Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9VFI1

Protein Details
Accession A0A1L9VFI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-36VSVVRLKKGKKRFELACYKNKLHydrophilic
241-266GGGSSKPKNKKGGKGNKKSRKGDSDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-261KEEPSSGGGSSKPKNKKGGKGNKKSRK
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 11.833, nucl 7, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036786  Ribosome_mat_SBDS_N_sf  
IPR039100  Sdo1/SBDS-like  
IPR046928  SDO1/SBDS_C  
IPR018978  SDO1/SBDS_central  
IPR037188  Sdo1/SBDS_central_sf  
IPR019783  SDO1/SBDS_N  
Gene Ontology GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01172  SBDS  
PF20268  SBDS_C  
PF09377  SBDS_domain_II  
Amino Acid Sequences MPINQPSNQIKFTNVSVVRLKKGKKRFELACYKNKLLEYRSGAEKDLDNVLQVPTIFLSVSKAQTAPSAELSKSFGPSVPQDEIRQEILRKGEVQVGERERKDIQERVEKEMLDIVSGRLVDPGTKRVYTSGMISKALDQLSSASGQQAQVQSAEAEAASEEGRPAAPRKPLWRGVDPNKSAKSQALEAMKALIAWQPIPVMRARMRLRITCPVNLLKQAIKAAPGANDGGANKKEEPSSGGGSSKPKNKKGGKGNKKSRKGDSDDEFDPPAPPAKESKQSAKDSDAETPTKQPGTVKDKILSYIESVETQEVIGGDEWEVVGFADPGAYKGLNEFVSNETRGRGRVEVLDMTVTQEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.38
4 0.42
5 0.46
6 0.5
7 0.55
8 0.54
9 0.63
10 0.68
11 0.69
12 0.74
13 0.74
14 0.77
15 0.81
16 0.8
17 0.81
18 0.78
19 0.72
20 0.67
21 0.63
22 0.58
23 0.51
24 0.51
25 0.47
26 0.44
27 0.48
28 0.45
29 0.43
30 0.4
31 0.38
32 0.31
33 0.29
34 0.24
35 0.18
36 0.18
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.11
46 0.13
47 0.15
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.19
52 0.21
53 0.19
54 0.21
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.25
59 0.23
60 0.22
61 0.21
62 0.17
63 0.17
64 0.19
65 0.23
66 0.23
67 0.24
68 0.24
69 0.26
70 0.27
71 0.28
72 0.28
73 0.24
74 0.24
75 0.24
76 0.24
77 0.23
78 0.22
79 0.23
80 0.22
81 0.23
82 0.27
83 0.31
84 0.36
85 0.35
86 0.37
87 0.33
88 0.36
89 0.38
90 0.35
91 0.35
92 0.38
93 0.4
94 0.45
95 0.47
96 0.42
97 0.38
98 0.37
99 0.31
100 0.22
101 0.2
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.15
111 0.16
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.17
117 0.2
118 0.21
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.21
124 0.2
125 0.16
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.1
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.08
153 0.11
154 0.15
155 0.17
156 0.22
157 0.28
158 0.35
159 0.39
160 0.43
161 0.47
162 0.51
163 0.57
164 0.55
165 0.55
166 0.5
167 0.46
168 0.41
169 0.35
170 0.29
171 0.21
172 0.22
173 0.19
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.12
179 0.11
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.11
189 0.12
190 0.21
191 0.22
192 0.28
193 0.31
194 0.33
195 0.36
196 0.41
197 0.42
198 0.36
199 0.37
200 0.34
201 0.33
202 0.32
203 0.3
204 0.22
205 0.21
206 0.21
207 0.18
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.1
215 0.12
216 0.11
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.18
225 0.17
226 0.19
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.25
231 0.29
232 0.35
233 0.39
234 0.41
235 0.5
236 0.55
237 0.62
238 0.68
239 0.74
240 0.76
241 0.8
242 0.86
243 0.87
244 0.9
245 0.88
246 0.85
247 0.82
248 0.78
249 0.75
250 0.7
251 0.65
252 0.57
253 0.53
254 0.46
255 0.38
256 0.32
257 0.24
258 0.24
259 0.19
260 0.18
261 0.21
262 0.24
263 0.32
264 0.36
265 0.44
266 0.47
267 0.51
268 0.53
269 0.52
270 0.51
271 0.46
272 0.48
273 0.43
274 0.38
275 0.35
276 0.36
277 0.35
278 0.32
279 0.3
280 0.27
281 0.31
282 0.36
283 0.4
284 0.4
285 0.4
286 0.41
287 0.43
288 0.42
289 0.34
290 0.28
291 0.25
292 0.22
293 0.19
294 0.19
295 0.17
296 0.15
297 0.14
298 0.13
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.15
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.18
324 0.23
325 0.25
326 0.24
327 0.23
328 0.24
329 0.26
330 0.27
331 0.25
332 0.23
333 0.25
334 0.29
335 0.28
336 0.27
337 0.28
338 0.24