FuNGI

A0A1L9Q5F7

Protein Details

Accession

A0A1L9Q5F7

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-40	QPLRIRRPRVADPLVRPKRKT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-43	RPRVADPLVRPKRKTATK
403-426	KEKREKEARRVLGKKVRKALQKRE

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTTPTNKPTPQMPTGSSGTQPLRIRRPRVADPLVRPKRKTATKGPLGDGQKLRSFPTRPAPPNAQPDRPNIPPAKSEFASNGFSGPLLSQSYVDYPLVITKRAIKEGLKHHVARFASKKVVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRSRIHELNTEKGPGGQRLSSETSNQVDELEREDMEARKAAREKERADNLAQIAPSIGSAPKRTNIPKQKTQQVSKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNVWVGNYEAALSETHAIFILESTGKMTMIPVEKWYRFNAKHQFKTLTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQRRELEQFAKQRKVYAGKQGTPAAEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKTAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEEEELKEKREKEARRVLGKKVRKALQKREKNFDYSSGSDANPYTDEESSDETDAEKSKEEERKVEEERNKKDPATPSKGNTTPSGRPKHFDTSKKAAIGVSRKRLGSPNVSDASGTDTSRKNGKSKPSTSQSSTQPGSRPMTPVTSSVPTNKKRVRGTFPGAGSASDIDVGSGGEVSESGKSKKLKPNPPSVVSQGETPQRSRAGSPTSVTGRNLSGSRASSPESLRGSHVTGQNRVSTPGPSTTQSFPSPAEIHAAIPQSGILSTDLLKIFRPRIGESRENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGPWRET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.46
3	0.4
4	0.39
5	0.36
6	0.38
7	0.41
8	0.43
9	0.5
10	0.56
11	0.61
12	0.63
13	0.68
14	0.69
15	0.73
16	0.74
17	0.72
18	0.73
19	0.78
20	0.8
21	0.8
22	0.74
23	0.72
24	0.74
25	0.74
26	0.73
27	0.72
28	0.72
29	0.74
30	0.78
31	0.75
32	0.73
33	0.67
34	0.68
35	0.61
36	0.56
37	0.51
38	0.46
39	0.46
40	0.45
41	0.44
42	0.42
43	0.48
44	0.53
45	0.53
46	0.59
47	0.64
48	0.64
49	0.72
50	0.73
51	0.71
52	0.65
53	0.66
54	0.65
55	0.6
56	0.6
57	0.54
58	0.5
59	0.48
60	0.49
61	0.49
62	0.43
63	0.42
64	0.37
65	0.37
66	0.36
67	0.31
68	0.27
69	0.19
70	0.19
71	0.17
72	0.14
73	0.12
74	0.11
75	0.11
76	0.11
77	0.12
78	0.14
79	0.16
80	0.16
81	0.13
82	0.12
83	0.18
84	0.19
85	0.18
86	0.18
87	0.23
88	0.27
89	0.3
90	0.33
91	0.3
92	0.36
93	0.44
94	0.51
95	0.51
96	0.5
97	0.49
98	0.52
99	0.51
100	0.51
101	0.47
102	0.43
103	0.43
104	0.41
105	0.46
106	0.49
107	0.56
108	0.52
109	0.51
110	0.5
111	0.53
112	0.55
113	0.5
114	0.46
115	0.46
116	0.43
117	0.45
118	0.45
119	0.45
120	0.52
121	0.58
122	0.63
123	0.65
124	0.75
125	0.79
126	0.79
127	0.79
128	0.77
129	0.77
130	0.73
131	0.68
132	0.66
133	0.61
134	0.62
135	0.55
136	0.49
137	0.41
138	0.38
139	0.36
140	0.3
141	0.28
142	0.23
143	0.21
144	0.24
145	0.29
146	0.26
147	0.26
148	0.26
149	0.25
150	0.25
151	0.24
152	0.2
153	0.17
154	0.16
155	0.17
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.18
163	0.15
164	0.19
165	0.23
166	0.28
167	0.34
168	0.4
169	0.43
170	0.49
171	0.55
172	0.53
173	0.51
174	0.49
175	0.43
176	0.38
177	0.34
178	0.24
179	0.18
180	0.15
181	0.13
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.12
186	0.14
187	0.16
188	0.22
189	0.27
190	0.36
191	0.45
192	0.51
193	0.58
194	0.64
195	0.71
196	0.74
197	0.76
198	0.73
199	0.69
200	0.67
201	0.6
202	0.56
203	0.49
204	0.41
205	0.38
206	0.32
207	0.26
208	0.24
209	0.24
210	0.23
211	0.23
212	0.24
213	0.22
214	0.21
215	0.22
216	0.19
217	0.2
218	0.25
219	0.26
220	0.28
221	0.27
222	0.27
223	0.26
224	0.24
225	0.22
226	0.18
227	0.18
228	0.18
229	0.19
230	0.18
231	0.18
232	0.18
233	0.18
234	0.16
235	0.13
236	0.09
237	0.08
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.1
260	0.11
261	0.14
262	0.2
263	0.21
264	0.23
265	0.26
266	0.31
267	0.3
268	0.38
269	0.45
270	0.49
271	0.52
272	0.54
273	0.55
274	0.47
275	0.51
276	0.44
277	0.36
278	0.28
279	0.26
280	0.22
281	0.19
282	0.19
283	0.14
284	0.14
