FuNGI

A0A1L9VRA8

Protein Details

Accession

A0A1L9VRA8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
171-210	SSQDSKSTSKPQKNKKAYGKKSPQEKKKKKEESSFQMPRE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
180-200	KPQKNKKAYGKKSPQEKKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MGTRTRPDSSFSRHYLTTSNFSGKHLLSTFNNGTNEPNNPPKPERPEPGIDDAPISSSDDEVEAGDRDIVDISDLEEDKELKAPEKQSLEDKLAESSAPARRSGRAPVSKQDGDDKLEVSSSQEKTRARTSSALDDRDNLIEMWGSSQHSKRRKGAQFSSQSRPSVSSVPSSQDSKSTSKPQKNKKAYGKKSPQEKKKKKEESSFQMPREIDMPSPPPSKTRANGKSPEFKNPPALPNGISSDNDPQFADVLDLPSQDDASPLSSPINTPSPPSSAFNFEFSQADEEITLPKKALCPMCKEEVDPEALMRFEAQPKQRFRDQMVFCESHQASSAEKEWKSKGYPTIDWDIFDERIRGYYDDLAKFLVPECSSYYRNLLDSAMKSGKAKNFRLTLSGGGLEDISCGYYGTRGSGKMLQAVTTHFAPQLRRLAAADNIVKTAGVAGYAQAVLVPELAVRLVKEDMNIDDDQSARQILRDSISIGEKLNAQLNDVVPVPELDEDKENVAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.48
3	0.46
4	0.44
5	0.4
6	0.42
7	0.38
8	0.39
9	0.43
10	0.37
11	0.38
12	0.33
13	0.33
14	0.28
15	0.36
16	0.38
17	0.38
18	0.4
19	0.34
20	0.37
21	0.36
22	0.38
23	0.35
24	0.41
25	0.4
26	0.44
27	0.5
28	0.54
29	0.6
30	0.64
31	0.65
32	0.61
33	0.64
34	0.63
35	0.65
36	0.59
37	0.5
38	0.43
39	0.37
40	0.31
41	0.25
42	0.21
43	0.14
44	0.11
45	0.11
46	0.1
47	0.11
48	0.09
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.08
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.11
61	0.11
62	0.11
63	0.12
64	0.13
65	0.13
66	0.18
67	0.18
68	0.16
69	0.21
70	0.23
71	0.28
72	0.31
73	0.32
74	0.34
75	0.38
76	0.39
77	0.36
78	0.35
79	0.3
80	0.27
81	0.24
82	0.19
83	0.2
84	0.23
85	0.21
86	0.23
87	0.24
88	0.26
89	0.29
90	0.35
91	0.4
92	0.42
93	0.45
94	0.49
95	0.56
96	0.55
97	0.54
98	0.53
99	0.47
100	0.42
101	0.39
102	0.32
103	0.24
104	0.23
105	0.22
106	0.19
107	0.23
108	0.21
109	0.22
110	0.27
111	0.28
112	0.31
113	0.39
114	0.37
115	0.33
116	0.36
117	0.37
118	0.42
119	0.46
120	0.46
121	0.4
122	0.39
123	0.38
124	0.34
125	0.31
126	0.21
127	0.15
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.13
134	0.18
135	0.25
136	0.33
137	0.39
138	0.45
139	0.53
140	0.6
141	0.65
142	0.67
143	0.69
144	0.72
145	0.72
146	0.73
147	0.68
148	0.61
149	0.53
150	0.48
151	0.4
152	0.34
153	0.29
154	0.25
155	0.22
156	0.24
157	0.26
158	0.26
159	0.24
160	0.23
161	0.26
162	0.26
163	0.29
164	0.36
165	0.42
166	0.49
167	0.58
168	0.65
169	0.72
170	0.77
171	0.82
172	0.83
173	0.85
174	0.84
175	0.86
176	0.86
177	0.81
178	0.83
179	0.83
180	0.83
181	0.83
182	0.85
183	0.84
184	0.85
185	0.89
186	0.86
187	0.86
188	0.85
189	0.82
190	0.83
191	0.81
192	0.71
193	0.66
194	0.58
195	0.49
196	0.41
197	0.33
198	0.22
199	0.17
