Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VCK2

Protein Details
Accession A0A1L9VCK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-56EENGTYENHRPRKRTKQTAEDLKASLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
558-592RGRGQQQGRGAPRGNGRGGPQRGGGQQRGRGQPAS
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MADSLASTLAKLNLNAQQSSGSVFDARLTEEENGTYENHRPRKRTKQTAEDLKASLEAEFLTPSSRFSTEWLNHLQRRWDVPADYTDLFEIAPTQTRTITRFDREGLEGRVTGYHEVTVPATSANAKNSTSLLRRPAGRADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAEYETETQNAEQSRAGGKQPGLDRIINFGAEGGLLEIAPGFSRGLKFDEAKTKETTEGDKEVEHALLQEESNLHVEQKEEELSEDEGGVKVEDEELDEEEDIDSLLPVEFPALEPRAPLLAGAQKKVGREWAHVVDVNKDIPNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLESGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAISLAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNEFEDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTQEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLWAGKDKHKIVDSNKRFIESGWKDADEIISGRDKLKAQKAAEAQAQSQAQRGGAQGRGRGQQQGRGAPRGNGRGGPQRGGGQQRGRGQPASRGTGNIARTGRGGGRTSAAQDKTIWVHLVSHLSKENLLPGCIFVFSKKRCEDNADSLSNQDFCNASEKSLIHMFIEKSLTRLKPEDRSLPQILRLRDLLSRGVAVHHGGLLPIMKEIVEILFARSLVKILFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKSFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVIIVNAGRDEAPPAGALRKMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLAKIKREPCGICDIDLETCHRAAMEYEKLTDELHVGLLASPVGKRLFMLKRLIVYRKDGIRTAGVIVREGVSGGATPTVQVLEIGTISTKRHPSDILPFLPGFRHLLQSLPQRAAQMTLKVCKIPLTDVECLTNTMVKTGGPIWYLNIKKEAIKFADKELSKLCSSWTSPVWDELDWTRIKELQVRDILEKRQEQATVSQTCRCLECPNFLKHFEMQHDEWQVKENITQLKQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLKDLEFVDDQSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLADYEPEEIVALLSAFVFQEKTEHVPTLTPRLEKGKEAIVRISEKVNDFQVQHQVIQSSEDSNDFASQPRFGLAEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTISRLDETCREVKNAAKLVGDPSLYTKMQQAQEQIKRDVIFAASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.26
4 0.24
5 0.23
6 0.24
7 0.21
8 0.17
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.23
24 0.31
25 0.4
26 0.46
27 0.51
28 0.6
29 0.7
30 0.78
31 0.82
32 0.82
33 0.83
34 0.87
35 0.92
36 0.88
37 0.82
38 0.72
39 0.62
40 0.54
41 0.44
42 0.33
43 0.22
44 0.16
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.27
56 0.27
57 0.32
58 0.4
59 0.45
60 0.48
61 0.52
62 0.56
63 0.51
64 0.54
65 0.54
66 0.5
67 0.43
68 0.42
69 0.42
70 0.41
71 0.37
72 0.32
73 0.27
74 0.22
75 0.2
76 0.16
77 0.14
78 0.1
79 0.15
80 0.16
81 0.17
82 0.2
83 0.23
84 0.25
85 0.3
86 0.35
87 0.35
88 0.37
89 0.38
90 0.39
91 0.4
92 0.43
93 0.4
94 0.36
95 0.31
96 0.29
97 0.28
98 0.26
99 0.24
100 0.19
101 0.17
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.11
109 0.14
110 0.15
111 0.18
112 0.2
113 0.2
114 0.21
115 0.23
116 0.28
117 0.29
118 0.32
119 0.35
120 0.37
121 0.4
122 0.42
123 0.48
124 0.46
125 0.47
126 0.44
127 0.45
128 0.44
129 0.41
130 0.4
131 0.32
132 0.29
133 0.23
134 0.21
135 0.15
136 0.11
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.09
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.13
