Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NIJ3

Protein Details
Accession C0NIJ3    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-41ITDPPLKKSKRSTFKAAQVQDKHydrophilic
115-137GGEAEKPSKKKPKRAAEAPESAVHydrophilic
222-247VPVIPDSKKVKRKLRKMKKNATELEEHydrophilic
356-380EAGKTKEKWSKKIKQENARRAKRAEBasic
448-475VEITSNKSKKEKKERKDKKDTTVKEAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-129AEKPSKKKPKRA
229-240KKVKRKLRKMKK
339-383NKRFKRTPWNDIERRRMEAGKTKEKWSKKIKQENARRAKRAEKMK
454-489KSKKEKKERKDKKDTTVKEAKKAGEVEKIESKSTSK
500-530KLAKGEKGNASLPGAGKSGKGERSKTKKSKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MTVEKNANKRKAATASAPTITDPPLKKSKRSTFKAAQVQDKVPKPILKKAKSTEASNGSSPKLIPVKVASEPARQIQPRKRAADFLSEDEGEECHGEKTEKNHVTPSPAASRPIGGEAEKPSKKKPKRAAEAPESAVPSVAKITTTKPDSGEEPLSTGKSSKKTKGVTGLLEGVFSQIAENDEEGSEGGEDDDQTAAFIQGFESSGDEDISGDDGFEPGKNVPVIPDSKKVKRKLRKMKKNATELEEPGTVYVGRVPHGFYEHEMRAYFSQFGPITRLRLSRNRTTGKSKHFAFLEFASASVAKVVADTMDNYLMFGHILKCKYIPKESVHPQLWKGANKRFKRTPWNDIERRRMEAGKTKEKWSKKIKQENARRAKRAEKMKALGYEFEIPALKGVDEVHIAVDGKEGQARIDDVGMEESTNKQEQRATIETSTDGAEKPNGRVADVEITSNKSKKEKKERKDKKDTTVKEAKKAGEVEKIESKSTSKKVSAVSDTPEKLAKGEKGNASLPGAGKSGKGERSKTKKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.54
3 0.52
4 0.49
5 0.43
6 0.39
7 0.36
8 0.36
9 0.3
10 0.31
11 0.4
12 0.43
13 0.49
14 0.57
15 0.65
16 0.68
17 0.73
18 0.76
19 0.75
20 0.81
21 0.84
22 0.8
23 0.79
24 0.74
25 0.74
26 0.72
27 0.68
28 0.63
29 0.59
30 0.57
31 0.53
32 0.56
33 0.6
34 0.58
35 0.62
36 0.63
37 0.67
38 0.67
39 0.67
40 0.66
41 0.63
42 0.6
43 0.56
44 0.53
45 0.43
46 0.4
47 0.36
48 0.34
49 0.31
50 0.27
51 0.26
52 0.26
53 0.29
54 0.29
55 0.36
56 0.33
57 0.34
58 0.36
59 0.38
60 0.43
61 0.42
62 0.49
63 0.51
64 0.57
65 0.61
66 0.63
67 0.61
68 0.6
69 0.58
70 0.59
71 0.54
72 0.49
73 0.45
74 0.39
75 0.37
76 0.31
77 0.29
78 0.19
79 0.16
80 0.13
81 0.08
82 0.1
83 0.11
84 0.13
85 0.18
86 0.28
87 0.32
88 0.32
89 0.37
90 0.37
91 0.42
92 0.42
93 0.42
94 0.38
95 0.35
96 0.36
97 0.32
98 0.31
99 0.26
100 0.26
101 0.23
102 0.17
103 0.18
104 0.22
105 0.31
106 0.34
107 0.35
108 0.41
109 0.5
110 0.57
111 0.64
112 0.69
113 0.7
114 0.76
115 0.83
116 0.84
117 0.81
118 0.8
119 0.74
120 0.67
121 0.57
122 0.47
123 0.38
124 0.29
125 0.2
126 0.15
127 0.12
128 0.09
129 0.09
130 0.12
131 0.18
132 0.21
133 0.22
134 0.23
135 0.24
136 0.25
137 0.29
138 0.29
139 0.22
140 0.21
141 0.21
142 0.2
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.24
147 0.29
148 0.33
149 0.39
150 0.41
151 0.45
152 0.51
153 0.51
154 0.45
155 0.42
156 0.41
