Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7JDM4

Protein Details
Accession A0A1J7JDM4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-53ATTTPTPQQHPQHHQQHQQAHQQQHydrophilic
648-671LEPPVKPARAKRSRKPKDDDGNGEBasic
680-699GRNKRAKNHAHHHHHHHHHHBasic
1007-1030AGTQNRLRGKARRERIRRALREVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
653-666KPARAKRSRKPKDD
674-688GRASPAGRNKRAKNH
1013-1025LRGKARRERIRRA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MDPRQPPQHGRDPFSRNAASPYGRSAFPPATTTPTPQQHPQHHQQHQQAHQQQQPYPPSAHSAPPGPQYSDQRRPSDPPYYSQPRPYPPDPTAHHPPTHSHSRHQSNSSISSNAAINRAMPPPGSPPQNSGPGGHPPYGMPPAPRPPPVSVGPPSAFPGGRELPALGSLPRTASGGSSMSISSMLGGPAPRDRDPGAPSHYGPPPSGPVGPGPGYNPSMHASPRMHPGAPEYAPFRRPQTPEHAHRLYDNRDPRDPRPPTAASPHGTYGTPEVQRYGTPQSYSQRGLPHPASEQAREQGRMTGNAIPRPDSQPKSFAGIPPPRPMDMGRPPQGDGFVRREEEYNPDRPLQSMKYEDPRYNPERERQEMREREFRERELRERGLSGGDPGRQHAMMQEHYMQQMGPRGPQPPFGRQPDPREQGAWRHQQYEPARAPYDPAAPFPRHHEYPPTTGTPYGSHPAYPQQPGERYPPSSGPPHHLGPHQGGPPPPFPYDGSPERTRNGPQHLPRDQPPQMQRSRTLDEGHVPPPSVAYNAGGGPNMFEGPRNRSMDDINQVPHNQRSLLQIQEFNRKGRISPLPQAVQGAQPQLSGPAGEPGIKSEFGRIFAGISGGIGGISSPAPTRTALPFSGPGMLRRDDSDIPPQELGLEPPVKPARAKRSRKPKDDDGNGEDSGRASPAGRNKRAKNHAHHHHHHHHHHHHHAQEQVPSPAGTASTPFKNANQPIPSPPGGFAKELHGAHHHHVVPRSTPGNHTQTANAKAVAPPPQPMIIPKPKKLSVSNQAVLDSVAKLPRNHLGDVPYEVKLKPARLQDPRTGRPPRHGYQSNPVPLPWELIKDHLNCTLTVKVGKQHLGSTAREEITSRRALWGTDIYTDDSDVIAACIHAGWIRGEWPEEVDVDMLDLYATDDKDKKGSKSRAAKLAAQTNNLVVLDAPPKGGPQTVHENRDLHVTLLILPPLEKYASSCRFGIKSREFGGEIPDAQGLTHRAEHDGLSFMITGLRWVNNGAGTQNRLRGKARRERIRRALREVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.61
3 0.52
4 0.5
5 0.5
6 0.44
7 0.39
8 0.41
9 0.36
10 0.34
11 0.34
12 0.35
13 0.32
14 0.3
15 0.32
16 0.28
17 0.32
18 0.34
19 0.38
20 0.4
21 0.45
22 0.47
23 0.52
24 0.59
25 0.62
26 0.68
27 0.73
28 0.75
29 0.77
30 0.81
31 0.81
32 0.82
33 0.8
34 0.81
35 0.79
36 0.77
37 0.73
38 0.7
39 0.66
40 0.65
41 0.62
42 0.56
43 0.5
44 0.43
45 0.44
46 0.41
47 0.41
48 0.35
49 0.34
50 0.34
51 0.39
52 0.42
53 0.4
54 0.43
55 0.48
56 0.55
57 0.6
58 0.63
59 0.61
60 0.62
61 0.64
62 0.64
63 0.64
64 0.57
65 0.52
66 0.55
67 0.58
68 0.58
69 0.62
70 0.62
71 0.61
72 0.66
73 0.64
74 0.62
75 0.56
76 0.61
77 0.56
78 0.58
79 0.6
80 0.57
81 0.57
82 0.51
83 0.53
84 0.52
85 0.58
86 0.53
87 0.51
88 0.55
89 0.61
90 0.66
91 0.65
92 0.63
93 0.58
94 0.61
95 0.56
96 0.47
97 0.38
98 0.33
99 0.32
100 0.28
101 0.25
102 0.18
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.17
108 0.17
109 0.21
110 0.28
111 0.32
112 0.3
113 0.33
114 0.37
115 0.44
116 0.44
117 0.4
118 0.37
119 0.4
120 0.43
121 0.39
122 0.34
123 0.27
124 0.31
125 0.33
126 0.32
127 0.26
128 0.28
129 0.35
130 0.4
131 0.43
132 0.43
133 0.41
134 0.44
135 0.44
136 0.44
137 0.4
138 0.41
139 0.38
140 0.36
141 0.35
142 0.33
143 0.3
144 0.24
145 0.27
146 0.23
147 0.23
148 0.22
149 0.2
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.13
176 0.18
177 0.18
178 0.21
179 0.23
180 0.26
181 0.28
182 0.32
183 0.33
184 0.32
185 0.33
186 0.36
187 0.38
188 0.35
189 0.34
190 0.3
191 0.28
192 0.27
193 0.26
194 0.21
195 0.18
196 0.21
197 0.21
198 0.2
199 0.18
200 0.19
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.23
208 0.22
209 0.23
210 0.31
211 0.32
212 0.3
213 0.28
214 0.31
215 0.32
216 0.3
217 0.3
218 0.27
219 0.28
220 0.3
221 0.32
222 0.33
223 0.33
224 0.35
225 0.37
226 0.43
227 0.48
228 0.53
229 0.6
230 0.58
231 0.52
232 0.54
233 0.56
234 0.5
235 0.5
236 0.5
237 0.46
238 0.51
239 0.55
240 0.54
241 0.59
242 0.58
243 0.52
244 0.52
245 0.49
246 0.46
247 0.48
248 0.5
249 0.41
250 0.4
251 0.39
252 0.33
253 0.3
254 0.27
255 0.24
256 0.24
257 0.23
258 0.21
259 0.21
260 0.2
261 0.2
262 0.23
263 0.25
264 0.22
265 0.22
266 0.26
267 0.29
268 0.32
269 0.34
270 0.34
271 0.34
272 0.33
273 0.38
274 0.35
275 0.33
276 0.3
277 0.34
278 0.33
279 0.3
280 0.31
281 0.3
282 0.31
283 0.3
284 0.29
285 0.28
286 0.27
287 0.26
288 0.26
289 0.26
290 0.26
291 0.28
292 0.28
293 0.26
294 0.27
295 0.31
296 0.37
297 0.36
298 0.35
299 0.35
300 0.35
301 0.37
302 0.36
303 0.32
304 0.34
305 0.38
306 0.39
307 0.42
308 0.43
309 0.39
310 0.39
311 0.37
312 0.36
313 0.36
314 0.41
315 0.41
316 0.4
317 0.4
318 0.4
319 0.41
320 0.36
321 0.31
322 0.27
323 0.24
324 0.24
325 0.24
326 0.25
327 0.23
328 0.28
329 0.29
330 0.29
331 0.29
332 0.29
333 0.29
334 0.28
335 0.31
336 0.26
337 0.25
338 0.25
339 0.26
340 0.33
341 0.36
342 0.38
343 0.38
344 0.43
345 0.43
346 0.46
347 0.45
348 0.44
349 0.47
350 0.5
351 0.52
352 0.51
353 0.57
354 0.57
355 0.59
356 0.6
357 0.56
358 0.6
359 0.57
360 0.54
361 0.53
362 0.5
363 0.5
364 0.49
365 0.48
366 0.4
367 0.38
368 0.35
369 0.28
370 0.24
371 0.22
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.16
376 0.18
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.16
381 0.15
382 0.17
383 0.18
384 0.18
385 0.18
386 0.18
387 0.15
388 0.12
389 0.17
390 0.15
391 0.14
392 0.15
393 0.18
394 0.19
395 0.26
396 0.28
397 0.31
398 0.37
399 0.4
400 0.45
401 0.46
402 0.53
403 0.56
404 0.57
405 0.5
406 0.45
407 0.41
408 0.43
409 0.46
410 0.48
411 0.4
412 0.39
413 0.39
414 0.45
415 0.46
416 0.47
417 0.42
418 0.37
419 0.36
420 0.32
421 0.33
422 0.27
423 0.3
424 0.22
425 0.21
426 0.22
427 0.22
428 0.23
429 0.28