162 0.15
163 0.19
164 0.2
165 0.22
166 0.23
167 0.22
168 0.27
169 0.3
170 0.34
171 0.34
172 0.34
173 0.32
174 0.33
175 0.34
176 0.27
177 0.24
178 0.18
179 0.14
180 0.11
181 0.11
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.13
195 0.17
196 0.19
197 0.24
198 0.34
199 0.36
200 0.38
201 0.4
202 0.39
203 0.38
204 0.38
205 0.37
206 0.32
207 0.32
208 0.3
209 0.27
210 0.27
211 0.25
212 0.23
213 0.18
214 0.14
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.16
271 0.18
272 0.2
273 0.23
274 0.24
275 0.25
276 0.27
277 0.31
278 0.26
279 0.28
280 0.32
281 0.31
282 0.33
283 0.35
284 0.35
285 0.31
286 0.3
287 0.29
288 0.24
289 0.21
290 0.19
291 0.18
292 0.19
293 0.17
294 0.16
295 0.19
296 0.19
297 0.24
298 0.24
299 0.24
300 0.23
301 0.28
302 0.27
303 0.22
304 0.23
305 0.19
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.15
310 0.17
311 0.19
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.18
318 0.15
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.08
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.13
354 0.15
355 0.2
356 0.21
357 0.23
358 0.23
359 0.26
360 0.26
361 0.3
362 0.38
363 0.38
364 0.47
365 0.47
366 0.52
367 0.54
368 0.55
369 0.6
370 0.54
371 0.48
372 0.45
373 0.45
374 0.38
375 0.33
376 0.32
377 0.21
378 0.19
379 0.15
380 0.08
381 0.06
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.09
419 0.07
420 0.06
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.09
428 0.09
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.06
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.11
462 0.12
463 0.12
464 0.17
465 0.24
466 0.29
467 0.32
468 0.36
469 0.39
470 0.4
471 0.45
472 0.42
473 0.41
474 0.44
475 0.47
476 0.44
477 0.43
478 0.41
479 0.37
480 0.37
481 0.31
482 0.25
483 0.25
484 0.27
485 0.25
486 0.24
487 0.26
488 0.24
489 0.24
490 0.26
491 0.23
492 0.22
493 0.26
494 0.26
495 0.27
496 0.29
497 0.33
498 0.36
499 0.45
500 0.47
501 0.48
502 0.47
503 0.45
504 0.42
505 0.38
506 0.41
507 0.32
508 0.33
509 0.27
510 0.27
511 0.26
512 0.26
513 0.26
514 0.16
515 0.13
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.13
521 0.14
522 0.18
523 0.25
524 0.3
525 0.28
526 0.33
527 0.35
528 0.36
529 0.38
530 0.34
531 0.28
532 0.26
533 0.26
534 0.21
535 0.2
536 0.17
537 0.14
538 0.13
539 0.13
540 0.11
541 0.14
542 0.15
543 0.16
544 0.18
545 0.21
546 0.21
547 0.26
548 0.24
549 0.26
550 0.28
551 0.32
552 0.32
553 0.33
554 0.34
555 0.31
556 0.34
557 0.33
558 0.31
559 0.25
560 0.26
561 0.3
562 0.31
563 0.28
564 0.26
565 0.24
566 0.27
567 0.3
568 0.32
569 0.26
570 0.3
571 0.35
572 0.37
573 0.36
574 0.35
575 0.32
576 0.33
577 0.33
578 0.32
579 0.26
580 0.24
581 0.24
582 0.26
583 0.26
584 0.25
585 0.22
586 0.18
587 0.18
588 0.19
589 0.18
590 0.16
591 0.16
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.14
596 0.18
597 0.17
598 0.16
599 0.15
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.15
604 0.09
605 0.09
606 0.1
607 0.15
608 0.14
609 0.14
610 0.15
611 0.15
612 0.15
613 0.14
614 0.18
615 0.13
616 0.13
617 0.11
