Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NEH2

Protein Details
Accession C0NEH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-85NGANNRQPMRPRKEAQRPGDSAHydrophilic
402-422EDPRHRNKPPSPKTRRRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-417RNKPPSPKTRR
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 11, cyto_mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MATAVSTKLPAPKIKRPPPSYIQTGINGAKPSQPSPSPLGSASNRASLAKQPGSVTPISATAANGANNRQPMRPRKEAQRPGDSASRLQRLPIKHPGADGATTDRNQLKRFPEPYVKTTSYILKKYSKVPPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKIFMKHLKAGTVPHDMIEELVRCGVRFYENCLIVRVVDHKSISTQSNPSSNSNSGEKSSPFSLHNYNQHITPSPFVPYPQQNQSKIKRTTNGSSTGSSHKADEQPVPETSSDTVVPNGVKAGSSNSKQPAMKPKVFTTVLHPTPQSLLAELTLLSMTPDPRVNRRQSQAYPASRTGSAVQTPSISALPSSPISDRPPPAKRQKMMVEPSELLEAEAKLIHATAPPLYLEPVDSLTASASLLKFLEDPRHRNKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLGPSTSGNAGGAKPNVDDESGAAPFEPRFSRFKTLEKIRHEHEEKAKIEHEKKLQQDHAKRLQQEAEKEKRRATEQRLAEEQSREDKRRAQMAAAAAHHAQVQAHAQLLVAQNRARSQSRGNPAMGIPHQPQPRQMVPASQGQQSSPPVRNVTPHSSSPLAGNLMGPQMNQGVPMAITGSSQGVGSPLQVTSGVQHSHPAVMAHPMVNTRSQQGQSRHGTPQMGQGTPAIPHATPIMRNATPTQRMTHASPSASTMAQTPVMNHPIMANPQMNGVMMTPQQQQQAILQQRQQLIMQRNLQAQAGAQQFTPQQMAQLQLQANMHAQQSIQHAQPPQHPNIFMQQQAQTQAQQQQQIQQQQQIQQQQQTQQQAQQQQTQPQQVQQNQFPNAAAYQAHVMRSQLAQLQMSQAQAPHGQQQGSPQQLPPQQAMPQASGVVGQGQGALPPRYRLLYTQRMLPQAQNEVRAKLIQQFGHPSGWHDAVRQQFQEQVEKIAKQYLFDFMKREGQQRAQQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAIQHQQQQQQQQGMMSNSIAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.75
3 0.74
4 0.78
5 0.78
6 0.78
7 0.74
8 0.69
9 0.64
10 0.56
11 0.57
12 0.51
13 0.47
14 0.41
15 0.35
16 0.35
17 0.33
18 0.32
19 0.32
20 0.32
21 0.32
22 0.35
23 0.38
24 0.36
25 0.34
26 0.39
27 0.35
28 0.4
29 0.37
30 0.36
31 0.34
32 0.32
33 0.33
34 0.33
35 0.39
36 0.34
37 0.35
38 0.33
39 0.34
40 0.37
41 0.36
42 0.31
43 0.23
44 0.21
45 0.2
46 0.19
47 0.16
48 0.15
49 0.17
50 0.18
51 0.19
52 0.21
53 0.24
54 0.29
55 0.31
56 0.33
57 0.4
58 0.47
59 0.53
60 0.6
61 0.63
62 0.68
63 0.77
64 0.82
65 0.82
66 0.81
67 0.76
68 0.72
69 0.72
70 0.64
71 0.59
72 0.57
73 0.55
74 0.45
75 0.45
76 0.46
77 0.43
78 0.48
79 0.51
80 0.49
81 0.44
82 0.45
83 0.45
84 0.42
85 0.39
86 0.33
87 0.29
88 0.28
89 0.27
90 0.32
91 0.33
92 0.34
93 0.35
94 0.39
95 0.39
96 0.43
97 0.46
98 0.49
99 0.54
100 0.56
101 0.58
102 0.61
103 0.57
104 0.5
105 0.5
106 0.51
107 0.48
108 0.47
109 0.48
110 0.46
111 0.47
112 0.52
113 0.59
114 0.57
115 0.55
116 0.55
117 0.58
118 0.58
119 0.6
120 0.57
121 0.5
122 0.49
123 0.47
124 0.46
125 0.42
126 0.38
127 0.39
128 0.36
129 0.35
130 0.33
131 0.33
132 0.39
133 0.36
134 0.39
135 0.37
136 0.4
137 0.38
138 0.34
139 0.34
140 0.28
141 0.27
142 0.22
143 0.21
144 0.18
145 0.21
146 0.24
147 0.28
148 0.28
149 0.31
150 0.31
151 0.31
152 0.31
153 0.31
154 0.32
155 0.33
156 0.3
157 0.26
158 0.26
159 0.23
160 0.22
161 0.22
162 0.18
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.16
170 0.15
171 0.22
172 0.28
173 0.31
174 0.32
175 0.33
176 0.32
177 0.27
178 0.28
179 0.25
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.21
185 0.24
186 0.24
187 0.24
188 0.25
189 0.25
190 0.31
191 0.33
192 0.34
193 0.36
194 0.35
195 0.35
196 0.34
197 0.33
198 0.29
199 0.29
200 0.27
201 0.26
202 0.26
203 0.25
204 0.23
205 0.26
206 0.3
207 0.33
208 0.39
209 0.41
210 0.4
211 0.39
212 0.39
213 0.39
214 0.34
215 0.3
216 0.24
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.32
223 0.39
224 0.45
225 0.48
226 0.56
227 0.64
228 0.67
229 0.68
230 0.68
231 0.65
232 0.63
233 0.64
234 0.6
235 0.58
236 0.51
237 0.46
238 0.44
239 0.42
240 0.4
241 0.34
242 0.3
243 0.28
244 0.28
245 0.29
246 0.3
247 0.27
248 0.27
249 0.28
250 0.29
251 0.24
252 0.22
253 0.2
254 0.18
255 0.17
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.13
266 0.16
267 0.18
268 0.23
269 0.25
270 0.31
271 0.31
272 0.36
273 0.41
274 0.44
275 0.48
276 0.47
277 0.46
278 0.48
279 0.49
280 0.45
281 0.41
282 0.42
283 0.4
284 0.38
285 0.36
286 0.29
287 0.29
288 0.3
289 0.23
290 0.14
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.12
303 0.14
304 0.21
305 0.29
306 0.35
307 0.4
308 0.45
309 0.51
310 0.49
311 0.56
312 0.59
313 0.57
314 0.55
315 0.5
316 0.48
317 0.4
318 0.39
319 0.32
320 0.26
321 0.22
322 0.17
323 0.16
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.12
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.09
332 0.09
333 0.11
334 0.1
335 0.13
336 0.17
337 0.22
338 0.24
339 0.29
340 0.34
341 0.41
342 0.51
343 0.56
344 0.54
345 0.57
346 0.6
347 0.61
348 0.61
349 0.56
350 0.5
351 0.42
352 0.41
353 0.35
354 0.28
355 0.2
356 0.15
357 0.12
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.17
389 0.2
390 0.26
391 0.33
392 0.42
393 0.43
394 0.49
395 0.56
396 0.58
397 0.64
398 0.69
399 0.73
400 0.74
401 0.79
402 0.82
403 0.82
404 0.76
405 0.72
406 0.65
407 0.62
408 0.54
409 0.48
410 0.4
411 0.32
412 0.27
413 0.2
414 0.16
415 0.07
416 0.05
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.1
456 0.09
457 0.1
458 0.13
459 0.16
460 0.22
461 0.24
462 0.28
463 0.34
464 0.42
465 0.47
466 0.5
467 0.51
468 0.47
469 0.54
470 0.52
471 0.49
472 0.47
473 0.48
474 0.42
475 0.42
476 0.43
477 0.4
478 0.4
479 0.4
480 0.39
481 0.36
482 0.38
483 0.41
484 0.43
485 0.45
486 0.49
487 0.51
488 0.55
489 0.53
490 0.51
491 0.48
492 0.47
493 0.43
494 0.43
495 0.43
496 0.44
497 0.47
498 0.48
499 0.48
500 0.45
501 0.47
502 0.48
503 0.46
504 0.45
505 0.41
506 0.44
507 0.45
508 0.44
509 0.42
510 0.36
511 0.3
512 0.3
513 0.31
514 0.29
515 0.28
516 0.31
517 0.31
518 0.36
519 0.35
520 0.28
521 0.26
522 0.27
523 0.29
524 0.24
525 0.23
526 0.17
527 0.17
528 0.16
529 0.13
530 0.1
531 0.07
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.09
538 0.11
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.14
543 0.16
544 0.19
545 0.17
546 0.17
547 0.2
548 0.26
549 0.32
550 0.34
551 0.33
552 0.31
553 0.3
554 0.32
555 0.29
556 0.25
557 0.21
558 0.24
559 0.27
560 0.26
561 0.29
562 0.3
563 0.31
564 0.3
565 0.28
566 0.25
567 0.24
568 0.31
569 0.3
570 0.27
571 0.26
572 0.22
573 0.25
574 0.25
575 0.27
576 0.23
577 0.23
578 0.23
579 0.23
580 0.27
581 0.29
582 0.32
583 0.31
584 0.29
585 0.3
586 0.29
587 0.29
588 0.26
589 0.23
590 0.17
591 0.13
592 0.13
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.11
626 0.12
627 0.12
628 0.13
629 0.12
630 0.09
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.12
637 0.14
638 0.14
639 0.13
640 0.17
641 0.18
642 0.25
643 0.28
644 0.35
645 0.37
646 0.41
647 0.41
648 0.4
649 0.39
650 0.33
651 0.37
652 0.32
653 0.28
654 0.24
655 0.22
656 0.21
657 0.2
658 0.2
659 0.14
660 0.09
661 0.1
662 0.12
663 0.12
664 0.12
665 0.14
666 0.19
667 0.17
668 0.19
669 0.22
670 0.26
671 0.3
672 0.31
673 0.31
674 0.28
675 0.31
676 0.32
677 0.36
678 0.32
679 0.28
680 0.26
681 0.27
682 0.25
683 0.22
684 0.2
685 0.15
686 0.13
687 0.15
688 0.15
689 0.14
690 0.16
691 0.19
692 0.19
693 0.17
694 0.17
695 0.16
696 0.18
697 0.2
698 0.16
699 0.14
700 0.15
701 0.15
702 0.14
703 0.12
704 0.11
705 0.09
706 0.09
707 0.12
708 0.13
709 0.16
710 0.18
711 0.17
712 0.18
713 0.18
714 0.26
715 0.29
716 0.3
717 0.31
718 0.34
719 0.35
720 0.36
721 0.36
722 0.34
723 0.34
724 0.36
725 0.38
726 0.37
727 0.38
728 0.38
729 0.36
730 0.29
731 0.23
732 0.24
733 0.22
734 0.19
735 0.16
736 0.17
737 0.17
738 0.18
739 0.2
740 0.13
741 0.13
742 0.13
743 0.16
744 0.15
745 0.2
746 0.19
747 0.2
748 0.21
749 0.2
750 0.2
751 0.19
752 0.19
753 0.14
754 0.13
755 0.13
756 0.18
757 0.21
758 0.2
759 0.22
760 0.24
761 0.27
762 0.36
763 0.39
764 0.38
765 0.39
766 0.39
767 0.36
768 0.42
769 0.42
770 0.35
771 0.33
772 0.31
773 0.3
774 0.32
775 0.32
776 0.26
777 0.27
778 0.33
779 0.32
780 0.34
781 0.33
782 0.36
783 0.41
784 0.47
785 0.46
786 0.44
787 0.45
788 0.46
789 0.52
790 0.53
791 0.5
792 0.48
793 0.49
794 0.5
795 0.52
796 0.53
797 0.49
798 0.46
799 0.48
800 0.5
801 0.5
802 0.52
803 0.5
804 0.51
805 0.55
806 0.57
807 0.52
808 0.51
809 0.55
810 0.54
811 0.56
812 0.55
813 0.56
814 0.51
815 0.51
816 0.45
817 0.39
818 0.32
819 0.27
820 0.2
821 0.13
822 0.15
823 0.16
824 0.17
825 0.16
826 0.17
827 0.17
828 0.17
829 0.18
830 0.17
831 0.17
832 0.17
833 0.17
834 0.2
835 0.2
836 0.2
837 0.19
838 0.16
839 0.16
840 0.18
841 0.19
842 0.22
843 0.23
844 0.23
845 0.23
846 0.3
847 0.35
848 0.38
849 0.39
850 0.34
851 0.38
852 0.41
853 0.44
854 0.39
855 0.34
856 0.32
857 0.35
858 0.36
859 0.31
860 0.28
861 0.25
862 0.22
863 0.19
864 0.16
865 0.12
866 0.1
867 0.08
868 0.08
869 0.07
870 0.09
871 0.13
872 0.15
873 0.15
874 0.17
875 0.19
876 0.21
877 0.22
878 0.26
879 0.3
880 0.38
881 0.38
882 0.45
883 0.48
884 0.5
885 0.51
886 0.49
887 0.45
888 0.45
889 0.46
890 0.46
891 0.43
892 0.4
893 0.4
894 0.38
895 0.35
896 0.32
897 0.35
898 0.29
899 0.3
900 0.36
901 0.37
902 0.4
903 0.38
904 0.35
905 0.34
906 0.36
907 0.33
908 0.27
909 0.3
910 0.34
911 0.39
912 0.37
913 0.33
914 0.35
915 0.37
916 0.43
917 0.38
918 0.38
919 0.37
920 0.37
921 0.37
922 0.39
923 0.37
924 0.3
925 0.3
926 0.32
927 0.32
928 0.32
929 0.35
930 0.31
931 0.4
932 0.42
933 0.46
934 0.44
935 0.48
936 0.53
937 0.59
938 0.61
939 0.57
940 0.57
941 0.56
942 0.54
943 0.51
944 0.46
945 0.38
946 0.34
947 0.32
948 0.28
949 0.28
950 0.23
951 0.21
952 0.2
953 0.22
954 0.21
955 0.21
956 0.21
957 0.21
958 0.21
959 0.23
960 0.26
961 0.27
962 0.32
963 0.36
964 0.41
965 0.44
966 0.52
967 0.53
968 0.54
969 0.51
970 0.48
971 0.47
972 0.43
973 0.38