430 0.31
431 0.27
432 0.28
433 0.32
434 0.31
435 0.34
436 0.37
437 0.33
438 0.28
439 0.27
440 0.27
441 0.22
442 0.21
443 0.19
444 0.16
445 0.14
446 0.14
447 0.18
448 0.2
449 0.21
450 0.2
451 0.2
452 0.22
453 0.24
454 0.29
455 0.27
456 0.26
457 0.26
458 0.26
459 0.25
460 0.28
461 0.27
462 0.27
463 0.28
464 0.27
465 0.28
466 0.27
467 0.26
468 0.25
469 0.28
470 0.25
471 0.23
472 0.23
473 0.23
474 0.24
475 0.25
476 0.22
477 0.2
478 0.19
479 0.19
480 0.23
481 0.24
482 0.27
483 0.29
484 0.3
485 0.3
486 0.31
487 0.31
488 0.29
489 0.32
490 0.33
491 0.34
492 0.41
493 0.44
494 0.45
495 0.46
496 0.5
497 0.45
498 0.45
499 0.44
500 0.43
501 0.43
502 0.42
503 0.43
504 0.4
505 0.41
506 0.36
507 0.34
508 0.27
509 0.27
510 0.27
511 0.25
512 0.21
513 0.18
514 0.16
515 0.15
516 0.14
517 0.11
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.07
530 0.08
531 0.14
532 0.2
533 0.22
534 0.22
535 0.22
536 0.24
537 0.25
538 0.27
539 0.24
540 0.18
541 0.19
542 0.19
543 0.2
544 0.2
545 0.17
546 0.14
547 0.14
548 0.17
549 0.17
550 0.19
551 0.19
552 0.22
553 0.23
554 0.32
555 0.33
556 0.3
557 0.31
558 0.29
559 0.27
560 0.29
561 0.33
562 0.28
563 0.32
564 0.37
565 0.35
566 0.35
567 0.36
568 0.31
569 0.26
570 0.23
571 0.18
572 0.13
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.08
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.13
588 0.13
589 0.15
590 0.15
591 0.13
592 0.12
593 0.11
594 0.12
595 0.08
596 0.07
597 0.05
598 0.04
599 0.04
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.06
608 0.06
609 0.09
610 0.1
611 0.13
612 0.13
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.19
617 0.18
618 0.18
619 0.19
620 0.2
621 0.19
622 0.18
623 0.22
624 0.19
625 0.21
626 0.27
627 0.26
628 0.27
629 0.26
630 0.25
631 0.21
632 0.2
633 0.18
634 0.14
635 0.14
636 0.12
637 0.18
638 0.2
639 0.2
640 0.21
641 0.27
642 0.33
643 0.42
644 0.5
645 0.54
646 0.64
647 0.73
648 0.8
649 0.82
650 0.81
651 0.8
652 0.8
653 0.78
654 0.72
655 0.66
656 0.57
657 0.5
658 0.4
659 0.3
660 0.22
661 0.16
662 0.11
663 0.07
664 0.1
665 0.18
666 0.28
667 0.35
668 0.43
669 0.48
670 0.57
671 0.66
672 0.71
673 0.72
674 0.73
675 0.75
676 0.77
677 0.79
678 0.79
679 0.79
680 0.8
681 0.79
682 0.78
683 0.77
684 0.75
685 0.77
686 0.73
687 0.67
688 0.62
689 0.58
690 0.52
691 0.48
692 0.43
693 0.35
694 0.3
695 0.27
696 0.23
697 0.18
698 0.15
699 0.1
700 0.1
701 0.12
702 0.12
703 0.15
704 0.16
705 0.18
706 0.25
707 0.28
708 0.32
709 0.33
710 0.34
711 0.35
712 0.39
713 0.38
714 0.32
715 0.31
716 0.29
717 0.27
718 0.26
719 0.22
720 0.21
721 0.26
722 0.25
723 0.25
724 0.24
725 0.25
726 0.26
727 0.32
728 0.3
729 0.27
730 0.31
731 0.31
732 0.29
733 0.32
734 0.33
735 0.28
736 0.29
737 0.32
738 0.34
739 0.34
740 0.33
741 0.32
742 0.35
743 0.38
744 0.37
745 0.3
746 0.26
747 0.25
748 0.28
749 0.3
750 0.25
751 0.22
752 0.23
753 0.23
754 0.23
755 0.24
756 0.29
757 0.33
758 0.38
759 0.42
760 0.47
761 0.49
762 0.53
763 0.55
764 0.55
765 0.55
766 0.57
767 0.56
768 0.5
769 0.47
770 0.43
771 0.39
772 0.31
773 0.22
774 0.15
775 0.15
776 0.17
777 0.17
778 0.19
779 0.24
780 0.27
781 0.27
782 0.27
783 0.26
784 0.25
785 0.3
786 0.3
787 0.26
788 0.25
789 0.23
790 0.26
791 0.27
792 0.27
793 0.28
794 0.33
795 0.4
796 0.46
797 0.52
798 0.56
799 0.62
800 0.64
801 0.68
802 0.68
803 0.62
804 0.63
805 0.66
806 0.61
807 0.62
808 0.63
809 0.58
810 0.61
811 0.68
812 0.64
813 0.57
814 0.52
815 0.46
816 0.4
817 0.39
818 0.3
819 0.25
820 0.19
821 0.21
822 0.27
823 0.26
824 0.28
825 0.29
826 0.29
827 0.25
828 0.28
829 0.27
830 0.23
831 0.24
832 0.23
833 0.23
834 0.27
835 0.3
836 0.28
837 0.28
838 0.32
839 0.34
840 0.34
841 0.33
842 0.34
843 0.31
844 0.3
845 0.3
846 0.26
847 0.28
848 0.3
849 0.26
850 0.24
851 0.24
852 0.24
853 0.26
854 0.28
855 0.24
856 0.23
857 0.24
858 0.23
859 0.22
860 0.22
861 0.19
862 0.14
863 0.12
864 0.09
865 0.08
866 0.06
867 0.05
868 0.05
869 0.04
870 0.05
871 0.06
872 0.07
873 0.07
874 0.08
875 0.1
876 0.11
877 0.13
878 0.13
879 0.14
880 0.14
881 0.14
882 0.14
883 0.12
884 0.11
885 0.1
886 0.09
887 0.07
888 0.05
889 0.05
890 0.06
891 0.08
892 0.09
893 0.12
894 0.15
895 0.16
896 0.24
897 0.28
898 0.32
899 0.4
900 0.48
901 0.54
902 0.62
903 0.69
904 0.71
905 0.71
906 0.71
907 0.68
908 0.7
909 0.64
910 0.56
911 0.5
912 0.41
913 0.39
914 0.33
915 0.25
916 0.16
917 0.15
918 0.15
919 0.14
920 0.15
921 0.12
922 0.13
923 0.14
924 0.17
925 0.15
926 0.17
927 0.28
928 0.35
929 0.39
930 0.43
931 0.43
932 0.41
933 0.47
934 0.43
935 0.32
936 0.26
937 0.22
938 0.2
939 0.21
940 0.21
941 0.14
942 0.14
943 0.13
944 0.14
945 0.14
946 0.12
947 0.13
948 0.23
949 0.28
950 0.31
951 0.31
952 0.34
953 0.37
954 0.42
955 0.48
956 0.45
957 0.47
958 0.47
959 0.5
960 0.47
961 0.44
962 0.44
963 0.38
964 0.32
965 0.27
966 0.24
967 0.2
968 0.18
969 0.21
970 0.18
971 0.17
972 0.2
973 0.19
974 0.2
975 0.22
976 0.22
977 0.21
978 0.21
979 0.18
980 0.16
981 0.15
982 0.13
983 0.13
984 0.12
985 0.12
986 0.13
987 0.14
988 0.13
989 0.14
990 0.15
991 0.16
992 0.17
993 0.19
994 0.2
995 0.25
996 0.28
997 0.35
998 0.37
999 0.39
1000 0.44
1001 0.49
1002 0.55
1003 0.6
1004 0.67
1005 0.7
1006 0.76
1007 0.83
1008 0.87
1009 0.9
1010 0.88