Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VDZ5

Protein Details
Accession A0A1L9VDZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-318LKAYPPPVAEKKQKKVKDKGSRYPGANKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-309KKQKKVKDKG
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5, mito 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
Amino Acid Sequences MGKGGAAPRSLTEPARGIQERPEWPLGNASRLWELPQQDDLMLNYWIQDAKWSCFWLTHAFLENLKAPIELVENRAKYYQKFITAILEAVGVSTDKLEVVLGGSYQKSPNYIMDVYRLSSLVSELDAKKAGAEILKQSSNARLSGLLYPILQVLDEEYLRADTELGGMDQRKLFMAATEWFPKLGYRTRANLITPMVAGLSGGKMSSSDQTRSTSSTLLRPFPRKSLKQRRLLELSKNSLIALVEFIFLSAAALEDQKEFQAERKDTEPLIYTDIKQLKDDYTNDIEITLKAYPPPVAEKKQKKVKDKGSRYPGANKEQDIAGRSNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.33
3 0.33
4 0.3
5 0.34
6 0.4
7 0.4
8 0.43
9 0.47
10 0.4
11 0.39
12 0.47
13 0.41
14 0.38
15 0.35
16 0.31
17 0.29
18 0.28
19 0.31
20 0.27
21 0.27
22 0.26
23 0.28
24 0.26
25 0.23
26 0.24
27 0.21
28 0.19
29 0.17
30 0.14
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.1
35 0.16
36 0.16
37 0.19
38 0.22
39 0.24
40 0.23
41 0.23
42 0.26
43 0.25
44 0.26
45 0.25
46 0.26
47 0.26
48 0.26
49 0.28
50 0.28
51 0.24
52 0.21
53 0.18
54 0.14
55 0.13
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.22
60 0.23
61 0.24
62 0.27
63 0.29
64 0.26
65 0.32
66 0.31
67 0.29
68 0.3
69 0.29
70 0.29
71 0.28
72 0.27
73 0.2
74 0.16
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.06
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.12
106 0.1
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.1
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.18
126 0.19
127 0.18
128 0.15
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.19
172 0.21
173 0.22
174 0.25
175 0.28
176 0.3
177 0.3
178 0.3
179 0.25
180 0.2
181 0.17
182 0.14
183 0.1
184 0.08
185 0.07
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.09
194 0.11
195 0.13
196 0.15
197 0.18
198 0.19
199 0.21
200 0.22
201 0.2
202 0.19
203 0.24
204 0.25
205 0.29
206 0.33
207 0.37
208 0.38
209 0.44
210 0.51
211 0.53
212 0.61
213 0.67
214 0.7
215 0.75
216 0.78
217 0.77
218 0.76
219 0.73
220 0.71
221 0.67
222 0.64
223 0.55
224 0.5
225 0.42
226 0.35
227 0.3
228 0.21
229 0.15
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.13
248 0.22
249 0.23
250 0.25
251 0.28
252 0.3
253 0.29
254 0.31
255 0.29
256 0.22
257 0.25
258 0.24
259 0.23
260 0.28
261 0.33
262 0.31
263 0.3
264 0.3
265 0.28
266 0.32
267 0.32
268 0.31
269 0.3
270 0.31
271 0.29
272 0.28
273 0.26
274 0.2
275 0.21
276 0.16
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.15
282 0.24
283 0.29
284 0.36
285 0.46
286 0.55
287 0.64
288 0.73
289 0.8
290 0.81
291 0.84
292 0.87
293 0.87
294 0.88
295 0.88
296 0.88
297 0.87
298 0.83
299 0.82
300 0.79
301 0.77
302 0.73
303 0.64
304 0.56
305 0.51
306 0.49
307 0.43