Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NR30

Protein Details
Accession C0NR30    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-338GTPVRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
419-444WDDRGVHAKRKGPKGKRGKNGNEVVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-328RRKKRK
425-437HAKRKGPKGKRGK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRQWINKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDPDADDRVLHKVSSTPTTESSLKPSRASKVLSELEKEFAGSQIRKNEGEAANYGIYYDDSQYDYMQHLRDLGGDGSGQSYFVEATPVKGKGKIKGMRLEEALKETSLDDVEDLASVRHHDALSTASAYSRKQTYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREALEALEDDAFVDSDEDGDLFESLVQGGIDAEVDPSEWRDTHIEDDDEGWESDATEKAPKQPSVSTKAATPSTKGPVDDEHIPDTAAAEGDWLRNFAQYKKDMKSKPSAPSTQGETVSVLHAGTVASTMFTAGGTPVRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERIEALYAVDEQGEDYDGSSMADDMSVVSGMSTVSEIPSLVSGGTPLRSDFNQIMDGFLDGWDDRGVHAKRKGPKGKRGKNGNEVVGIRMLDEIRQGLGPARLPGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.59
3 0.58
4 0.6
5 0.55
6 0.54
7 0.52
8 0.49
9 0.5
10 0.55
11 0.48
12 0.42
13 0.45
14 0.45
15 0.39
16 0.37
17 0.33
18 0.29
19 0.29
20 0.25
21 0.2
22 0.16
23 0.21
24 0.21
25 0.19
26 0.16
27 0.18
28 0.22
29 0.27
30 0.29
31 0.27
32 0.28
33 0.34
34 0.36
35 0.33
36 0.38
37 0.4
38 0.4
39 0.41
40 0.43
41 0.44
42 0.46
43 0.47
44 0.42
45 0.42
46 0.46
47 0.44
48 0.44
49 0.4
50 0.37
51 0.34
52 0.32
53 0.23
54 0.2
55 0.23
56 0.22
57 0.25
58 0.3
59 0.33
60 0.33
61 0.34
62 0.39
63 0.35
64 0.35
65 0.32
66 0.28
67 0.25
68 0.24
69 0.23
70 0.15
71 0.14
72 0.12
73 0.12
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.13
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.1
99 0.08
100 0.11
101 0.15
102 0.18
103 0.19
104 0.24
105 0.27
106 0.29
107 0.39
108 0.42
109 0.44
110 0.49
111 0.51
112 0.5
113 0.5
114 0.48
115 0.39
116 0.37
117 0.32
118 0.24
119 0.21
120 0.17
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.17
148 0.24
149 0.31
150 0.39
151 0.46
152 0.45
153 0.44
154 0.46
155 0.44
156 0.37
157 0.3
158 0.2
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.11
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.14
230 0.18
231 0.19
232 0.2
233 0.24
234 0.28
235 0.33
236 0.34
237 0.29
238 0.27
239 0.29
240 0.31
241 0.27
242 0.25
243 0.21
244 0.23
245 0.24
246 0.22
247 0.2
248 0.18
249 0.21
250 0.23
251 0.22
252 0.19
253 0.18
254 0.18
255 0.16
256 0.15
257 0.12
258 0.08
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.1
267 0.11
268 0.13
269 0.18
270 0.23
271 0.29
272 0.32
273 0.41
274 0.42
275 0.45
276 0.51
277 0.52
278 0.54
279 0.55
280 0.54
281 0.48
282 0.48
283 0.49
284 0.45
285 0.39
286 0.32
287 0.26
288 0.23
289 0.2
290 0.17
291 0.11
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.08
306 0.11
307 0.17
308 0.25
309 0.36
310 0.43
311 0.48
312 0.57
313 0.63
314 0.71
315 0.76
316 0.78
317 0.78
318 0.8
319 0.81
320 0.72
321 0.64
322 0.54
323 0.44
324 0.35
325 0.25
326 0.18
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.14
334 0.19
335 0.21
336 0.22
337 0.23
338 0.24
339 0.25
340 0.31
341 0.31
342 0.27
343 0.25
344 0.23
345 0.22
346 0.21
347 0.21
348 0.14
349 0.14
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.13
392 0.13
393 0.18
394 0.19
395 0.2
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.2
400 0.2
401 0.16
402 0.14
403 0.13
404 0.08
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.18
410 0.21
411 0.27
412 0.33
413 0.39
414 0.47
415 0.58
416 0.68
417 0.68
418 0.77
419 0.8
420 0.84
421 0.88
422 0.9
423 0.88
424 0.88
425 0.86
426 0.8
427 0.76
428 0.67
429 0.59
430 0.51
431 0.41
432 0.31
433 0.26
434 0.22
435 0.15
436 0.16
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.14
442 0.18
443 0.19
444 0.22