Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VHL9

Protein Details
Accession A0A1L9VHL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-161ATSVVGKKNKGKNKRGARRDSDGTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-155KKNKGKNKRGARR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 11.666, cyto_nucl 9.666, mito 9, cyto_mito 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MAEPRARVARHKGQMNFPSELRLLLLAYGDPSPHSSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFILEMCHGAAQYASYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKAFDQNDDQIANLKDAKKGIDEHEDGDATSVVGKKNKGKNKRGARRDSDGTEETISKKRKTAGQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.62
4 0.52
5 0.48
6 0.4
7 0.36
8 0.27
9 0.2
10 0.15
11 0.12
12 0.12
13 0.07
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.11
19 0.14
20 0.14
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.21
25 0.26
26 0.25
27 0.23
28 0.26
29 0.27
30 0.26
31 0.26
32 0.23
33 0.17
34 0.16
35 0.16
36 0.13
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.05
54 0.08
55 0.09
56 0.15
57 0.2
58 0.23
59 0.3
60 0.31
61 0.36
62 0.42
63 0.51
64 0.55
65 0.55
66 0.56
67 0.51
68 0.53
69 0.51
70 0.43
71 0.37
72 0.33
73 0.33
74 0.35
75 0.39
76 0.4
77 0.41
78 0.43
79 0.4
80 0.36
81 0.36
82 0.31
83 0.3
84 0.28
85 0.26
86 0.23
87 0.23
88 0.21
89 0.19
90 0.22
91 0.22
92 0.2
93 0.27
94 0.28
95 0.29
96 0.33
97 0.34
98 0.32
99 0.36
100 0.37
101 0.31
102 0.33
103 0.31
104 0.26
105 0.28
106 0.27
107 0.2
108 0.21
109 0.2
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.17
114 0.19
115 0.2
116 0.24
117 0.24
118 0.24
119 0.26
120 0.25
121 0.22
122 0.21
123 0.18
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.15
129 0.19
130 0.26
131 0.36
132 0.45
133 0.54
134 0.61
135 0.69
136 0.77
137 0.84
138 0.86
139 0.87
140 0.85
141 0.83
142 0.81
143 0.74
144 0.7
145 0.61
146 0.54
147 0.46
148 0.41
149 0.36
150 0.38
151 0.4
152 0.35
153 0.37
154 0.39