FuNGI

C0NBJ2

Protein Details

Accession

C0NBJ2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
547-566	SSPSSEPKTAKPRHPNHDHD	Hydrophilic
655-676	PEERANRKREELRKQLEARNKS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
355-367	KHKANIAGHPPKK
392-412	RHRSKSKGLGNIGGRHPPRRK
540-542	KKK
658-693	RANRKREELRKQLEARNKSGGTGPGVGGPAKKRRRF

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.833, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MSKWSKLQLPSDSPAPPLLYKYLTSKLGCEIYVTDLAHVWSQSLSRKDILKNASKYNTSIDPGEDEEQYFVFLQKISDALRGSEGNSLLLTSDPGGEKLKLLTSTKLPTPLVPLEWTFTLSQQPPNALAKHILLPILKGEANHEARILSLIGHVKQKDWTLNKLFDKIESSGVDLSMVFHGMGGVRLSRKESVYSQASQLIKGVAPFDENLWNNEYQAKDADYNLGVHIANELSFTSSFADRQIDDFAPDNWWNKLGTDSFGNARQTARKDKDQKKPVSEISPPPAEKGEASHSDDDEFQTMETPPRLRSPSRSKTKHDNLHKSPKSTGRSHVESDQDSVEESLETPTSSKNRSKHKANIAGHPPKKKVQASSSAETTASEEDGNCVRSASRHRSKSKGLGNIGGRHPPRRKQSLMELAGSTQSEAEYEAPTNPKTISKTKGSLWAIGGKKKTQRPFQESPIGSTASDISDAPGTTPNSNPTKQAVDNDTPTESENEGDQSASRPVQHTLPEPSVPTSSPPLKPQSRSRGIGPIGQIGGKKKQPEPSSPSSEPKTAKPRHPNHDHDGNGDERETPPEFLPGPAKLKHQGGRLGMIGGRGAPAASNSRKERSQSQEVPELSPPPKPAMTPGDSEQPRAELGEKKVEAKQEIKDETPEERANRKREELRKQLEARNKSGGTGPGVGGPAKKRRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.32
4	0.28
5	0.27
6	0.25
7	0.25
8	0.29
9	0.32
10	0.35
11	0.35
12	0.33
13	0.35
14	0.35
15	0.33
16	0.29
17	0.25
18	0.23
19	0.27
20	0.26
21	0.21
22	0.19
23	0.2
24	0.2
25	0.19
26	0.15
27	0.11
28	0.14
29	0.2
30	0.23
31	0.25
32	0.27
33	0.33
34	0.36
35	0.42
36	0.48
37	0.51
38	0.53
39	0.58
40	0.6
41	0.57
42	0.55
43	0.52
44	0.49
45	0.42
46	0.38
47	0.31
48	0.27
49	0.29
50	0.3
51	0.26
52	0.22
53	0.2
54	0.18
55	0.18
56	0.16
57	0.13
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.1
62	0.13
63	0.13
64	0.16
65	0.16
66	0.16
67	0.19
68	0.19
69	0.2
70	0.22
71	0.2
72	0.17
73	0.16
74	0.15
75	0.12
76	0.11
77	0.11
78	0.07
79	0.1
80	0.1
81	0.11
82	0.14
83	0.14
84	0.15
85	0.16
86	0.18
87	0.2
88	0.22
89	0.23
90	0.26
91	0.3
92	0.32
93	0.36
94	0.33
95	0.3
96	0.34
97	0.33
98	0.3
99	0.28
100	0.26
101	0.23
102	0.23
103	0.24
104	0.19
105	0.17
106	0.21
107	0.21
108	0.25
109	0.24
110	0.25
111	0.26
112	0.31
113	0.31
114	0.26
115	0.26
116	0.23
117	0.25
118	0.24
119	0.23
120	0.19
121	0.18
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.14
126	0.16
127	0.22
128	0.24
129	0.24
130	0.24
131	0.2
132	0.2
133	0.21
134	0.18
135	0.1
136	0.11
137	0.13
138	0.15
139	0.21
140	0.21
141	0.21
142	0.24
143	0.27
144	0.31
145	0.32
146	0.37
147	0.38
148	0.45
149	0.47
150	0.49
151	0.46
152	0.4
153	0.4
154	0.34
155	0.31
156	0.24
157	0.24
158	0.19
159	0.19
160	0.17
161	0.13
162	0.13
163	0.09
164	0.09
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.06
171	0.08
172	0.09
173	0.1
174	0.13
175	0.15
176	0.16
177	0.18
178	0.19
179	0.24
180	0.27
181	0.28
182	0.27
183	0.31
184	0.3
185	0.28
186	0.26
187	0.21
188	0.17
189	0.16
190	0.15
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.16
196	0.16
197	0.17
198	0.19
199	0.19
200	0.19
201	0.22
202	0.2
203	0.15
204	0.16
205	0.15
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.13
210	0.13
211	0.12
212	0.13
213	0.11
214	0.1
215	0.1
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.12
228	0.1
229	0.12
230	0.15
231	0.13
232	0.14
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.18
237	0.19
238	0.15
239	0.16
240	0.15
241	0.14
242	0.16
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.14
247	0.14
248	0.18
249	0.19
250	0.17
251	0.18
252	0.21
253	0.23
254	0.31
255	0.34
256	0.39
257	0.49
258	0.58
259	0.67
260	0.72
261	0.75
262	0.71
263	0.72
264	0.67
265	0.61
266	0.57
267	0.51
268	0.47
269	0.46
270	0.4
271	0.36
272	0.32
273	0.27
274	0.22
275	0.2
276	0.2
277	0.17
