Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VTB0

Protein Details
Accession A0A1L9VTB0    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38SDSPAKKTKKVEPQPSEETKSHydrophilic
41-68APKTNGEKEQQQPKRQIKPRKRAADFLSHydrophilic
77-105VKEAEPEKKKPTNKKTKKEEKEDAPAKKEBasic
108-127KAEKASTKSKAKKQPTPEESHydrophilic
178-200NIPDSKKAKRKILKKQKKAAEEGBasic
293-321KGANRRFKRTPWNKIEKKRLDKGKTREQWBasic
389-420PKETESKKENDTQKKSKKEDPKKAEEVKESKKBasic
425-444AAKTGAKAKKADKKKTKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-27TKRKAAAAGASDSPAKKTKK
53-62PKRQIKPRKR
82-120PEKKKPTNKKTKKEEKEDAPAKKEAPKAEKASTKSKAKK
182-196SKKAKRKILKKQKKA
295-319ANRRFKRTPWNKIEKKRLDKGKTRE
401-444QKKSKKEDPKKAEEVKESKKAEPAAAKTGAKAKKADKKKTKAKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKVTKRKAAAAGASDSPAKKTKKVEPQPSEETKSDAAPKTNGEKEQQQPKRQIKPRKRAADFLSSDEEDEPEVKEAEPEKKKPTNKKTKKEEKEDAPAKKEAPKAEKASTKSKAKKQPTPEESEEEEANAPASEGSDDEGEDDQTTALIRGFESSGDEDASDDEGFDPKQPVPNIPDSKKAKRKILKKQKKAAEEGENQAPGTVYIGRIPHGFYEYQMRAYFSQFGEITRLRLSRNRITGRSKHYAFVEFASSAVARIAAETMDNYLMFGHILKCKYIPSEQLHPDIWKGANRRFKRTPWNKIEKKRLDKGKTREQWTDRIEKEQNKRLAKAEKLKAVGYEVELPELMDVDEVPVQEEPKAIEDSKPAEEPVKAIEEPVKAIEEPKETESKKENDTQKKSKKEDPKKAEEVKESKKAEPAAAKTGAKAKKADKKKTKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.61
3 0.53
4 0.47
5 0.43
6 0.34
7 0.32
8 0.34
9 0.33
10 0.34
11 0.4
12 0.48
13 0.55
14 0.65
15 0.72
16 0.72
17 0.77
18 0.81
19 0.82
20 0.78
21 0.68
22 0.61
23 0.52
24 0.48
25 0.47
26 0.41
27 0.37
28 0.34
29 0.37
30 0.4
31 0.45
32 0.44
33 0.41
34 0.46
35 0.5
36 0.59
37 0.64
38 0.64
39 0.69
40 0.74
41 0.81
42 0.82
43 0.85
44 0.84
45 0.86
46 0.89
47 0.89
48 0.85
49 0.82
50 0.78
51 0.78
52 0.69
53 0.63
54 0.59
55 0.48
56 0.45
57 0.37
58 0.32
59 0.22
60 0.2
61 0.17
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.14
66 0.17
67 0.26
68 0.33
69 0.36
70 0.43
71 0.5
72 0.59
73 0.67
74 0.74
75 0.76
76 0.79
77 0.85
78 0.88
79 0.91
80 0.93
81 0.92
82 0.9
83 0.86
84 0.86
85 0.85
86 0.8
87 0.74
88 0.67
89 0.59
90 0.56
91 0.53
92 0.49
93 0.46
94 0.47
95 0.47
96 0.51
97 0.55
98 0.53
99 0.58
100 0.59
101 0.63
102 0.64
103 0.68
104 0.71
105 0.74
106 0.77
107 0.78
108 0.81
109 0.78
110 0.78
111 0.72
112 0.68
113 0.62
114 0.57
115 0.47
116 0.37
117 0.3
118 0.22
119 0.18
120 0.12
121 0.09
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.09
160 0.14
161 0.15
162 0.17
163 0.2
164 0.29
165 0.35
166 0.35
167 0.43
168 0.45
169 0.54
170 0.6
171 0.62
172 0.62
173 0.63
174 0.71
175 0.73
176 0.78
177 0.8
178 0.81
179 0.85
180 0.83
181 0.81
182 0.76
183 0.71
184 0.68
185 0.61
186 0.55
187 0.49
188 0.42
189 0.36
190 0.3
191 0.24
192 0.15
193 0.12
194 0.09
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.15
206 0.15
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.17
211 0.18
212 0.21
213 0.14
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.15
223 0.19
224 0.25
225 0.26
226 0.35
227 0.38
228 0.4
229 0.46
230 0.51
231 0.55
232 0.57
233 0.52
234 0.46
235 0.43
236 0.41
237 0.35
238 0.29
239 0.24
240 0.16
241 0.15
242 0.13
243 0.11
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.16
268 0.17
269 0.22
270 0.23
271 0.31
272 0.34
273 0.37
274 0.37
275 0.35
276 0.34
277 0.3
278 0.26
279 0.23
280 0.24
281 0.28
282 0.36
283 0.39
284 0.47
285 0.49
286 0.54
287 0.61
288 0.67
289 0.7
290 0.71
291 0.79
292 0.8
293 0.84
294 0.89
295 0.88
296 0.86
297 0.84
298 0.84
299 0.82
300 0.82
301 0.8
302 0.8
303 0.78
304 0.76
305 0.76
306 0.69
307 0.69
308 0.65
309 0.66
310 0.57
311 0.56
312 0.57
313 0.56
314 0.61
315 0.61
316 0.64
317 0.59
318 0.61
319 0.59
320 0.6
321 0.6
322 0.61
323 0.59
324 0.57
325 0.55
326 0.53
327 0.47
328 0.42
329 0.35
330 0.27
331 0.26
332 0.2
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.1
350 0.12
351 0.15
352 0.15
353 0.16
354 0.19
355 0.22
356 0.25
357 0.25
358 0.23
359 0.23
360 0.22
361 0.21
362 0.21
363 0.22
364 0.19
365 0.19
366 0.22
367 0.21
368 0.22
369 0.23
370 0.22
371 0.17
372 0.19
373 0.22
374 0.22
375 0.23
376 0.26
377 0.33
378 0.32
379 0.37
380 0.42
381 0.43
382 0.44
383 0.5
384 0.56
385 0.58
386 0.67
387 0.72
388 0.75
389 0.81
390 0.82
391 0.83
392 0.84
393 0.85
394 0.86
395 0.85
396 0.85
397 0.85
398 0.88
399 0.85
400 0.84
401 0.82
402 0.79
403 0.79
404 0.73
405 0.66
406 0.63
407 0.58
408 0.54
409 0.53
410 0.49
411 0.47
412 0.49
413 0.47
414 0.44
415 0.51
416 0.5
417 0.46
418 0.47
419 0.49
420 0.53
421 0.63
422 0.71
423 0.73
424 0.79