200	0.19
201	0.17
202	0.2
203	0.2
204	0.2
205	0.23
206	0.27
207	0.29
208	0.36
209	0.39
210	0.43
211	0.5
212	0.53
213	0.58
214	0.56
215	0.61
216	0.55
217	0.49
218	0.49
219	0.45
220	0.43
221	0.36
222	0.35
223	0.27
224	0.25
225	0.26
226	0.2
227	0.17
228	0.16
229	0.2
230	0.19
231	0.19
232	0.17
233	0.14
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.06
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.07
253	0.09
254	0.12
255	0.11
256	0.12
257	0.13
258	0.15
259	0.17
260	0.19
261	0.18
262	0.2
263	0.21
264	0.22
265	0.22
266	0.2
267	0.19
268	0.18
269	0.18
270	0.13
271	0.12
272	0.09
273	0.08
274	0.1
275	0.11
276	0.11
277	0.09
278	0.09
279	0.11
280	0.15
281	0.2
282	0.21
283	0.26
284	0.3
285	0.35
286	0.35
287	0.34
288	0.32
289	0.28
290	0.27
291	0.21
292	0.17
293	0.12
294	0.12
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.11
299	0.16
300	0.23
301	0.3
302	0.34
303	0.39
304	0.43
305	0.44
306	0.45
307	0.5
308	0.45
309	0.44
310	0.46
311	0.43
312	0.38
313	0.44
314	0.39
315	0.3
316	0.29
317	0.23
318	0.18
319	0.19
320	0.23
321	0.2
322	0.21
323	0.24
324	0.24
325	0.27
326	0.29
327	0.31
328	0.33
329	0.32
330	0.34
331	0.35
332	0.41
333	0.38
334	0.36
335	0.34
336	0.3
337	0.26
338	0.24
339	0.21
340	0.13
341	0.14
342	0.15
343	0.14
344	0.13
345	0.17
346	0.22
347	0.22
348	0.23
349	0.22
350	0.2
351	0.2
352	0.19
353	0.18
354	0.12
355	0.12
356	0.16
357	0.19
358	0.21
359	0.22
360	0.25
361	0.22
362	0.23
363	0.22
364	0.2
365	0.2
366	0.2
367	0.24
368	0.23
369	0.23
370	0.23
371	0.28
372	0.32
373	0.36
374	0.39
375	0.4
376	0.42
377	0.42
378	0.44
379	0.4
380	0.36
381	0.3
382	0.27
383	0.2
384	0.16
385	0.15
386	0.12
387	0.1
388	0.08
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.09
396	0.11
397	0.12
398	0.15
399	0.2
400	0.2
401	0.24
402	0.24
403	0.23
404	0.22
405	0.23
406	0.23
407	0.2
408	0.2
409	0.17
410	0.2
411	0.2
412	0.25
413	0.3
414	0.28
415	0.28
416	0.28
417	0.29
418	0.29
419	0.34
420	0.32
421	0.26
422	0.25
423	0.24
424	0.23
425	0.19
426	0.18
427	0.11
428	0.07
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.08
445	0.1
446	0.11
447	0.12
448	0.14
449	0.15
450	0.19
451	0.19
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.17
457	0.17
458	0.12
459	0.13
460	0.15
461	0.16
462	0.17
463	0.18
464	0.18
465	0.2
466	0.23
467	0.23
468	0.21
469	0.21
470	0.21
471	0.22
472	0.27
473	0.23
474	0.22
475	0.24
476	0.24
477	0.25
478	0.23
479	0.22
480	0.16
481	0.16
482	0.15
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.17
487	0.18

A0A1L9VRA8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer