FuNGI

A0A1L9PCB2

Protein Details

Accession

A0A1L9PCB2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
79-100	EPSKPTLKYKPRAVGRRSKEER	Basic
229-251	EDAVLDQKKKKKQQQHKGKTALG	Hydrophilic
344-365	GLLPAPKKKVRRKLDSREPSVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
57-106	KKRAPSGSIGPGPGPSAGPGPGEPSKPTLKYKPRAVGRRSKEEREAIEKL
123-140	RGKASMAARGRAGFAGRG
236-257	KKKKKQQQHKGKTALGSARDKG
349-356	PKKKVRRK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAGPRRGASSAPARNSNGGEPGSNPTPNTSASPAPTPAPGTTTRAPVQRLQSLKKRAPSGSIGPGPGPSAGPGPGEPSKPTLKYKPRAVGRRSKEEREAIEKLEAERHAERLAEAAAIQRGKASMAARGRAGFAGRGGRGGMMGMSGAAGPLGSGFAARRGRGGSRFGTGDSRGPSMSRRSKSMTTGATGGGGDGSASVSSDESDGELRVSIDRINLESDADDDEEDAVLDQKKKKKQQQHKGKTALGSARDKGLRPIRVERHEHEDRVVSVNMESSTAKPAEHREQAKGKAKDDDALFVQDDEETPTETETRVKQEPTDENDQTMMDVPHTEEPVTTDDGLLPAPKKKVRRKLDSREPSVPAVKDPKSLLRTKEDIEEYDRHAEDLELVKDLFTKEPPTKPNELTEEAEAGAETTTDEQGKEKAEEGEEAEPQDDKLTGQLFLMQFPPITPNLIEPNADGTNADGEATDTPNPAAPQGAGQNAEVNGAQSDIPGLKHEEEFEVLDGLEESTAARTQSKVVTAADWQLKAGQAGKLNVHASGRVTMDWGGISFELDRAAAVDFLQEALIASTPPNVTEDVVDDEHKVWAMGQLSGKFTVTPDWEKIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.57
3	0.53
4	0.51
5	0.51
6	0.47
7	0.42
8	0.35
9	0.31
10	0.27
11	0.31
12	0.31
13	0.31
14	0.29
15	0.26
16	0.27
17	0.28
18	0.29
19	0.27
20	0.26
21	0.27
22	0.31
23	0.3
24	0.29
25	0.29
26	0.29
27	0.25
28	0.26
29	0.25
30	0.28
31	0.29
32	0.33
33	0.36
34	0.38
35	0.4
36	0.42
37	0.46
38	0.47
39	0.51
40	0.53
41	0.58
42	0.63
43	0.66
44	0.67
45	0.67
46	0.62
47	0.6
48	0.58
49	0.54
50	0.54
51	0.51
52	0.45
53	0.4
54	0.38
55	0.34
56	0.29
57	0.23
58	0.15
59	0.13
60	0.12
61	0.13
62	0.12
63	0.17
64	0.2
65	0.21
66	0.22
67	0.25
68	0.3
69	0.33
70	0.4
71	0.44
72	0.51
73	0.57
74	0.65
75	0.7
76	0.73
77	0.78
78	0.8
79	0.8
80	0.78
81	0.81
82	0.79
83	0.76
84	0.74
85	0.7
86	0.67
87	0.64
88	0.59
89	0.51
90	0.48
91	0.43
92	0.37
93	0.36
94	0.32
95	0.29
96	0.27
97	0.26
98	0.23
99	0.22
100	0.2
101	0.16
102	0.16
103	0.11
104	0.1
105	0.11
106	0.14
107	0.13
108	0.13
109	0.12
110	0.12
111	0.12
112	0.15
113	0.14
114	0.16
115	0.2
116	0.23
117	0.24
118	0.24
119	0.25
120	0.22
121	0.23
122	0.17
123	0.15
124	0.18
125	0.16
126	0.16
127	0.16
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.1
132	0.05
133	0.05
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.02
141	0.03
142	0.03
143	0.02
144	0.03
145	0.04
146	0.1
147	0.13
148	0.14
149	0.15
150	0.17
151	0.21
152	0.24
153	0.28
154	0.24
155	0.24
156	0.25
157	0.25
158	0.26
159	0.24
160	0.25
161	0.23
162	0.22
163	0.2
164	0.19
165	0.21
166	0.27
167	0.34
168	0.32
169	0.34
170	0.38
171	0.41
172	0.44
173	0.47
174	0.4
175	0.33
176	0.32
177	0.28
178	0.24
179	0.2
180	0.16
181	0.1
182	0.08
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.03
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.06
219	0.08
220	0.12
221	0.17
222	0.24
223	0.32
224	0.41
225	0.49
226	0.58
227	0.67
228	0.74
229	0.81
230	0.85
231	0.87
232	0.85
233	0.79
234	0.7
235	0.64
236	0.56
237	0.5
238	0.43
239	0.33
240	0.31
241	0.29
242	0.28
243	0.3
244	0.32
245	0.31
246	0.31
247	0.39
248	0.42
249	0.47
250	0.51
251	0.47
252	0.49
253	0.49
254	0.46
255	0.39
256	0.33
257	0.28
258	0.27
259	0.24
260	0.16
261	0.12
262	0.13
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.08
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.15
272	0.2
273	0.26
274	0.27
275	0.3
276	0.34
277	0.42
278	0.5
279	0.48
280	0.44
281	0.42
282	0.4
283	0.39
284	0.34
285	0.28
286	0.2
287	0.19
288	0.17
289	0.13
290	0.12
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.1
301	0.1
302	0.14
303	0.15
304	0.16
305	0.16
306	0.21
307	0.26
308	0.28
309	0.34
310	0.3
311	0.28
312	0.28
313	0.27
314	0.22
315	0.19
316	0.14
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.07
324	0.09
325	0.11
326	0.12
327	0.11
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.08
334	0.1
335	0.14
336	0.18
337	0.27
338	0.35
339	0.46
340	0.54
341	0.63
342	0.7
343	0.77
344	0.84
345	0.85
346	0.83
347	0.78
348	0.71
349	0.64
350	0.57
351	0.47
352	0.39
353	0.36
354	0.31
355	0.28
356	0.27
357	0.3
358	0.31
359	0.35
360	0.35
361	0.34
362	0.35
363	0.34
364	0.38
365	0.33
366	0.3
367	0.3
368	0.3
369	0.27
370	0.29
371	0.28
372	0.22
373	0.21
374	0.19
375	0.16
376	0.17
377	0.15
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.12
384	0.1
385	0.14
386	0.18
387	0.24
388	0.27
389	0.32
390	0.36
391	0.37
392	0.41
393	0.41
394	0.4
395	0.37
396	0.34
397	0.29
398	0.24
399	0.22
400	0.17
401	0.12
402	0.08
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.08
410	0.1
411	0.12
412	0.13
413	0.13
414	0.14
415	0.14
416	0.15
417	0.17
418	0.17
419	0.16
420	0.16
421	0.15
422	0.13
423	0.12
424	0.12
425	0.1
426	0.07
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.15
435	0.13
436	0.12
437	0.12
438	0.14
439	0.1
440	0.12
441	0.11
442	0.13
443	0.17
444	0.18
445	0.18
446	0.16
447	0.2
448	0.19
449	0.18
450	0.16
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.06
456	0.07
457	0.08
458	0.1
459	0.1
460	0.1
461	0.1
462	0.12
463	0.12
464	0.12
465	0.11
466	0.09
467	0.11
468	0.13
469	0.15
470	0.15
471	0.15
472	0.17
473	0.16
474	0.17
475	0.15
476	0.13
477	0.1
478	0.1
479	0.09
480	0.06
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.1
485	0.13
486	0.14
487	0.15
488	0.16
489	0.16
490	0.17
491	0.17
492	0.16
493	0.14
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.09
498	0.07
499	0.06
500	0.05
501	0.06
502	0.08
503	0.08
504	0.09
505	0.09
506	0.12
507	0.15
508	0.17
509	0.18
510	0.18
511	0.19
512	0.2
513	0.26
514	0.28
515	0.26
516	0.24
517	0.23
518	0.23
519	0.23
520	0.24
521	0.2
522	0.2
523	0.23
524	0.24
525	0.27
526	0.27
527	0.27
528	0.25
529	0.23
530	0.21
531	0.21
532	0.21
533	0.16
534	0.17
535	0.16
536	0.16
537	0.14
538	0.13
539	0.11
540	0.1
541	0.11
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.08
547	0.07
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.07
559	0.06
560	0.07
561	0.1
562	0.1
563	0.11
564	0.12
565	0.12
566	0.13
567	0.13
568	0.16
569	0.17
570	0.19
571	0.2
572	0.2
573	0.2
574	0.2
575	0.19
576	0.17
577	0.12
578	0.14
579	0.15
580	0.17
581	0.21
582	0.23
583	0.25
584	0.26
585	0.27
586	0.23
587	0.22
588	0.24
589	0.25
590	0.28

A0A1L9PCB2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer