Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1L9PT04

Protein Details
Accession A0A1L9PT04    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-140YREVDEKMDRRRRVRREARERQEREEYEBasic
172-192GDLTGKNRRTKQNLRMQQRFYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-133RRRRVRREARER
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 8.833, cyto 8.5, cyto_mito 6.833, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MASGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQAALAKRAQLLGAAPPTAYGASREKGKGEEKPAEEEEDERFQDPDNEVGLFAYGQFDQEDDEADRIYREVDEKMDRRRRVRREARERQEREEYERKNPKIQQQFVDLKRSLASVSEDEWANLPEVGDLTGKNRRTKQNLRMQQRFYAVPDSVLANARESAQFDTTVAEDGSQTEAHTADGADGMITNFANISAARDKVLQVKLDQAAMGSSGDAASGSATSIDPKGYLTSLTQSELKAGEIEVGDVKRVRVLLESVTRTNPKHAPGWIALARLEELAGRIVTSRNIIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNEGHNAKIIAANAIKNNDRSTRLWIEAMKLESEPRAKKNVLRQAILHIPQSVTIWKEAVNLEEDPADARLLLAKAVEMIPLAVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTNHEIWIAACRLQEQMGTFNKVNVMKRAVQSLAKENAMLKREEWIAEAEKCEEEGAILTCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMDDANTSIARGKYETARAIYAYALRVFVNRKSIWVAAAELERNHGTKEGLWQVLEKAVEACPQSEELWLQLAKEKWQSGEIDEARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADARQTEQARELLATARREAGTDRVWIKSVAFERQLGKIDDSLDLVNQGLQLYPKADKLWMMKGQIYELQNKLPQAREAYGTGTRACPKSVSLWLLASRLEEKAGAVVRARSVLDRARLAVPNSPELWTESVRVERRANNISQAKIVMAKALQEVPSSGLLWSESIWHLEPRAQRKARSLEAIKKVDNDPILFITVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVSNSDLGDAWAWYYKFLLQHGTEEKRADVISKCVLSEPKHGELWQSIAKDPANAYKSTEDILRLVANSLIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.31
4 0.28
5 0.25
6 0.19
7 0.15
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.07
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.2
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.29
25 0.32
26 0.34
27 0.32
28 0.38
29 0.37
30 0.32
31 0.31
32 0.28
33 0.26
34 0.3
35 0.3
36 0.26
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.24
42 0.19
43 0.17
44 0.18
45 0.2
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.14
53 0.16
54 0.19
55 0.25
56 0.27
57 0.27
58 0.32
59 0.38
60 0.41
61 0.44
62 0.5
63 0.46
64 0.51
65 0.51
66 0.5
67 0.45
68 0.4
69 0.36
70 0.34
71 0.33
72 0.27
73 0.25
74 0.22
75 0.26
76 0.25
77 0.23
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.16
82 0.16
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.17
104 0.25
105 0.3
106 0.41
107 0.5
108 0.55
109 0.62
110 0.71
111 0.75
112 0.77
113 0.83
114 0.83
115 0.85
116 0.89
117 0.91
118 0.92
119 0.88
120 0.84
121 0.83
122 0.75
123 0.72
124 0.71
125 0.64
126 0.64
127 0.69
128 0.66
129 0.64
130 0.67
131 0.68
132 0.69
133 0.71
134 0.64
135 0.63
136 0.69
137 0.64
138 0.67
139 0.58
140 0.48
141 0.42
142 0.39
143 0.3
144 0.22
145 0.22
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.12
162 0.19
163 0.24
164 0.3
165 0.37
166 0.44
167 0.53
168 0.63
169 0.69
170 0.73
171 0.78
172 0.82
173 0.83
174 0.79
175 0.75
176 0.69
177 0.6
178 0.52
179 0.47
180 0.37
181 0.29
182 0.26
183 0.21
184 0.19
185 0.21
186 0.18
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.21
231 0.25
232 0.22
233 0.2
234 0.25
235 0.25
236 0.25
237 0.24
238 0.17
239 0.14
240 0.13
241 0.12
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.14
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.09
284 0.11
285 0.13
286 0.19
287 0.22
288 0.23
289 0.26
290 0.29
291 0.29
292 0.33
293 0.31
294 0.28
295 0.28
296 0.28
297 0.28
298 0.26
299 0.31
300 0.28
301 0.26
302 0.23
303 0.21
304 0.19
305 0.15
306 0.14
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.16
322 0.17
323 0.18
324 0.22
325 0.21
326 0.21
327 0.22
328 0.24
329 0.21
330 0.22
331 0.22
332 0.17
333 0.23
334 0.23
335 0.24
336 0.23
337 0.22
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.16
346 0.15
347 0.17
348 0.16
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.19
357 0.19
358 0.22
359 0.22
360 0.27
361 0.28
362 0.28
363 0.28
364 0.27
365 0.26
366 0.25
367 0.25
368 0.19
369 0.16
370 0.15
371 0.15
372 0.2
373 0.21
374 0.21
375 0.25
376 0.26
377 0.29
378 0.38
379 0.44
380 0.43
381 0.41
382 0.39
383 0.38
384 0.43
385 0.41
386 0.33
387 0.25
388 0.21
389 0.2
390 0.2
391 0.16
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.03
423 0.03
424 0.02
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.07
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.13
441 0.19
442 0.22
443 0.18
444 0.19
445 0.21
446 0.22
447 0.23
448 0.23
449 0.2
450 0.18
451 0.2
452 0.2
453 0.19
454 0.17
455 0.16
456 0.16
457 0.14
458 0.13
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.08
465 0.13
466 0.14
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.2
471 0.22
472 0.23
473 0.2
474 0.21
475 0.21
476 0.22
477 0.24
478 0.22
479 0.21
480 0.21
481 0.25
482 0.24
483 0.2
484 0.2
485 0.2
486 0.22
487 0.22
488 0.21
489 0.15
490 0.15
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.13
495 0.14
496 0.14
497 0.15
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.09
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.04
513 0.03
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.11
533 0.12
534 0.12
535 0.13
536 0.13
537 0.13
538 0.13
539 0.14
540 0.11
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.13
545 0.16
546 0.18
547 0.17
548 0.17
549 0.17
550 0.17
551 0.16
552 0.14
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.12
558 0.13
559 0.14
560 0.19
561 0.18
562 0.18
563 0.2
564 0.2
565 0.19
566 0.18
567 0.16
568 0.12
569 0.14
570 0.13
571 0.11
572 0.13
573 0.13
574 0.13
575 0.12
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.15
580 0.17
581 0.17
582 0.17
583 0.17
584 0.17
585 0.19
586 0.18
587 0.13
588 0.1
589 0.09
590 0.12
591 0.12
592 0.12
593 0.1
594 0.11
595 0.12
596 0.11
597 0.11
598 0.09
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.13
603 0.14
604 0.16
605 0.19
606 0.19
607 0.17
608 0.19
609 0.2
610 0.17
611 0.25
612 0.25
613 0.25
614 0.25
615 0.25
616 0.23
617 0.23
618 0.22
619 0.14
620 0.15
621 0.15
622 0.24
623 0.28
624 0.36
625 0.4
626 0.42
627 0.43
628 0.42
629 0.39
630 0.31
631 0.26
632 0.18
633 0.16
634 0.13
635 0.11
636 0.07
637 0.07
638 0.06
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.07
643 0.08
644 0.1
645 0.15
646 0.16
647 0.17
648 0.18
649 0.19
650 0.18
651 0.17
652 0.16
653 0.16
654 0.19
655 0.2
656 0.18
657 0.2
658 0.19
659 0.2
660 0.2
661 0.2
662 0.18
663 0.22
664 0.23
665 0.21
666 0.22
667 0.22
668 0.21
669 0.22
670 0.23
671 0.22
672 0.22
673 0.24
674 0.25
675 0.28
676 0.32
677 0.28
678 0.26
679 0.23
680 0.22
681 0.2
682 0.19
683 0.16
684 0.12
685 0.11
686 0.1
687 0.09
688 0.08
689 0.07
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.09
694 0.11
695 0.12
696 0.12
697 0.13
698 0.16
699 0.19
700 0.26
701 0.28
702 0.29
703 0.3
704 0.3
705 0.31
706 0.33
707 0.32
708 0.3
709 0.27
710 0.28
711 0.27
712 0.29
713 0.3
714 0.27
715 0.27
716 0.26
717 0.26
718 0.25
719 0.24
720 0.26
721 0.26
722 0.25
723 0.24
724 0.23
725 0.27
726 0.25
727 0.25
728 0.22
729 0.21
730 0.23
731 0.27
732 0.26
733 0.23
734 0.25
735 0.26
736 0.26
737 0.25
738 0.22
739 0.18
740 0.16
741 0.15
742 0.12
743 0.1
744 0.13
745 0.15
746 0.14
747 0.14
748 0.15
749 0.15
750 0.17
751 0.18
752 0.15
753 0.17
754 0.2
755 0.23
756 0.23
757 0.25
758 0.28
759 0.31
760 0.31
761 0.33
762 0.31
763 0.31
764 0.3
765 0.29
766 0.25
767 0.24
768 0.26
769 0.21
770 0.21
771 0.2
772 0.26
773 0.28
774 0.32
775 0.34
776 0.36
777 0.41
778 0.45
779 0.43
780 0.45
781 0.48
782 0.45
783 0.42
784 0.38
785 0.32
786 0.3
787 0.28
788 0.21
789 0.16
790 0.16
791 0.16
792 0.18
793 0.18
794 0.15
795 0.16
796 0.16
797 0.17
798 0.16
799 0.13
800 0.11
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.11
805 0.1
806 0.12
807 0.14
808 0.14
809 0.15
810 0.2
811 0.27
812 0.31
813 0.41
814 0.44
815 0.46
816 0.53
817 0.6
818 0.6
819 0.63
820 0.63
821 0.62
822 0.67
823 0.69
824 0.62
825 0.59
826 0.55
827 0.51
828 0.46
829 0.38
830 0.31
831 0.26
832 0.26
833 0.22
834 0.2
835 0.19
836 0.17
837 0.16
838 0.14
839 0.13
840 0.12
841 0.16
842 0.22
843 0.23
844 0.24
845 0.3
846 0.33
847 0.34
848 0.35
849 0.38
850 0.42
851 0.42
852 0.42
853 0.37
854 0.35
855 0.37
856 0.36
857 0.32
858 0.25
859 0.23
860 0.23
861 0.22
862 0.22
863 0.19
864 0.19
865 0.16
866 0.13
867 0.12
868 0.14
869 0.14
870 0.13
871 0.14
872 0.16
873 0.18
874 0.19
875 0.25
876 0.21
877 0.28
878 0.36
879 0.41
880 0.42
881 0.41
882 0.4
883 0.36
884 0.35
885 0.32
886 0.26
887 0.26
888 0.29
889 0.28
890 0.28
891 0.3
892 0.35
893 0.34
894 0.41
895 0.42
896 0.4
897 0.42
898 0.42
899 0.41
900 0.38
901 0.4
902 0.36
903 0.32
904 0.29
905 0.3
906 0.31
907 0.3
908 0.3
909 0.33
910 0.31
911 0.29
912 0.32
913 0.3
914 0.31
915 0.3
916 0.3
917 0.24
918 0.21
919 0.23
920 0.21
921 0.19
922 0.18