Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VVD7

Protein Details
Accession A0A1L9VVD7    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-26VITKPASHPPKMKRPPPPLGGQSHydrophilic
383-402SPMHRDPPPSPKRRKRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-397PKRRK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 8.5, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MATVITKPASHPPKMKRPPPPLGGQSGLNGIRAPQQSPSSSSPSSASKRPPGPGQLDAANATGGQMANGVNGASFLNSSNNKGPLNRPRRDAQRIADHPTRVQRSLSKTMPTDNDRRVGKKCPEPYVKTTPYILKKYAKHPPSLIVHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVKFYEGCLIVRVVDHKSATAQARKATATQSNDNNSPFSIHNYNEHITPSPFVPYPKHNQLASEQTAAKTETATNGTPDQNKEVVKDASAKEAQAPLKPKVFTTVLHPTTRSLQAELTLLATTPNPRAARQQAESSNDQTNGHVAKRQKMLVEPQHLLECESKLTRALAPPLFLEPVDSLEAVQDLLKFMESPMHRDPPPSPKRRKRTVAELEADEALAAEEERFMLIMDERLESSVSNGAGGTKSAVDETSGGAPFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEIKLKQEMAKRQQQEMERERRRVLEQRQAEEHAREEARRQQLAAQQAQAQLAAQQQQSRLAQANGVSQGQQSSPVVRNQTPLNVSSPMVGNTMATQGAIPMSITSSAQGGAGSPPRPPSALQHAHPSVIGHPMAPSRSQQGGQSRHGTPQMTQGTPAVSHATPIMRNATPRMSHGSPSHSGISQTPVMNQGMMATPQMGGGGMGLTPQQQQLLLHQRQQAMIAAQQGNLGHSGLTPQQFSQLQANAHAQQNIQQYQQHLLQQQQQNQQQQQQQQQQQQQRIPNQHAYQAQLMRAQLTQMQMAQNQQQQHPQQHPQPQNQQVQAQQNGGHQGSPQMTPQQQQQQILMAAAQANGGHLPQNFQGMNMAQRYTQLYHQRLLRLRQEMAHRFTGQYGPPSQYPPHIAQQYGLGLERSAKVWVNELMKRERESVQQQRASQVAAVQAQVMQQQQQQQQNMMRNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.79
3 0.79
4 0.82
5 0.84
6 0.82
7 0.82
8 0.76
9 0.72
10 0.67
11 0.57
12 0.49
13 0.47
14 0.41
15 0.32
16 0.26
17 0.21
18 0.26
19 0.26
20 0.25
21 0.24
22 0.28
23 0.3
24 0.35
25 0.39
26 0.38
27 0.37
28 0.38
29 0.36
30 0.39
31 0.42
32 0.43
33 0.46
34 0.48
35 0.53
36 0.57
37 0.6
38 0.6
39 0.6
40 0.57
41 0.53
42 0.47
43 0.43
44 0.39
45 0.33
46 0.25
47 0.19
48 0.16
49 0.14
50 0.11
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.14
64 0.16
65 0.21
66 0.25
67 0.29
68 0.31
69 0.34
70 0.42
71 0.46
72 0.55
73 0.56
74 0.56
75 0.6
76 0.68
77 0.73
78 0.72
79 0.68
80 0.69
81 0.69
82 0.72
83 0.69
84 0.62
85 0.59
86 0.61
87 0.58
88 0.49
89 0.48
90 0.47
91 0.48
92 0.54
93 0.53
94 0.5
95 0.47
96 0.51
97 0.54
98 0.54
99 0.55
100 0.51
101 0.54
102 0.53
103 0.56
104 0.53
105 0.55
106 0.57
107 0.58
108 0.61
109 0.63
110 0.68
111 0.7
112 0.74
113 0.75
114 0.71
115 0.64
116 0.61
117 0.59
118 0.58
119 0.57
120 0.55
121 0.53
122 0.54
123 0.6
124 0.66
125 0.62
126 0.59
127 0.56
128 0.57
129 0.55
130 0.55
131 0.5
132 0.43
133 0.46
134 0.42
135 0.42
136 0.4
137 0.35
138 0.35
139 0.32
140 0.32
141 0.29
142 0.3
143 0.36
144 0.32
145 0.37
146 0.36
147 0.39
148 0.37
149 0.33
150 0.33
151 0.28
152 0.26
153 0.22
154 0.19
155 0.15
156 0.15
157 0.17
158 0.19
159 0.16
160 0.17
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.15
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.14
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.16
196 0.21
197 0.25
198 0.29
199 0.29
200 0.29
201 0.31
202 0.32
203 0.32
204 0.31
205 0.32
206 0.32
207 0.35
208 0.38
209 0.41
210 0.43
211 0.42
212 0.39
213 0.33
214 0.3
215 0.25
216 0.24
217 0.23
218 0.21
219 0.24
220 0.27
221 0.28
222 0.27
223 0.28
224 0.24
225 0.21
226 0.22
227 0.18
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.24
233 0.31
234 0.38
235 0.42
236 0.39
237 0.4
238 0.42
239 0.46
240 0.43
241 0.39
242 0.32
243 0.27
244 0.29
245 0.27
246 0.23
247 0.17
248 0.14
249 0.13
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.18
254 0.21
255 0.24
256 0.25
257 0.26
258 0.26
259 0.26
260 0.26
261 0.27
262 0.24
263 0.22
264 0.26
265 0.23
266 0.25
267 0.26
268 0.24
269 0.22
270 0.26
271 0.27
272 0.25
273 0.29
274 0.27
275 0.31
276 0.31
277 0.29
278 0.29
279 0.29
280 0.25
281 0.27
282 0.34
283 0.33
284 0.34
285 0.35
286 0.31
287 0.34
288 0.38
289 0.32
290 0.23
291 0.19
292 0.19
293 0.19
294 0.18
295 0.14
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.22
306 0.26
307 0.31
308 0.32
309 0.37
310 0.36
311 0.4
312 0.42
313 0.39
314 0.37
315 0.33
316 0.31
317 0.24
318 0.23
319 0.21
320 0.19
321 0.2
322 0.19
323 0.24
324 0.27
325 0.29
326 0.27
327 0.28
328 0.35
329 0.38
330 0.41
331 0.36
332 0.34
333 0.34
334 0.33
335 0.32
336 0.25
337 0.18
338 0.15
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.18
350 0.17
351 0.15
352 0.14
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.11
369 0.1
370 0.16
371 0.2
372 0.24
373 0.24
374 0.26
375 0.29
376 0.34
377 0.44
378 0.48
379 0.55
380 0.61
381 0.7
382 0.77
383 0.83
384 0.77
385 0.78
386 0.78
387 0.75
388 0.68
389 0.6
390 0.53
391 0.44
392 0.39
393 0.27
394 0.17
395 0.09
396 0.05
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.14
439 0.17
440 0.23
441 0.23
442 0.26
443 0.31
444 0.35
445 0.41
446 0.43
447 0.42
448 0.38
449 0.42
450 0.39
451 0.37
452 0.39
453 0.36
454 0.34
455 0.39
456 0.38
457 0.36
458 0.39
459 0.4
460 0.42
461 0.44
462 0.45
463 0.44
464 0.48
465 0.48
466 0.49
467 0.51
468 0.48
469 0.48
470 0.47
471 0.42
472 0.43
473 0.43
474 0.48
475 0.49
476 0.53
477 0.51
478 0.51
479 0.5
480 0.48
481 0.48
482 0.47
483 0.44
484 0.43
485 0.42
486 0.42
487 0.44
488 0.44
489 0.42
490 0.35
491 0.3
492 0.25
493 0.21
494 0.18
495 0.18
496 0.22
497 0.26
498 0.25
499 0.24
500 0.24
501 0.27
502 0.32
503 0.31
504 0.25
505 0.23
506 0.24
507 0.23
508 0.2
509 0.16
510 0.11
511 0.11
512 0.13
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.16
517 0.17
518 0.17
519 0.17
520 0.14
521 0.14
522 0.14
523 0.16
524 0.13
525 0.13
526 0.12
527 0.1
528 0.11
529 0.1
530 0.11
531 0.09
532 0.1
533 0.13
534 0.15
535 0.19
536 0.19
537 0.21
538 0.2
539 0.24
540 0.22
541 0.21
542 0.2
543 0.18
544 0.18
545 0.16
546 0.16
547 0.13
548 0.13
549 0.11
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.07
554 0.06
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.03
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.07
571 0.1
572 0.11
573 0.11
574 0.13
575 0.14
576 0.15
577 0.15
578 0.18
579 0.24
580 0.3
581 0.3
582 0.36
583 0.36
584 0.35
585 0.35
586 0.31
587 0.22
588 0.2
589 0.19
