Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C0NVC7

Protein Details
Accession C0NVC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-70TTTFTRRKSITKHRKPAPDPRHLAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-176RARFRVVWGKKGSGPGGRGK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039693  Rtr1/RPAP2  
IPR007308  Rtr1/RPAP2_dom  
IPR038534  Rtr1/RPAP2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017018  F:myosin phosphatase activity  
GO:0043175  F:RNA polymerase core enzyme binding  
GO:0008420  F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04181  RPAP2_Rtr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51479  ZF_RTR1  
Amino Acid Sequences MSNNLAPQESSNAKSSLPSIHASLAKEAPPSANTNPSPTATATTTTTTFTRRKSITKHRKPAPDPRHLAIALHHARQIQARKDTEAIILSRIEELLSFPSSPIALASSPLPEDVKAFKEALIPFQPSDYDNLILERNIDGRCGYALCANEHRKEDPRARFRVVWGKKGSGPGGRGKEMKVVPKEQIEKWCSDECAERAMYIRVQLIQQPAWERTPAALGQAPTEQILLLEEGRARREKNTTKGKESEIGKREVMQEDQVEMANDVEEAMRLLVIRDKSLEPEVIMDGMGRLAVHDHDEPGQGNLAMERGDGTPHHRGLDAGRVGVNIFEKQHSPHLEAAVAMVRPPSSRAEDLHGGSIEGFKPTRQLGNARRDASNDDGDEDDDILPTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.26
4 0.25
5 0.24
6 0.23
7 0.27
8 0.3
9 0.3
10 0.33
11 0.31
12 0.29
13 0.29
14 0.28
15 0.25
16 0.24
17 0.27
18 0.26
19 0.32
20 0.31
21 0.35
22 0.36
23 0.35
24 0.35
25 0.31
26 0.31
27 0.24
28 0.26
29 0.23
30 0.23
31 0.22
32 0.22
33 0.23
34 0.25
35 0.28
36 0.29
37 0.35
38 0.36
39 0.42
40 0.5
41 0.6
42 0.65
43 0.72
44 0.79
45 0.79
46 0.86
47 0.86
48 0.88
49 0.86
50 0.85
51 0.8
52 0.72
53 0.7
54 0.59
55 0.53
56 0.43
57 0.44
58 0.37
59 0.33
60 0.33
61 0.27
62 0.28
63 0.33
64 0.39
65 0.35
66 0.39
67 0.39
68 0.4
69 0.41
70 0.41
71 0.37
72 0.32
73 0.26
74 0.2
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.13
79 0.11
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.2
106 0.2
107 0.23
108 0.24
109 0.23
110 0.21
111 0.21
112 0.21
113 0.16
114 0.2
115 0.16
116 0.14
117 0.12
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.2
135 0.24
136 0.27
137 0.29
138 0.31
139 0.33
140 0.38
141 0.45
142 0.46
143 0.51
144 0.52
145 0.54
146 0.52
147 0.52
148 0.56
149 0.5
150 0.49
151 0.43
152 0.41
153 0.39
154 0.41
155 0.39
156 0.31
157 0.31
158 0.29
159 0.3
160 0.3
161 0.29
162 0.27
163 0.31
164 0.3
165 0.34
166 0.3
167 0.29
168 0.29
169 0.33
170 0.36
171 0.32
172 0.37
173 0.33
174 0.31
175 0.33
176 0.32
177 0.27
178 0.24
179 0.24
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.08
219 0.1
220 0.13
221 0.13
222 0.15
223 0.24
224 0.3
225 0.38
226 0.48
227 0.51
228 0.54
229 0.57
230 0.57
231 0.55
232 0.52
233 0.52
234 0.46
235 0.44
236 0.38
237 0.37
238 0.37
239 0.32
240 0.3
241 0.23
242 0.19
243 0.17
244 0.17
245 0.15
246 0.13
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.12
263 0.13
264 0.15
265 0.17
266 0.18
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.14
299 0.2
300 0.21
301 0.23
302 0.21
303 0.22
304 0.23
305 0.31
306 0.27
307 0.22
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.21
312 0.2
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.18
318 0.26
319 0.27
320 0.29
321 0.3
322 0.3
323 0.28
324 0.26
325 0.25
326 0.21
327 0.18
328 0.15
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.14
333 0.17
334 0.19
335 0.22
336 0.23
337 0.29
338 0.34
339 0.35
340 0.37
341 0.33
342 0.28
343 0.26
344 0.27
345 0.21
346 0.19
347 0.18
348 0.14
349 0.17
350 0.2
351 0.24
352 0.25
353 0.34
354 0.4
355 0.5
356 0.58
357 0.58
358 0.57
359 0.55
360 0.56
361 0.52
362 0.49
363 0.39
364 0.33
365 0.31
366 0.3
367 0.28
368 0.25
369 0.19