285	0.13
286	0.17
287	0.15
288	0.21
289	0.29
290	0.38
291	0.45
292	0.49
293	0.5
294	0.54
295	0.56
296	0.52
297	0.54
298	0.48
299	0.44
300	0.48
301	0.52
302	0.47
303	0.49
304	0.51
305	0.42
306	0.4
307	0.41
308	0.34
309	0.29
310	0.31
311	0.36
312	0.36
313	0.4
314	0.39
315	0.37
316	0.39
317	0.42
318	0.39
319	0.41
320	0.4
321	0.37
322	0.4
323	0.41
324	0.37
325	0.31
326	0.29
327	0.19
328	0.13
329	0.1
330	0.08
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.05
356	0.04
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.09
362	0.12
363	0.16
364	0.19
365	0.25
366	0.32
367	0.36
368	0.44
369	0.49
370	0.54
371	0.54
372	0.51
373	0.47
374	0.42
375	0.38
376	0.31
377	0.26
378	0.19
379	0.17
380	0.17
381	0.16
382	0.14
383	0.14
384	0.15
385	0.16
386	0.15
387	0.16
388	0.18
389	0.19
390	0.23
391	0.23
392	0.26
393	0.31
394	0.33
395	0.39
396	0.46
397	0.51
398	0.56
399	0.59
400	0.62
401	0.63
402	0.67
403	0.64
404	0.62
405	0.62
406	0.61
407	0.66
408	0.69
409	0.7
410	0.73
411	0.73
412	0.75
413	0.71
414	0.68
415	0.6
416	0.54
417	0.48
418	0.4
419	0.37
420	0.3
421	0.27
422	0.23
423	0.22
424	0.18
425	0.14
426	0.13
427	0.12
428	0.1
429	0.11
430	0.11
431	0.13
432	0.14
433	0.13
434	0.13
435	0.11
436	0.12
437	0.13
438	0.13
439	0.11
440	0.11
441	0.18
442	0.24
443	0.25
444	0.28
445	0.31
446	0.37
447	0.4
448	0.47
449	0.48
450	0.51
451	0.55
452	0.57
453	0.55
454	0.49
455	0.5
456	0.51
457	0.52
458	0.52
459	0.5
460	0.47
461	0.52
462	0.54
463	0.51
464	0.47
465	0.43
466	0.42
467	0.46
468	0.52
469	0.46
470	0.46
471	0.49
472	0.55
473	0.57
474	0.56
475	0.56
476	0.56
477	0.59
478	0.57
479	0.53
480	0.44
481	0.42
482	0.44
483	0.43
484	0.43
485	0.42
486	0.41
487	0.42
488	0.46
489	0.45
490	0.43
491	0.4
492	0.39
493	0.36
494	0.36
495	0.34
496	0.3
497	0.31
498	0.25
499	0.21
500	0.19
501	0.19
502	0.21
503	0.28
504	0.3
505	0.3
506	0.34
507	0.44
508	0.49
509	0.53
510	0.59
511	0.61
512	0.65
513	0.64
514	0.65
515	0.6
516	0.58
517	0.55
518	0.49
519	0.44
520	0.43
521	0.42
522	0.37
523	0.34
524	0.29
525	0.31
526	0.29
527	0.28
528	0.26
529	0.26
530	0.25
531	0.31
532	0.38
533	0.38
534	0.46
535	0.49
536	0.53
537	0.58
538	0.64
539	0.64
540	0.63
541	0.66
542	0.64
543	0.6
544	0.57
545	0.49
546	0.42
547	0.35
548	0.27
549	0.2
550	0.13
551	0.12
552	0.07
553	0.07
554	0.06
555	0.05
556	0.05
557	0.04
558	0.03
559	0.04
560	0.05
561	0.07
562	0.1
563	0.12
564	0.17
565	0.21
566	0.3
567	0.39
568	0.49
569	0.56
570	0.62
571	0.71
572	0.74
573	0.74
574	0.71
575	0.66
576	0.61
577	0.52
578	0.47
579	0.41
580	0.4
581	0.39
582	0.35
583	0.35
584	0.33
585	0.33
586	0.32
587	0.32
588	0.31
589	0.32
590	0.32
591	0.34
592	0.36
593	0.38
594	0.37
595	0.34
596	0.29
597	0.29
598	0.28
599	0.24
600	0.23
601	0.22
602	0.23
603	0.23
604	0.25
605	0.26
606	0.27
607	0.32
608	0.3
609	0.3
610	0.3
611	0.31
612	0.31
613	0.32
614	0.36
615	0.35
616	0.37
617	0.39
618	0.41
619	0.4
620	0.39
621	0.35
622	0.31
623	0.29
624	0.29
625	0.29
626	0.26
627	0.29
628	0.29
629	0.33
630	0.33
631	0.32
632	0.28
633	0.31
634	0.3
635	0.27
636	0.28
637	0.24
638	0.23
639	0.25
640	0.26
641	0.2
642	0.18
643	0.18
644	0.14
645	0.13
646	0.13
647	0.09
648	0.09
649	0.1
650	0.14
651	0.16
652	0.16
653	0.19
654	0.23
655	0.25
656	0.26
657	0.29
658	0.29
659	0.36
660	0.43
661	0.49
662	0.48
663	0.57
664	0.65
665	0.65
666	0.63
667	0.55
668	0.49
669	0.43
670	0.47
671	0.45
672	0.37
673	0.36
674	0.35
675	0.36
676	0.34
677	0.33
678	0.25
679	0.19
680	0.18
681	0.19
682	0.21
683	0.22
684	0.23
685	0.29
686	0.31
687	0.32
688	0.4

A0A1L9Q5F7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer