Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9Q4I5

Protein Details
Accession A0A1L9Q4I5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-73LAGVTETEKERKRKNKHKDEASSPSKKKRKQEKAEKADKKSKKDKSSKKSRDKTPAAASIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-66KERKRKNKHKDEASSPSKKKRKQEKAEKADKKSKKDKSSKKSRDK
399-406KKSKKAKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.333, nucl 13.5, cyto 13, mito_nucl 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAVDTMEIDSSPILAGVTETEKERKRKNKHKDEASSPSKKKRKQEKAEKADKKSKKDKSSKKSRDKTPAAASIPDSPYSLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYPPLEGIVLAYSNASISSEPPSSSSPSSSTSLNPQPLTLAASAGEYGVMYVYLTATFLVFRPQRGQTLEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPRTWKWIPPGEEDYAEDSGPTSNNTSAQTSEDEDDEKTSNSPPFDPAKEHFNPVPTASDSNPFASDTPDQDQDAIDAGTAERGGEGSDEDTYEGYFQSISGHRVRGTVKFRVVDIDVIPGSERDRGFLSIEGTMLSEDEEAKVVEDERNGVLPASSTPAVRKMTVPVSSGGIIVPQMEDVILETPSKKSKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.07
4 0.1
5 0.12
6 0.15
7 0.22
8 0.3
9 0.38
10 0.47
11 0.55
12 0.64
13 0.73
14 0.82
15 0.85
16 0.89
17 0.92
18 0.92
19 0.9
20 0.9
21 0.89
22 0.88
23 0.85
24 0.85
25 0.84
26 0.81
27 0.83
28 0.83
29 0.85
30 0.85
31 0.89
32 0.9
33 0.91
34 0.95
35 0.94
36 0.92
37 0.91
38 0.88
39 0.86
40 0.85
41 0.84
42 0.84
43 0.85
44 0.86
45 0.87
46 0.91
47 0.92
48 0.93
49 0.93
50 0.92
51 0.92
52 0.88
53 0.85
54 0.82
55 0.79
56 0.7
57 0.63
58 0.55
59 0.51
60 0.47
61 0.39
62 0.32
63 0.24
64 0.22
65 0.21
66 0.19
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.12
73 0.1
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.05
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.14
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.16
128 0.19
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.22
133 0.26
134 0.29
135 0.27
136 0.24
137 0.23
138 0.22
139 0.23
140 0.16
141 0.11
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.16
164 0.17
165 0.21
166 0.22
167 0.24
168 0.19
169 0.25
170 0.26
171 0.23
172 0.22
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.03
192 0.04
193 0.05
194 0.07
195 0.09
196 0.15
197 0.19
198 0.23
199 0.29
200 0.35
201 0.44
202 0.51
203 0.56
204 0.57
205 0.59
206 0.58
207 0.56
208 0.53
209 0.46
210 0.37
211 0.31
212 0.28
213 0.22
214 0.19
215 0.14
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.17
242 0.2
243 0.21
244 0.24
245 0.23
246 0.29
247 0.3
248 0.32
249 0.3
250 0.29
251 0.28
252 0.25
253 0.27
254 0.2
255 0.21
256 0.19
257 0.21
258 0.19
259 0.2
260 0.19
261 0.17
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.17
266 0.19
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.18
271 0.15
272 0.15
273 0.11
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.09
297 0.11
298 0.15
299 0.17
300 0.19
301 0.2
302 0.23
303 0.25
304 0.29
305 0.33
306 0.36
307 0.38
308 0.37
309 0.37
310 0.37
311 0.36
312 0.31
313 0.26
314 0.24
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.15
319 0.15
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.16
324 0.17
325 0.18
326 0.19
327 0.2
328 0.16
329 0.16
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.1
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.12
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.16
357 0.23
358 0.25
359 0.26
360 0.26
361 0.26
362 0.32
363 0.34
364 0.34
365 0.29
366 0.3
367 0.29
368 0.28
369 0.22
370 0.16
371 0.13
372 0.12
373 0.1
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.11
383 0.15
384 0.24
385 0.28
386 0.34