0.08
409 0.1
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.14
424 0.21
425 0.28
426 0.32
427 0.34
428 0.35
429 0.38
430 0.41
431 0.41
432 0.37
433 0.37
434 0.37
435 0.42
436 0.43
437 0.42
438 0.4
439 0.43
440 0.42
441 0.42
442 0.43
443 0.42
444 0.41
445 0.42
446 0.41
447 0.36
448 0.33
449 0.24
450 0.19
451 0.12
452 0.11
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.06
466 0.06
467 0.09
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.1
476 0.11
477 0.11
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.11
484 0.1
485 0.08
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.1
498 0.11
499 0.1
500 0.12
501 0.19
502 0.17
503 0.23
504 0.23
505 0.23
506 0.25
507 0.31
508 0.31
509 0.28
510 0.31
511 0.28
512 0.31
513 0.31
514 0.29
515 0.24
516 0.22
517 0.18
518 0.16
519 0.13
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.11
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.09
534 0.11
535 0.13
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.13
543 0.12
544 0.14
545 0.13
546 0.13
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.08
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.04
556 0.04
557 0.03
558 0.03
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.06
564 0.07
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.07
579 0.08
580 0.07
581 0.05
582 0.06
583 0.07
584 0.09
585 0.09
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.09
590 0.11
591 0.12
592 0.1
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.14
597 0.17
598 0.19
599 0.18
600 0.23
601 0.22
602 0.23
603 0.23
604 0.22
605 0.2
606 0.19
607 0.19
608 0.15
609 0.16
610 0.15
611 0.18
612 0.18
613 0.18
614 0.18
615 0.2
616 0.19
617 0.19
618 0.19
619 0.16
620 0.15
621 0.15
622 0.12
623 0.09
624 0.08
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.09
634 0.11
635 0.11
636 0.11
637 0.12
638 0.12
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.06
646 0.06
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.06
653 0.07
654 0.08
655 0.09
656 0.09
657 0.12
658 0.12
659 0.13
660 0.14
661 0.14
662 0.14
663 0.14
664 0.15
665 0.13
666 0.12
667 0.12
668 0.1
669 0.1
670 0.08
671 0.08
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.04
678 0.05
679 0.07
680 0.1
681 0.13
682 0.14
683 0.16
684 0.15
685 0.17
686 0.17
687 0.15
688 0.15
689 0.12
690 0.12
691 0.13
692 0.14
693 0.12
694 0.12
695 0.12
696 0.1
697 0.13
698 0.16
699 0.14
700 0.15
701 0.18
702 0.19
703 0.23
704 0.22
705 0.19
706 0.15
707 0.14
708 0.13
709 0.11
710 0.09
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.07
719 0.15
720 0.17
721 0.17
722 0.18
723 0.18
724 0.18
725 0.19
726 0.18
727 0.13
728 0.12
729 0.13
730 0.14
731 0.15
732 0.16
733 0.15
734 0.17
735 0.15
736 0.13
737 0.12
738 0.13
739 0.15
740 0.15
741 0.14
742 0.11
743 0.11
744 0.1
745 0.11
746 0.08
747 0.06
748 0.11
749 0.12
750 0.15
751 0.15
752 0.16
753 0.16
754 0.18
755 0.18
756 0.15
757 0.16
758 0.14
759 0.16
760 0.16
761 0.16
762 0.14
763 0.14
764 0.13
765 0.11
766 0.1
767 0.09
768 0.11
769 0.11
770 0.12
771 0.14
772 0.17
773 0.2
774 0.24
775 0.23
776 0.24
777 0.27
778 0.36
779 0.42
780 0.41
781 0.47
782 0.5
783 0.57
784 0.64
785 0.63
786 0.54
787 0.51
788 0.52
789 0.43
790 0.38
791 0.34
792 0.33
793 0.32
794 0.31
795 0.34
796 0.32
797 0.31
798 0.33
799 0.32
800 0.25
801 0.28
802 0.3
803 0.28
804 0.32
805 0.32
806 0.33
807 0.37
808 0.37
809 0.33
810 0.32
811 0.31
812 0.29
813 0.31
814 0.3
815 0.27
816 0.27
817 0.28
818 0.27
819 0.2
820 0.16
821 0.14
822 0.12
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.08
827 0.09
828 0.1
829 0.11
830 0.12
831 0.13
832 0.14
833 0.14
834 0.13
835 0.15
836 0.15
837 0.17
838 0.17
839 0.16
840 0.15
841 0.16
842 0.14
843 0.13
844 0.12
845 0.1
846 0.08
847 0.08
848 0.08
849 0.07
850 0.1
851 0.1
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.09
858 0.08
859 0.09
860 0.1
861 0.12
862 0.12
863 0.12
864 0.12
865 0.13
866 0.13
867 0.15
868 0.22
869 0.22
870 0.28
871 0.3
872 0.34
873 0.38
874 0.38
875 0.37
876 0.33
877 0.33
878 0.28
879 0.26
880 0.26
881 0.23
882 0.23
883 0.23
884 0.2
885 0.18
886 0.18
887 0.21
888 0.19
889 0.22
890 0.28
891 0.3
892 0.31
893 0.32
894 0.37
895 0.34
896 0.34
897 0.3
898 0.27
899 0.25
900 0.25
901 0.24
902 0.2
903 0.21
904 0.23
905 0.26
906 0.3
907 0.29
908 0.28
909 0.35
910 0.34
911 0.32
912 0.31
913 0.35
914 0.35
915 0.38
916 0.38
917 0.33
918 0.38
919 0.39
920 0.42
921 0.4
922 0.4
923 0.42
924 0.45
925 0.5
926 0.46
927 0.47
928 0.43
929 0.37
930 0.34
931 0.35
932 0.37
933 0.32
934 0.35
935 0.35
936 0.39
937 0.38
938 0.35
939 0.32
940 0.28
941 0.29
942 0.26
943 0.28
944 0.3
945 0.29
946 0.28
947 0.28
948 0.25
949 0.23
950 0.27
951 0.25
952 0.23
953 0.25
954 0.26
955 0.32
956 0.34
957 0.35
958 0.33
959 0.31
960 0.29
961 0.33
962 0.32
963 0.25
964 0.24
965 0.22
966 0.2
967 0.23
968 0.24
969 0.2
970 0.19
971 0.17
972 0.17
973 0.17
974 0.17
975 0.14
976 0.14
977 0.13
978 0.13
979 0.12
980 0.15
981 0.22
982 0.23
983 0.26
984 0.27
985 0.32
986 0.35
987 0.46
988 0.53
989 0.57
990 0.65
991 0.67
992 0.73
993 0.77
994 0.83
995 0.83
996 0.83
997 0.84
998 0.83
999 0.87
1000 0.83
1001 0.82
1002 0.81
1003 0.76
1004 0.73
1005 0.66
1006 0.64
1007 0.63
1008 0.66
1009 0.67
1010 0.61
1011 0.63
1012 0.6
1013 0.6
1014 0.56
1015 0.51
1016 0.47
1017 0.43
1018 0.49
1019 0.52
1020 0.55
1021 0.57
1022 0.65
1023 0.71
1024 0.74
1025 0.73
1026 0.72
1027 0.7
1028 0.71
1029 0.71
1030 0.66
1031 0.63
1032 0.56
1033 0.52
1034 0.46
1035 0.41
1036 0.34
1037 0.34
1038 0.34
1039 0.29
1040 0.29
1041 0.3
1042 0.28
1043 0.26
1044 0.25
1045 0.23