FuNGI

A0A1L9VTA1

Protein Details

Accession

A0A1L9VTA1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
450-472	TSAQVKRKGVKMKRGKHGNETIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
455-465	KRKGVKMKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKWIDKKNAATYQLFHRSQHDPLIHDPQADDRILHQIGGPALPPSDAAKRAKNLHDLQDEFGSDAVRKNEGEAANYGIFYDDTKYDYMQHLRELGTGGGEAHFVEASSKDNNNNNNNNNNKGKNKGMKLEDALRQVSLDDGQSTAGGRSAYGSQYGDMRSTASSFVRKPTYQDQQNVPDSIAGFKPDMDPRLREALEALEDEEFVDEEDENVFGELTKTAEEMEPGEWEDTLFDVEEEDEDDGWGSDATEKAPVQTDTTDIADIDDTDAGPGELPDLNEPIPDQHPEDQSWMREFAKFKKDAKSKPAGAPAAPPSVVPSEQRSTLASTVFTAGGTPVHRKKRKGAMTNPSAYSMSSSAIARTEGHRLLDDRFEKVEALYALDEEDEEDFDDSMSMASGMTGMTGMTGISTASSQAPNLVQANGTEVPPAHSFNNIMDDFLSGWDNNTSAQVKRKGVKMKRGKHGNETIGMKMLDEVRQGLGPAKLNGKVPGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.64
3	0.63
4	0.57
5	0.48
6	0.46
7	0.44
8	0.45
9	0.49
10	0.43
11	0.37
12	0.4
13	0.48
14	0.44
15	0.41
16	0.39
17	0.35
18	0.36
19	0.33
20	0.28
21	0.2
22	0.25
23	0.25
24	0.24
25	0.2
26	0.19
27	0.2
28	0.2
29	0.19
30	0.13
31	0.13
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.17
36	0.22
37	0.26
38	0.31
39	0.37
40	0.44
41	0.48
42	0.54
43	0.54
44	0.57
45	0.61
46	0.57
47	0.53
48	0.49
49	0.44
50	0.36
51	0.31
52	0.23
53	0.16
54	0.18
55	0.17
56	0.16
57	0.16
58	0.17
59	0.23
60	0.22
61	0.24
62	0.21
63	0.24
64	0.22
65	0.22
66	0.21
67	0.15
68	0.14
69	0.12
70	0.13
71	0.09
72	0.11
73	0.12
74	0.13
75	0.15
76	0.2
77	0.24
78	0.23
79	0.25
80	0.25
81	0.25
82	0.25
83	0.24
84	0.19
85	0.14
86	0.13
87	0.11
88	0.09
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.07
96	0.09
97	0.12
98	0.14
99	0.19
100	0.24
101	0.32
102	0.39
103	0.47
104	0.5
105	0.55
106	0.57
107	0.6
108	0.61
109	0.6
110	0.56
111	0.52
112	0.55
113	0.55
114	0.56
115	0.56
116	0.53
117	0.51
118	0.52
119	0.54
120	0.5
121	0.45
122	0.41
123	0.33
124	0.3
125	0.25
126	0.21
127	0.16
128	0.11
129	0.08
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.08
134	0.07
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.09
140	0.09
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.13
145	0.13
146	0.13
147	0.11
148	0.12
149	0.1
150	0.11
151	0.12
152	0.12
153	0.15
154	0.15
155	0.2
156	0.24
157	0.24
158	0.28
159	0.34
160	0.41
161	0.44
162	0.48
163	0.49
164	0.51
165	0.53
166	0.49
167	0.42
168	0.34
169	0.28
170	0.24
171	0.19
172	0.13
173	0.1
174	0.1
175	0.13
176	0.14
177	0.17
178	0.17
179	0.18
180	0.2
181	0.26
182	0.25
183	0.22
184	0.2
185	0.18
186	0.17
187	0.16
188	0.14
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.06
194	0.04
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.1
248	0.11
249	0.1
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.12
274	0.15
275	0.17
276	0.17
277	0.22
278	0.21
279	0.22
280	0.22
281	0.22
282	0.19
283	0.21
284	0.23
285	0.25
286	0.32
287	0.35
288	0.37
289	0.44
290	0.51
291	0.53
292	0.59
293	0.6
294	0.57
295	0.56
296	0.6
297	0.52
298	0.45
299	0.43
300	0.38
301	0.32
302	0.28
303	0.23
304	0.17
305	0.18
306	0.18
307	0.16
308	0.17
309	0.17
310	0.18
311	0.19
312	0.18
313	0.19
314	0.19
315	0.19
316	0.14
317	0.13
318	0.13
319	0.12
320	0.11
321	0.09
322	0.07
323	0.09
324	0.1
325	0.16
326	0.22
327	0.33
328	0.38
329	0.41
330	0.49
331	0.57
332	0.65
333	0.68
334	0.7
335	0.7
336	0.73
337	0.76
338	0.69
339	0.61
340	0.52
341	0.42
342	0.35
343	0.25
344	0.17
345	0.13
346	0.12
347	0.1
348	0.11
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.17
353	0.17
354	0.17
355	0.19
356	0.19
357	0.21
358	0.27
359	0.27
360	0.24
361	0.24
362	0.24
363	0.22
364	0.21
365	0.22
366	0.15
367	0.15
368	0.13
369	0.11
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.11
405	0.11
406	0.14
407	0.16
408	0.15
409	0.13
410	0.13
411	0.18
412	0.17
413	0.17
414	0.15
415	0.14
416	0.17
417	0.18
418	0.21
419	0.16
420	0.17
421	0.18
422	0.18
423	0.25
424	0.22
425	0.2
426	0.18
427	0.18
428	0.17
429	0.17
430	0.18
431	0.1
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.15
437	0.17
438	0.18
439	0.27
440	0.33
441	0.39
442	0.44
443	0.51
444	0.57
445	0.63
446	0.7
447	0.73
448	0.75
449	0.79
450	0.85
451	0.83
452	0.82
453	0.83
454	0.77
455	0.74
456	0.68
457	0.59
458	0.53
459	0.47
460	0.38
461	0.31
462	0.28
463	0.23
464	0.21
465	0.2
466	0.17
467	0.18
468	0.19
469	0.19
470	0.21
471	0.22
472	0.25
473	0.28
474	0.29
475	0.31
476	0.37

A0A1L9VTA1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer