Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9Q1A6

Protein Details
Accession A0A1L9Q1A6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-192RSVSMTTRGGRRWRRRGRGRRASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-192RGGRRWRRRGRGRRAS
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_nucl 8.333, cyto 7.5, nucl 7, cyto_pero 5.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MFPEHTPMLPVTKVYHGVNRKEFLLLMRRLETHFAEWPHYYTFNDNKIVEACRHLSEGIATKWVLIRLSPNNRRTWSDFCVWLSSNIRNFVNPDIAERRYQTVRQRPNQPVSRYAAMLGSLEANLPRLVTDYERCERLWEGVLPEVRNASQSGFPTSFHTGVSQLCAASRSVSMTTRGGRRWRRRGRGRRAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.32
3 0.36
4 0.43
5 0.48
6 0.47
7 0.44
8 0.41
9 0.4
10 0.36
11 0.38
12 0.33
13 0.31
14 0.31
15 0.32
16 0.32
17 0.35
18 0.32
19 0.26
20 0.28
21 0.26
22 0.27
23 0.27
24 0.27
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.24
29 0.28
30 0.29
31 0.33
32 0.31
33 0.29
34 0.3
35 0.31
36 0.27
37 0.25
38 0.23
39 0.19
40 0.2
41 0.18
42 0.16
43 0.16
44 0.19
45 0.16
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.14
52 0.1
53 0.14
54 0.2
55 0.31
56 0.38
57 0.42
58 0.46
59 0.48
60 0.52
61 0.51
62 0.49
63 0.43
64 0.37
65 0.35
66 0.31
67 0.32
68 0.28
69 0.27
70 0.24
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.2
76 0.21
77 0.19
78 0.19
79 0.16
80 0.16
81 0.17
82 0.18
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.19
87 0.23
88 0.28
89 0.34
90 0.41
91 0.47
92 0.55
93 0.58
94 0.65
95 0.68
96 0.63
97 0.58
98 0.54
99 0.49
100 0.4
101 0.34
102 0.26
103 0.19
104 0.16
105 0.12
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.1
117 0.13
118 0.18
119 0.21
120 0.22
121 0.23
122 0.23
123 0.23
124 0.23
125 0.23
126 0.18
127 0.18
128 0.21
129 0.24
130 0.22
131 0.22
132 0.21
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.2
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.28
144 0.26
145 0.23
146 0.23
147 0.19
148 0.19
149 0.21
150 0.17
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.21
162 0.27
163 0.31
164 0.37
165 0.44
166 0.53
167 0.62
168 0.7
169 0.77
170 0.82
171 0.88
172 0.92