Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VDX2

Protein Details
Accession A0A1L9VDX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-399ELERSRPSRGHKRRYDDNSFIHydrophilic
414-440FYSNSEGIGKKKRKKDHVPKVSTPLSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-430GKKKRKKDH
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSDRASSATFRVGFPSPSSPSVGYLKENDQPYISSDHFPQTPTSPPLMSVSAQSHATHFAPSQTSPRQATSQSADYSSLPSSDPMSSQVSQQPTLSSTTTSFPTPASSVSGHLVDADKSTGTGMQESGSTAMANADAALTQTPPQHTRTDHDRDMGGTDPGSGVRNSANTDAMEIDNNDNSGSSNNGGAASLENNGFSLNSLQREFTSAYHLCKSSHVVTGPDPSLDLVSLYGLGPAARSVARIDPVTGDKINRLRKSYEGKLKGLGLAGRNKPVKNEPSMPGSLRHLTMWPEEEWQNQKVFGKQIKVADMDSALQQLQMKAVKLEPGTVPNNDYWEDVLGHEKPSKHTGAGDSGKKTAAPSGGVRAPSQPNGSPASAELERSRPSRGHKRRYDDNSFIGYGEGYADDDDEGAFYSNSEGIGKKKRKKDHVPKVSTPLSERRGNGMFGIGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.31
4 0.31
5 0.34
6 0.31
7 0.32
8 0.35
9 0.33
10 0.3
11 0.3
12 0.33
13 0.35
14 0.37
15 0.34
16 0.31
17 0.29
18 0.28
19 0.3
20 0.28
21 0.24
22 0.25
23 0.29
24 0.29
25 0.29
26 0.29
27 0.26
28 0.3
29 0.32
30 0.33
31 0.28
32 0.28
33 0.3
34 0.29
35 0.27
36 0.24
37 0.23
38 0.22
39 0.23
40 0.23
41 0.21
42 0.22
43 0.22
44 0.2
45 0.18
46 0.19
47 0.2
48 0.21
49 0.27
50 0.29
51 0.34
52 0.35
53 0.37
54 0.37
55 0.36
56 0.4
57 0.38
58 0.38
59 0.34
60 0.33
61 0.31
62 0.28
63 0.29
64 0.25
65 0.2
66 0.15
67 0.14
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.19
73 0.18
74 0.21
75 0.26
76 0.27
77 0.27
78 0.27
79 0.25
80 0.21
81 0.24
82 0.21
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.14
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.07
128 0.09
129 0.12
130 0.14
131 0.17
132 0.2
133 0.21
134 0.26
135 0.33
136 0.38
137 0.38
138 0.37
139 0.35
140 0.32
141 0.33
142 0.29
143 0.21
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.18
195 0.17
196 0.19
197 0.21
198 0.22
199 0.2
200 0.2
201 0.23
202 0.18
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.2
208 0.19
209 0.15
210 0.13
211 0.11
212 0.1
213 0.08
214 0.07
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.15
238 0.22
239 0.29
240 0.3
241 0.31
242 0.31
243 0.36
244 0.42
245 0.47
246 0.5
247 0.47
248 0.45
249 0.45
250 0.44
251 0.39
252 0.33
253 0.27
254 0.21
255 0.23
256 0.24
257 0.28
258 0.31
259 0.3
260 0.32
261 0.36
262 0.37
263 0.35
264 0.38
265 0.34
266 0.36
267 0.38
268 0.36
269 0.32
270 0.32
271 0.28
272 0.23
273 0.22
274 0.18
275 0.17
276 0.18
277 0.19
278 0.16
279 0.17
280 0.18
281 0.21
282 0.24
283 0.24
284 0.23
285 0.23
286 0.23
287 0.23
288 0.28
289 0.28
290 0.27
291 0.29
292 0.31
293 0.32
294 0.32
295 0.29
296 0.24
297 0.21
298 0.18
299 0.14
300 0.13
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.14
310 0.16
311 0.16
312 0.18
313 0.16
314 0.2
315 0.22
316 0.22
317 0.23
318 0.2
319 0.23
320 0.21
321 0.2
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.16
327 0.15
328 0.16
329 0.19
330 0.2
331 0.22
332 0.26
333 0.27
334 0.24
335 0.25
336 0.25
337 0.3
338 0.36
339 0.38
340 0.36
341 0.36
342 0.35
343 0.33
344 0.31
345 0.26
346 0.2
347 0.18
348 0.17
349 0.22
350 0.25
351 0.26
352 0.26
353 0.28
354 0.3
355 0.31
356 0.33
357 0.28
358 0.28
359 0.31
360 0.3
361 0.25
362 0.23
363 0.25
364 0.22
365 0.23
366 0.22
367 0.22
368 0.26
369 0.27
370 0.3
371 0.28
372 0.36
373 0.46
374 0.54
375 0.6
376 0.65
377 0.72
378 0.79
379 0.84
380 0.84
381 0.79
382 0.74
383 0.68
384 0.6
385 0.52
386 0.41
387 0.32
388 0.23
389 0.17
390 0.12
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.12
407 0.17
408 0.28
409 0.38
410 0.46
411 0.55
412 0.64
413 0.73
414 0.83
415 0.88
416 0.89
417 0.9
418 0.91
419 0.89
420 0.88
421 0.83
422 0.75
423 0.7
424 0.67
425 0.62
426 0.59
427 0.53
428 0.51
429 0.48
430 0.45
431 0.4
432 0.33