Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VIM5

Protein Details
Accession A0A1L9VIM5    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28SSFFTVPASQKKRKREDRAAAPGSKKRHydrophilic
183-215NPTIPSENSKRPPRPQRKKPKKVKYVRGLQKVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-28KKRKREDRAAAPGSKKR
192-206KRPPRPQRKKPKKVK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSSFFTVPASQKKRKREDRAAAPGSKKRGVDANGDSGAKGQGARQQRDESVSGSDIDEDEASAASGSEEESGSDDEGETAGERRLKLAERYLENVRDEVDEVGFDAAEIDRDLIAERLKEDVDEFKGRGYRQIASDLAFSSASHSFFRADTQSTTSIAVHAPFVYTVSKDKTLIKWELATPENPTIPSENSKRPPRPQRKKPKKVKYVRGLQKVEETGEDQGHTKNILSLAVSPSGKFLATGGEDNKLIIWDAATLTPLKTFTQHRDTVSGLAFARHISTMSSGEQLFSGSYDRTIKTWSVSSAGHAYVETLFGHQDNVSSLAAMTIDQCISVGARDRTARLWKVVEEAQLVFRGGASRNAAYHENNLDCIAPLPPSHFVTGSDSGSLALWSIHKKKPLHVIPLAHGLDPVPPLEDLSPELDQQTAATNSRYLRPMPRWITALTTVPGTDIVLSGSWDGWIRAWKISEDKRVILPLGTVGGGASLEPDTPSFQLKQNLAFDATTEDNMAIDNAPVSQSSAVKEAEPLIKGVINDIAVFERRGDTARPDQPLESKSKSKSKEPETKGLCIVAAVGKEHRLGRWKCYTNNFQEGPTPEGRNGAVVFEVPFTAVQTKKASS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.86
3 0.86
4 0.88
5 0.89
6 0.92
7 0.9
8 0.86
9 0.84
10 0.8
11 0.75
12 0.7
13 0.59
14 0.51
15 0.51
16 0.46
17 0.46
18 0.45
19 0.45
20 0.43
21 0.44
22 0.41
23 0.34
24 0.32
25 0.24
26 0.19
27 0.15
28 0.18
29 0.27
30 0.31
31 0.36
32 0.39
33 0.41
34 0.45
35 0.45
36 0.4
37 0.34
38 0.31
39 0.26
40 0.22
41 0.2
42 0.16
43 0.16
44 0.14
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.11
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.19
72 0.22
73 0.25
74 0.32
75 0.36
76 0.36
77 0.41
78 0.46
79 0.47
80 0.44
81 0.41
82 0.34
83 0.28
84 0.26
85 0.22
86 0.16
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.15
109 0.19
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.27
114 0.27
115 0.31
116 0.3
117 0.28
118 0.26
119 0.3
120 0.28
121 0.25
122 0.27
123 0.21
124 0.2
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.17
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.22
142 0.19
143 0.18
144 0.16
145 0.15
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.15
155 0.17
156 0.18
157 0.22
158 0.24
159 0.3
160 0.31
161 0.3
162 0.28
163 0.28
164 0.32
165 0.3
166 0.28
167 0.25
168 0.25
169 0.24
170 0.22
171 0.22
172 0.19
173 0.19
174 0.24
175 0.26
176 0.31
177 0.38
178 0.47
179 0.53
180 0.6
181 0.69
182 0.75
183 0.81
184 0.84
185 0.87
186 0.89
187 0.94
188 0.95
189 0.95
190 0.95
191 0.94
192 0.94
193 0.92
194 0.91
195 0.9
196 0.88
197 0.8
198 0.7
199 0.65
200 0.55
201 0.46
202 0.36
203 0.28
204 0.2
205 0.18
206 0.17
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.07
227 0.08
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.13
249 0.18
250 0.24
251 0.28
252 0.28
253 0.29
254 0.3
255 0.29
256 0.27
257 0.23
258 0.17
259 0.14
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.08
264 0.08
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.05
278 0.07
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.11
293 0.1
294 0.1
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.09
321 0.08
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.16
326 0.21
327 0.22
328 0.2
329 0.21
330 0.19
331 0.22
332 0.23
333 0.21
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.11
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.14
348 0.16
349 0.15
350 0.17
351 0.18
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.14
356 0.12
357 0.12
358 0.1
359 0.07
360 0.07
361 0.09
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.17
368 0.2
369 0.18
370 0.16
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.12
375 0.07
376 0.05
377 0.07
378 0.11
379 0.17
380 0.2
381 0.26
382 0.28
383 0.32
384 0.41
385 0.46
386 0.48
387 0.47
388 0.47
389 0.43
390 0.51
391 0.47
392 0.37
393 0.31
394 0.24
395 0.2
396 0.18
397 0.16
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.11
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.14
416 0.15
417 0.19
418 0.2
419 0.19
420 0.25
421 0.28
422 0.37
423 0.39
424 0.41
425 0.39
426 0.38
427 0.39
428 0.35
429 0.33
430 0.24
431 0.2
432 0.17
433 0.15
434 0.14
435 0.11
436 0.09
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.16
451 0.18
452 0.25
453 0.32
454 0.39
455 0.38
456 0.39
457 0.39
458 0.39
459 0.38
460 0.3
461 0.24
462 0.16
463 0.13
464 0.11
465 0.09
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.08
476 0.09
477 0.12
478 0.13
479 0.17
480 0.23
481 0.25
482 0.3
483 0.3
484 0.31
485 0.3
486 0.28
487 0.24
488 0.22
489 0.22
490 0.17
491 0.15
492 0.13
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.08
503 0.09
504 0.1
505 0.11
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.16
510 0.19
511 0.21
512 0.2
513 0.19
514 0.17
515 0.18
516 0.18
517 0.18
518 0.16
519 0.13
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.14
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.15
529 0.17
530 0.21
531 0.28
532 0.34
533 0.37
534 0.38
535 0.4
536 0.43
537 0.46
538 0.46
539 0.44
540 0.45
541 0.47
542 0.54
543 0.56
544 0.6
545 0.65
546 0.68
547 0.73
548 0.73
549 0.76
550 0.72
551 0.72
552 0.65
553 0.56
554 0.46
555 0.35
556 0.3
557 0.22
558 0.18
559 0.16
560 0.16
561 0.16
562 0.2
563 0.22
564 0.24
565 0.31
566 0.33
567 0.39
568 0.47
569 0.52
570 0.56
571 0.64
572 0.7
573 0.68
574 0.75
575 0.68
576 0.59
577 0.59
578 0.56
579 0.53
580 0.49
581 0.43
582 0.34
583 0.36
584 0.34
585 0.31
586 0.27
587 0.22
588 0.17
589 0.15
590 0.15
591 0.13
592 0.13
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.17
597 0.17
598 0.2