Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C0NYV2

Protein Details
Accession C0NYV2    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-135RSPSRSRSPSPAHSRGRRRSHTPVRSHSRRRSPSLRSRHSBasic
324-346PSGGRYRSPPPRRASPRRFAGPRBasic
369-435SPSYSSRSRSRTPPPRRRPHRDSPPRRRRRASSYSSYSDRGRSRSRSRSLSRSRSPSQSRSRRGGGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-190RSPSRSRSPSPAHSRGRRRSHTPVRSHSRRRSPSLRSRHSDASRSRARLRDASPGLSPRRNGHRDGSRSPPPRNRTRSRSLSRGRGDRRYRDRSF
301-436RFDRPAHGRPYGRGAGLDSGRPPPSGGRYRSPPPRRASPRRFAGPRGMERHDLYRPRSISRSRSPRGRSPSYSSRSRSRTPPPRRRPHRDSPPRRRRRASSYSSYSDRGRSRSRSRSLSRSRSPSQSRSRRGGGRR
Subcellular Location(s) plas 10, nucl 5, mito 4, E.R. 4, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034201  RNPS1_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12365  RRM_RNPS1  
Amino Acid Sequences MNSASAVFLSFLSFLSFFLFRFRNPWQMSLSLSRFCRLKLRQPSTTAQEHPRQLKQLPYGCSSARLFTQLAVIVILLFSSVSWSPSLSPIAAMRSRSPSRSRSPSPAHSRGRRRSHTPVRSHSRRRSPSLRSRHSDASRSRARLRDASPGLSPRRNGHRDGSRSPPPRNRTRSRSLSRGRGDRRYRDRSFTRNPSRGTPPRTSSKIVVEKLTKNVNENHLREIFGAYGEIQSLELPMNPQFMINRGTAYILYYEVADAEAAISHMHEAQLDGAVLNVSIVLPRRTFSRSPPPARNRGDFGRFDRPAHGRPYGRGAGLDSGRPPPSGGRYRSPPPRRASPRRFAGPRGMERHDLYRPRSISRSRSPRGRSPSYSSRSRSRTPPPRRRPHRDSPPRRRRRASSYSSYSDRGRSRSRSRSLSRSRSPSQSRSRRGGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.12
5 0.19
6 0.2
7 0.18
8 0.24
9 0.28
10 0.35
11 0.37
12 0.41
13 0.38
14 0.38
15 0.42
16 0.45
17 0.45
18 0.41
19 0.4
20 0.4
21 0.38
22 0.37
23 0.43
24 0.4
25 0.46
26 0.51
27 0.58
28 0.61
29 0.65
30 0.71
31 0.67
32 0.68
33 0.64
34 0.61
35 0.6
36 0.61
37 0.62
38 0.61
39 0.6
40 0.56
41 0.57
42 0.57
43 0.56
44 0.53
45 0.5
46 0.49
47 0.44
48 0.46
49 0.4
50 0.33
51 0.27
52 0.26
53 0.23
54 0.19
55 0.21
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.13
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.05
64 0.03
65 0.03
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.12
73 0.14
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.18
78 0.21
79 0.22
80 0.22
81 0.29
82 0.32
83 0.36
84 0.4
85 0.41
86 0.47
87 0.54
88 0.56
89 0.57
90 0.62
91 0.66
92 0.7
93 0.74
94 0.75
95 0.75
96 0.8
97 0.81
98 0.84
99 0.8
100 0.78
101 0.79
102 0.8
103 0.8
104 0.79
105 0.79
106 0.79
107 0.83
108 0.86
109 0.85
110 0.85
111 0.82
112 0.81
113 0.8
114 0.79
115 0.79
116 0.8
117 0.79
118 0.74
119 0.73
120 0.74
121 0.7
122 0.68
123 0.62
124 0.6
125 0.58
126 0.57
127 0.57
128 0.52
129 0.52
130 0.5
131 0.49
132 0.49
133 0.44
134 0.42
135 0.39
136 0.41
137 0.42
138 0.39
139 0.38
140 0.34
141 0.41
142 0.42
143 0.42
144 0.43
145 0.47
146 0.5
147 0.53
148 0.54
149 0.54
150 0.57
151 0.62
152 0.62
153 0.61
154 0.65
155 0.69
156 0.71
157 0.69
158 0.72
159 0.75
160 0.72
161 0.75
162 0.72
163 0.72
164 0.69
165 0.71
166 0.68
167 0.67
168 0.69
169 0.68
170 0.71
171 0.71
172 0.68
173 0.66
174 0.66
175 0.64
176 0.66
177 0.67
178 0.67
179 0.64
180 0.64
181 0.61
182 0.64
183 0.63
184 0.6
185 0.55
186 0.5
187 0.5
188 0.52
189 0.5
190 0.43
191 0.44
192 0.45
193 0.41
194 0.4
195 0.38
196 0.36
197 0.37
198 0.39
199 0.32
200 0.27
201 0.29
202 0.32
203 0.35
204 0.34
205 0.35
206 0.31
207 0.31
208 0.29
209 0.26
210 0.19
211 0.11
212 0.1
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.11
271 0.16
272 0.18
273 0.23
274 0.33
275 0.41
276 0.48
277 0.58
278 0.63
279 0.68
280 0.72
281 0.69
282 0.63
283 0.6
284 0.58
285 0.53
286 0.51
287 0.51
288 0.48
289 0.46
290 0.46
291 0.45
292 0.43
293 0.43
294 0.44
295 0.36
296 0.36
297 0.41
298 0.38
299 0.34
300 0.3
301 0.26
302 0.25
303 0.24
304 0.24
305 0.19
306 0.21
307 0.21
308 0.21
309 0.2
310 0.18
311 0.25
312 0.31
313 0.34
314 0.36
315 0.41
316 0.49
317 0.59
318 0.65
319 0.65
320 0.63
321 0.7
322 0.74
323 0.79
324 0.8
325 0.79
326 0.8
327 0.81
328 0.79
329 0.72
330 0.71
331 0.69
332 0.68
333 0.65
334 0.6
335 0.55
336 0.53
337 0.54
338 0.52
339 0.5
340 0.46
341 0.47
342 0.46
343 0.46
344 0.51
345 0.53
346 0.53
347 0.58
348 0.64
349 0.63
350 0.7
351 0.73
352 0.74
353 0.77
354 0.76
355 0.72
356 0.7
357 0.73
358 0.7
359 0.72
360 0.68
361 0.69
362 0.67
363 0.67
364 0.66
365 0.67
366 0.71
367 0.74
368 0.8
369 0.82
370 0.86
371 0.92
372 0.94
373 0.92
374 0.92
375 0.92
376 0.92
377 0.93
378 0.93
379 0.93
380 0.94
381 0.95
382 0.93
383 0.89
384 0.88
385 0.87
386 0.85
387 0.84
388 0.81
389 0.78
390 0.74
391 0.7
392 0.63
393 0.6
394 0.57
395 0.53
396 0.54
397 0.56
398 0.61
399 0.67
400 0.72
401 0.75
402 0.77
403 0.81
404 0.83
405 0.84
406 0.84
407 0.82
408 0.8
409 0.8
410 0.81
411 0.8
412 0.81
413 0.81
414 0.8
415 0.79
416 0.81