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.13
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.16
598 0.17
599 0.2
600 0.27
601 0.32
602 0.35
603 0.39
604 0.37
605 0.37
606 0.4
607 0.36
608 0.28
609 0.32
610 0.32
611 0.27
612 0.27
613 0.24
614 0.22
615 0.22
616 0.22
617 0.16
618 0.11
619 0.11
620 0.12
621 0.13
622 0.13
623 0.14
624 0.17
625 0.15
626 0.16
627 0.18
628 0.22
629 0.21
630 0.22
631 0.28
632 0.25
633 0.28
634 0.29
635 0.32
636 0.29
637 0.32
638 0.31
639 0.25
640 0.24
641 0.22
642 0.23
643 0.21
644 0.2
645 0.17
646 0.19
647 0.18
648 0.17
649 0.16
650 0.13
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.07
658 0.06
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.03
663 0.04
664 0.04
665 0.05
666 0.06
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.15
672 0.25
673 0.27
674 0.31
675 0.35
676 0.36
677 0.36
678 0.37
679 0.32
680 0.23
681 0.22
682 0.22
683 0.19
684 0.18
685 0.19
686 0.18
687 0.17
688 0.16
689 0.14
690 0.08
691 0.07
692 0.09
693 0.11
694 0.12
695 0.13
696 0.12
697 0.17
698 0.18
699 0.2
700 0.23
701 0.23
702 0.22
703 0.25
704 0.29
705 0.27
706 0.29
707 0.28
708 0.24
709 0.26
710 0.32
711 0.31
712 0.29
713 0.27
714 0.26
715 0.29
716 0.32
717 0.31
718 0.27
719 0.29
720 0.35
721 0.39
722 0.45
723 0.5
724 0.53
725 0.57
726 0.58
727 0.61
728 0.59
729 0.6
730 0.62
731 0.63
732 0.64
733 0.64
734 0.69
735 0.7
736 0.71
737 0.7
738 0.68
739 0.67
740 0.67
741 0.65
742 0.65
743 0.58
744 0.57
745 0.53
746 0.49
747 0.47
748 0.42
749 0.38
750 0.32
751 0.31
752 0.26
753 0.24
754 0.22
755 0.18
756 0.17
757 0.16
758 0.16
759 0.18
760 0.18
761 0.21
762 0.26
763 0.27
764 0.29
765 0.3
766 0.36
767 0.39
768 0.45
769 0.49
770 0.51
771 0.55
772 0.61
773 0.67
774 0.68
775 0.72
776 0.73
777 0.74
778 0.7
779 0.67
780 0.64
781 0.63
782 0.57
783 0.5
784 0.43
785 0.38
786 0.4
787 0.36
788 0.3
789 0.22
790 0.23
791 0.23
792 0.22
793 0.22
794 0.23
795 0.25
796 0.27
797 0.34
798 0.39
799 0.42
800 0.42
801 0.41
802 0.38
803 0.37
804 0.35
805 0.27
806 0.19
807 0.15
808 0.13
809 0.12
810 0.08
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.1
815 0.09
816 0.12
817 0.13
818 0.19
819 0.18
820 0.18
821 0.21
822 0.2
823 0.24
824 0.24
825 0.24
826 0.18
827 0.21
828 0.24
829 0.24
830 0.3
831 0.34
832 0.35
833 0.4
834 0.44
835 0.5
836 0.53
837 0.57
838 0.58
839 0.54
840 0.53
841 0.53
842 0.58
843 0.58
844 0.57
845 0.56
846 0.5
847 0.45
848 0.45
849 0.45
850 0.38
851 0.36
852 0.34
853 0.32
854 0.33
855 0.36
856 0.36
857 0.35
858 0.38
859 0.37
860 0.42
861 0.41
862 0.39
863 0.36
864 0.38
865 0.35
866 0.32
867 0.28
868 0.2
869 0.17
870 0.19
871 0.19
872 0.16
873 0.16
874 0.17
875 0.17
876 0.2
877 0.26
878 0.3
879 0.32
880 0.37
881 0.42
882 0.45
883 0.47
884 0.47
885 0.45
886 0.46
887 0.53
888 0.58
889 0.6
890 0.62
891 0.61
892 0.61
893 0.59
894 0.53
895 0.43
896 0.35
897 0.3
898 0.25
899 0.23
900 0.19
901 0.18
902 0.18
903 0.2
904 0.2
905 0.18
906 0.2
907 0.27
908 0.34
909 0.41
910 0.43
911 0.46
912 0.51