278	0.21
279	0.21
280	0.2
281	0.2
282	0.21
283	0.19
284	0.15
285	0.11
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.16
294	0.19
295	0.19
296	0.27
297	0.36
298	0.44
299	0.53
300	0.58
301	0.59
302	0.66
303	0.74
304	0.75
305	0.74
306	0.74
307	0.72
308	0.78
309	0.76
310	0.68
311	0.63
312	0.61
313	0.57
314	0.49
315	0.48
316	0.43
317	0.43
318	0.43
319	0.42
320	0.38
321	0.33
322	0.32
323	0.25
324	0.19
325	0.16
326	0.14
327	0.1
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.07
335	0.1
336	0.13
337	0.18
338	0.24
339	0.33
340	0.4
341	0.46
342	0.52
343	0.59
344	0.66
345	0.63
346	0.65
347	0.65
348	0.68
349	0.66
350	0.64
351	0.57
352	0.51
353	0.55
354	0.5
355	0.45
356	0.39
357	0.44
358	0.45
359	0.45
360	0.43
361	0.37
362	0.34
363	0.3
364	0.27
365	0.17
366	0.11
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.1
376	0.17
377	0.25
378	0.32
379	0.4
380	0.44
381	0.49
382	0.54
383	0.59
384	0.6
385	0.57
386	0.5
387	0.48
388	0.48
389	0.48
390	0.45
391	0.44
392	0.39
393	0.39
394	0.42
395	0.43
396	0.47
397	0.48
398	0.49
399	0.46
400	0.54
401	0.56
402	0.54
403	0.48
404	0.41
405	0.35
406	0.33
407	0.29
408	0.2
409	0.1
410	0.08
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.06
415	0.07
416	0.09
417	0.11
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.15
422	0.18
423	0.23
424	0.26
425	0.28
426	0.31
427	0.32
428	0.4
429	0.39
430	0.37
431	0.33
432	0.36
433	0.34
434	0.36
435	0.37
436	0.32
437	0.38
438	0.42
439	0.48
440	0.49
441	0.55
442	0.59
443	0.63
444	0.65
445	0.68
446	0.61
447	0.58
448	0.52
449	0.43
450	0.34
451	0.29
452	0.23
453	0.14
454	0.14
455	0.1
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.12
461	0.14
462	0.14
463	0.16
464	0.21
465	0.25
466	0.26
467	0.27
468	0.25
469	0.28
470	0.28
471	0.32
472	0.32
473	0.31
474	0.33
475	0.33
476	0.31
477	0.27
478	0.26
479	0.24
480	0.18
481	0.14
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.11
486	0.1
487	0.1
488	0.12
489	0.13
490	0.13
491	0.13
492	0.15
493	0.18
494	0.2
495	0.22
496	0.25
497	0.27
498	0.27
499	0.27
500	0.27
501	0.26
502	0.23
503	0.22
504	0.23
505	0.25
506	0.26
507	0.3
508	0.36
509	0.41
510	0.46
511	0.53
512	0.58
513	0.6
514	0.6
515	0.59
516	0.58
517	0.54
518	0.52
519	0.44
520	0.37
521	0.3
522	0.29
523	0.28
524	0.24
525	0.29
526	0.28
527	0.31
528	0.32
529	0.4
530	0.43
531	0.49
532	0.53
533	0.55
534	0.6
535	0.6
536	0.62
537	0.58
538	0.6
539	0.54
540	0.54
541	0.56
542	0.54
543	0.6
544	0.64
545	0.69
546	0.73
547	0.8
548	0.8
549	0.77
550	0.79
551	0.7
552	0.62
553	0.57
554	0.49
555	0.41
556	0.34
557	0.27
558	0.19
559	0.22
560	0.21
561	0.19
562	0.17
563	0.2
564	0.2
565	0.21
566	0.24
567	0.24
568	0.27
569	0.27
570	0.31
571	0.33
572	0.39
573	0.41
574	0.43
575	0.45
576	0.42
577	0.43
578	0.39
579	0.36
580	0.3
581	0.26
582	0.21
583	0.15
584	0.13
585	0.1
586	0.09
587	0.07
588	0.08
589	0.15
590	0.19
591	0.26
592	0.3
593	0.35
594	0.39
595	0.43
596	0.5
597	0.51
598	0.57
599	0.57
600	0.59
601	0.62
602	0.6
603	0.6
604	0.54
605	0.51
606	0.42
607	0.39
608	0.35
609	0.31
610	0.3
611	0.27
612	0.3
613	0.32
614	0.34
615	0.35
616	0.36
617	0.41
618	0.41
619	0.43
620	0.38
621	0.32
622	0.29
623	0.26
624	0.27
625	0.24
626	0.27
627	0.34
628	0.35
629	0.37
630	0.4
631	0.43
632	0.44
633	0.42
634	0.44
635	0.43
636	0.46
637	0.45
638	0.45
639	0.43
640	0.42
641	0.45
642	0.44
643	0.41
644	0.46
645	0.52
646	0.55
647	0.59
648	0.64
649	0.66
650	0.7
651	0.76
652	0.77
653	0.77
654	0.79
655	0.8
656	0.8
657	0.8
658	0.77
659	0.72
660	0.7
661	0.63
662	0.54
663	0.51
664	0.47
665	0.41
666	0.37
667	0.32
668	0.27
669	0.28
670	0.27
671	0.27
672	0.3
673	0.37

C0NBJ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer