Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VJY9

Protein Details
Accession A0A1L9VJY9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
516-546QKQEQTQREKVQRQARKEKRETKRRDAWFAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
528-545RQARKEKRETKRRDAWFA
548-548K
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.333, cyto 7.5, cyto_mito 7.166, nucl 7, mito 5.5, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR045227  WDR18/Ipi3/RID3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MLSECFIASTLTSGKAPASASLRDVGICLQEFQPAPALRSTFKKSSTAGNCLAVSPSHVFAAQSEKAIVHVYSREKGNQEAIVPFPERIRSLAVAGGKNGDILVLGTEGGRLILWETCTGRQVATTASHLQPVTSLVVDRTSNFIVSGSSDASIHVWSLANILSFIKPPSGRDRQQPNSPIRTFSNHRAAITSITLGHSAGRYNIAVSTARDNTAVAWDYHTGRVLRTFLLPSSATCVTLDPVDRAFYVGYEDGSVQGVEFYKNQSVQHPLHDPSLQSTPAQPSAEDRWLPPSSDTGAVESLALSYDGTILLTGQRNGKVLSWNVARRKYATIVADYTHPVTNLSMLPLNGLPHPSLDLTRIAHTIVKPRYDQALSESSVNPGAVPADYAFQTHLLPTSKDTQKPKTKTDPFSEALTHAFFPDSMMEDGLAELAALSQGQQQPGTQQPSPSTVHSTQALEDTTTKDTQIATLEAELSTLKKKSTVSETARQTTTDEVTKLRSDLIHLQDYINELHQKQEQTQREKVQRQARKEKRETKRRDAWFAAEKKGRNGDAVVKNMDLDDGAQTSDSDDQNSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.16
4 0.18
5 0.2
6 0.2
7 0.22
8 0.23
9 0.24
10 0.21
11 0.21
12 0.18
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.15
17 0.2
18 0.2
19 0.2
20 0.27
21 0.24
22 0.25
23 0.27
24 0.29
25 0.27
26 0.33
27 0.4
28 0.37
29 0.39
30 0.41
31 0.39
32 0.47
33 0.51
34 0.51
35 0.47
36 0.46
37 0.43
38 0.39
39 0.39
40 0.29
41 0.26
42 0.21
43 0.19
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.22
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.17
53 0.18
54 0.19
55 0.18
56 0.14
57 0.18
58 0.21
59 0.25
60 0.28
61 0.31
62 0.32
63 0.34
64 0.36
65 0.33
66 0.31
67 0.29
68 0.27
69 0.27
70 0.26
71 0.25
72 0.22
73 0.23
74 0.21
75 0.2
76 0.22
77 0.19
78 0.19
79 0.21
80 0.25
81 0.23
82 0.23
83 0.23
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.13
88 0.08
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.07
101 0.08
102 0.11
103 0.13
104 0.14
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.16
113 0.19
114 0.19
115 0.23
116 0.22
117 0.21
118 0.19
119 0.19
120 0.17
121 0.12
122 0.12
123 0.09
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.13
154 0.13
155 0.16
156 0.24
157 0.31
158 0.34
159 0.42
160 0.51
161 0.53
162 0.61
163 0.66
164 0.64
165 0.65
166 0.63
167 0.57
168 0.5
169 0.5
170 0.47
171 0.47
172 0.49
173 0.42
174 0.41
175 0.39
176 0.37
177 0.33
178 0.29
179 0.22
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.15
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.14
207 0.14
208 0.17
209 0.14
210 0.13
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.11
217 0.14
218 0.14
219 0.12
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.19
254 0.19
255 0.22
256 0.24
257 0.24
258 0.24
259 0.25
260 0.23
261 0.19
262 0.21
263 0.18
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.14
271 0.17
272 0.2
273 0.19
274 0.17
275 0.2
276 0.21
277 0.21
278 0.19
279 0.16
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.08
288 0.07
289 0.05
290 0.05
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.05
299 0.07
300 0.08
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.18
309 0.21
310 0.26
311 0.31
312 0.34
313 0.34
314 0.33
315 0.35
316 0.32
317 0.31
318 0.27
319 0.23
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.15
326 0.13
327 0.11
328 0.1
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.09
340 0.08
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.15
351 0.15
352 0.22
353 0.23
354 0.25
355 0.24
356 0.25
357 0.29
358 0.27
359 0.26
360 0.22
361 0.24
362 0.22
363 0.23
364 0.22
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.14
369 0.09
370 0.09
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.22
386 0.27
387 0.33
388 0.39
389 0.45
390 0.53
391 0.58
392 0.63
393 0.65
394 0.69
395 0.7
396 0.7
397 0.67
398 0.6
399 0.57
400 0.51
401 0.41
402 0.34
403 0.29
404 0.22
405 0.16
406 0.14
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.08
425 0.1
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.16
430 0.23
431 0.28
432 0.25
433 0.25
434 0.26
435 0.31
436 0.33
437 0.31
438 0.32
439 0.27
440 0.29
441 0.3
442 0.29
443 0.25
444 0.25
445 0.24
446 0.18
447 0.18
448 0.18
449 0.19
450 0.18
451 0.18
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.16
456 0.14
457 0.12
458 0.12
459 0.13
460 0.11
461 0.12
462 0.11
463 0.1
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.15
468 0.17
469 0.21
470 0.28
471 0.37
472 0.4
473 0.47
474 0.54
475 0.57
476 0.57
477 0.53
478 0.46
479 0.4
480 0.37
481 0.32
482 0.26
483 0.22
484 0.25
485 0.26
486 0.25
487 0.24
488 0.2
489 0.21
490 0.27
491 0.31
492 0.32
493 0.31
494 0.31
495 0.3
496 0.32
497 0.29
498 0.25
499 0.24
500 0.2
501 0.23
502 0.27
503 0.28
504 0.32
505 0.41
506 0.45
507 0.49
508 0.56
509 0.62
510 0.68
511 0.72
512 0.75
513 0.76
514 0.75
515 0.78
516 0.81
517 0.82
518 0.83
519 0.87
520 0.89
521 0.89
522 0.92
523 0.91
524 0.9
525 0.9
526 0.87
527 0.85
528 0.79
529 0.76
530 0.76
531 0.71
532 0.7
533 0.67
534 0.61
535 0.59
536 0.61
537 0.55
538 0.47
539 0.45
540 0.45
541 0.46
542 0.49
543 0.44
544 0.37
545 0.37
546 0.34
547 0.31
548 0.21
549 0.15
550 0.12
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.12
556 0.17
557 0.16