157 0.33
158 0.3
159 0.26
160 0.18
161 0.14
162 0.12
163 0.09
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.11
211 0.15
212 0.16
213 0.24
214 0.28
215 0.36
216 0.44
217 0.51
218 0.58
219 0.64
220 0.72
221 0.76
222 0.82
223 0.85
224 0.88
225 0.9
226 0.88
227 0.88
228 0.82
229 0.76
230 0.69
231 0.58
232 0.51
233 0.41
234 0.32
235 0.23
236 0.19
237 0.13
238 0.09
239 0.1
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.14
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.1
257 0.14
258 0.12
259 0.13
260 0.16
261 0.16
262 0.17
263 0.18
264 0.21
265 0.2
266 0.27
267 0.32
268 0.35
269 0.42
270 0.45
271 0.47
272 0.53
273 0.56
274 0.56
275 0.57
276 0.52
277 0.48
278 0.44
279 0.41
280 0.35
281 0.28
282 0.24
283 0.18
284 0.16
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.14
309 0.18
310 0.21
311 0.25
312 0.27
313 0.28
314 0.36
315 0.42
316 0.49
317 0.49
318 0.48
319 0.45
320 0.48
321 0.48
322 0.45
323 0.44
324 0.44
325 0.49
326 0.52
327 0.59
328 0.58
329 0.61
330 0.66
331 0.67
332 0.68
333 0.69
334 0.75
335 0.75
336 0.76
337 0.79
338 0.71
339 0.68
340 0.61
341 0.53
342 0.46
343 0.47
344 0.47
345 0.48
346 0.48
347 0.51
348 0.56
349 0.59
350 0.64
351 0.66
352 0.67
353 0.67
354 0.75
355 0.78
356 0.8
357 0.86
358 0.88
359 0.89
360 0.88
361 0.82
362 0.76
363 0.74
364 0.72
365 0.71
366 0.68
367 0.65
368 0.6
369 0.61
370 0.61
371 0.55
372 0.48
373 0.41
374 0.37
375 0.29
376 0.26
377 0.22
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.12
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.08
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.13
409 0.17
410 0.16
411 0.16
412 0.19
413 0.2
414 0.27
415 0.29
416 0.31
417 0.28
418 0.29
419 0.28
420 0.27
421 0.26
422 0.2
423 0.16
424 0.13
425 0.17
426 0.17
427 0.19
428 0.23
429 0.22
430 0.21
431 0.22
432 0.23
433 0.25
434 0.24
435 0.25
436 0.21
437 0.26
438 0.3
439 0.32
440 0.33
441 0.35
442 0.42
443 0.5
444 0.59
445 0.65
446 0.71
447 0.8
448 0.88
449 0.9
450 0.94
451 0.92
452 0.91
453 0.91
454 0.86
455 0.84
456 0.83
457 0.77
458 0.74
459 0.72
460 0.63
461 0.58
462 0.57
463 0.51
464 0.49
465 0.46
466 0.43
467 0.45
468 0.45
469 0.41
470 0.38
471 0.38
472 0.38
473 0.42
474 0.43
475 0.37
476 0.39
477 0.43
478 0.49
479 0.52
480 0.48
481 0.48
482 0.5
483 0.49
484 0.47
485 0.45
486 0.38
487 0.32
488 0.35
489 0.34
490 0.33
491 0.39
492 0.41
493 0.42
494 0.44
495 0.45
496 0.41
497 0.39
498 0.33
499 0.29
500 0.26
501 0.22
502 0.21
503 0.23
504 0.27
505 0.31
506 0.37
507 0.41
508 0.5
509 0.6
510 0.7