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.08
623 0.14
624 0.15
625 0.22
626 0.24
627 0.26
628 0.26
629 0.33
630 0.35
631 0.36
632 0.4
633 0.35
634 0.33
635 0.32
636 0.31
637 0.26
638 0.21
639 0.14
640 0.09
641 0.08
642 0.13
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.14
647 0.15
648 0.16
649 0.16
650 0.12
651 0.14
652 0.14
653 0.13
654 0.15
655 0.13
656 0.13
657 0.18
658 0.18
659 0.17
660 0.2
661 0.21
662 0.24
663 0.28
664 0.33
665 0.31
666 0.37
667 0.38
668 0.36
669 0.39
670 0.38
671 0.36
672 0.3
673 0.28
674 0.23
675 0.22
676 0.22
677 0.17
678 0.12
679 0.12
680 0.1
681 0.1
682 0.09
683 0.08
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.07
710 0.06
711 0.08
712 0.07
713 0.08
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.06
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.08
727 0.1
728 0.12
729 0.18
730 0.19
731 0.24
732 0.25
733 0.25
734 0.29
735 0.32
736 0.32
737 0.33
738 0.36
739 0.32
740 0.35
741 0.35
742 0.32
743 0.3
744 0.27
745 0.22
746 0.18
747 0.17
748 0.13
749 0.13
750 0.11
751 0.08
752 0.09
753 0.11
754 0.11
755 0.12
756 0.12
757 0.12
758 0.12
759 0.12
760 0.11
761 0.09
762 0.09
763 0.08
764 0.07
765 0.06
766 0.07
767 0.06
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.07
774 0.05
775 0.06
776 0.06
777 0.07
778 0.08
779 0.08
780 0.08
781 0.07
782 0.08
783 0.09
784 0.09
785 0.13
786 0.13
787 0.16
788 0.18
789 0.21
790 0.23
791 0.25
792 0.26
793 0.25
794 0.28
795 0.32
796 0.32
797 0.37
798 0.36
799 0.38
800 0.38
801 0.36
802 0.32
803 0.25
804 0.22
805 0.15
806 0.13
807 0.09
808 0.07
809 0.06
810 0.05
811 0.06
812 0.06
813 0.07
814 0.09
815 0.11
816 0.13
817 0.14
818 0.14
819 0.15
820 0.16
821 0.18
822 0.17
823 0.2
824 0.2
825 0.2
826 0.21
827 0.2
828 0.19
829 0.17
830 0.17
831 0.15
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.16
836 0.16
837 0.17
838 0.17
839 0.14
840 0.12
841 0.12
842 0.11
843 0.12
844 0.15
845 0.13
846 0.14
847 0.18
848 0.19
849 0.19
850 0.24
851 0.24
852 0.23
853 0.31
854 0.3
855 0.27
856 0.27
857 0.25
858 0.2
859 0.2
860 0.2
861 0.14
862 0.13
863 0.12
864 0.11
865 0.1
866 0.1
867 0.14
868 0.17
869 0.16
870 0.17
871 0.18
872 0.19
873 0.18
874 0.18
875 0.14
876 0.09
877 0.08
878 0.07
879 0.06
880 0.06
881 0.06
882 0.06
883 0.05
884 0.05
885 0.07
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.15
890 0.19
891 0.23
892 0.28
893 0.27
894 0.32
895 0.37
896 0.42
897 0.37
898 0.38
899 0.39
900 0.39
901 0.4
902 0.37
903 0.33
904 0.3
905 0.28
906 0.26
907 0.23
908 0.18
909 0.16
910 0.15
911 0.14
912 0.12
913 0.11
914 0.09
915 0.06
916 0.06
917 0.05
918 0.06
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.05
930 0.07
931 0.08
932 0.13
933 0.16
934 0.17
935 0.18
936 0.2
937 0.22
938 0.3
939 0.35
940 0.32
941 0.32
942 0.31
943 0.3
944 0.29
945 0.27
946 0.22
947 0.17
948 0.18
949 0.15
950 0.17
951 0.22
952 0.29
953 0.32
954 0.31
955 0.31
956 0.29
957 0.29
958 0.31
959 0.28
960 0.25
961 0.25
962 0.27
963 0.27
964 0.27
965 0.27
966 0.26
967 0.25
968 0.21
969 0.24
970 0.25
971 0.26
972 0.27
973 0.29
974 0.26
975 0.27
976 0.25
977 0.21
978 0.15
979 0.13
980 0.13
981 0.1
982 0.11
983 0.11
984 0.13
985 0.11
986 0.12
987 0.13
988 0.21
989 0.23
990 0.23
991 0.25
992 0.24
993 0.27
994 0.3
995 0.34
996 0.3
997 0.34
998 0.34
999 0.35
1000 0.42
1001 0.38
1002 0.38
1003 0.35
1004 0.35
1005 0.29
1006 0.28
1007 0.25
1008 0.22
1009 0.24
1010 0.25
1011 0.25
1012 0.26
1013 0.26
1014 0.29
1015 0.29
1016 0.24
1017 0.25
1018 0.22
1019 0.25
1020 0.21
1021 0.21
1022 0.2
1023 0.2
1024 0.22
1025 0.26
1026 0.27
1027 0.29
1028 0.33
1029 0.34
1030 0.38
1031 0.4
1032 0.43
1033 0.44
1034 0.43
1035 0.38
1036 0.37
1037 0.35
1038 0.31
1039 0.32
1040 0.35
1041 0.35
1042 0.35
1043 0.37
1044 0.35
1045 0.36
1046 0.36
1047 0.32
1048 0.31
1049 0.27
1050 0.34
1051 0.37
1052 0.42
1053 0.45
1054 0.45
1055 0.47
1056 0.44
1057 0.46
1058 0.41
1059 0.41
1060 0.36
1061 0.39
1062 0.42
1063 0.38
1064 0.35
1065 0.35
1066 0.32
1067 0.27
1068 0.25
1069 0.24
1070 0.27
1071 0.28
1072 0.31
1073 0.27
1074 0.28
1075 0.28
1076 0.3
1077 0.3
1078 0.26
1079 0.3
1080 0.27
1081 0.31
1082 0.29
1083 0.28
1084 0.26
1085 0.22
1086 0.21
1087 0.21
1088 0.25
1089 0.21
1090 0.23
1091 0.24
1092 0.26
1093 0.25
1094 0.27
1095 0.24
1096 0.2
1097 0.23
1098 0.22
1099 0.23
1100 0.2
1101 0.21
1102 0.2
1103 0.17
1104 0.17
1105 0.18
1106 0.19
1107 0.19
1108 0.22
1109 0.26
1110 0.27
1111 0.34
1112 0.35
1113 0.37
1114 0.35
1115 0.35
1116 0.36
1117 0.33
1118 0.31
1119 0.25
1120 0.24
1121 0.17
1122 0.17
1123 0.16
1124 0.13
1125 0.11
1126 0.09
1127 0.07
1128 0.07
1129 0.07
1130 0.06
1131 0.05
1132 0.04
1133 0.04
1134 0.05
1135 0.04
1136 0.04
1137 0.05
1138 0.06
1139 0.06
1140 0.06
1141 0.06
1142 0.06
1143 0.06
1144 0.06
1145 0.06
1146 0.04
1147 0.04
1148 0.05
1149 0.05
1150 0.05
1151 0.06
1152 0.05
1153 0.08
1154 0.1
1155 0.15
1156 0.17
1157 0.19
1158 0.19
1159 0.23
1160 0.26
1161 0.33
1162 0.36
1163 0.32
1164 0.33
1165 0.4
1166 0.41
1167 0.39
1168 0.39
1169 0.39
1170 0.38
1171 0.4
1172 0.41
1173 0.38
1174 0.39
1175 0.38
1176 0.39
1177 0.35
1178 0.33
1179 0.33
1180 0.33
1181 0.32
1182 0.3
1183 0.32
1184 0.37
1185 0.35
1186 0.34
1187 0.33
1188 0.3
1189 0.27
1190 0.28
1191 0.25
1192 0.18
1193 0.17
1194 0.17
1195 0.16
1196 0.16
1197 0.17
1198 0.15
1199 0.18
1200 0.18
1201 0.18
1202 0.17
1203 0.18
1204 0.17
1205 0.15
1206 0.18
1207 0.14
1208 0.15
1209 0.14
1210 0.17
1211 0.16
1212 0.15
1213 0.15
1214 0.12
1215 0.12
1216 0.1
1217 0.11
1218 0.17
1219 0.22
1220 0.23
1221 0.26
1222 0.26
1223 0.28
1224 0.28
1225 0.28
1226 0.21
1227 0.17
1228 0.16
1229 0.13
1230 0.14
1231 0.12
1232 0.11
1233 0.13
1234 0.11
1235 0.1
1236 0.11
1237 0.12
1238 0.13
1239 0.19
1240 0.2
1241 0.22
1242 0.28
1243 0.34
1244 0.4
1245 0.42
1246 0.42
1247 0.39
1248 0.42
1249 0.46
1250 0.46
1251 0.43
1252 0.37
1253 0.36
1254 0.37
1255 0.39
1256 0.34
1257 0.26
1258 0.24
1259 0.27
1260 0.26
1261 0.26
1262 0.27
1263 0.3
1264 0.34
1265 0.37
1266 0.41
1267 0.45
1268 0.53
1269 0.58
1270 0.56
1271 0.54
1272 0.51
1273 0.47
1274 0.42
1275 0.32
1276 0.26