Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7IC03

Protein Details
Accession A0A1J7IC03    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71DAHRAFKKQRAEKGLPKSKGBasic
313-332AKQVKKEAKEAKKQEKKESSBasic
362-383IKANNRGKKGTERREPPKPFSRBasic
412-440LIVTRGKGFTKEKNKKKKGSYHGGRIDTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-24EKKSGSKAGTKDKKASKAAK
58-70KKQRAEKGLPKSK
318-326KEAKEAKKQ
367-379RGKKGTERREPPK
419-430GFTKEKNKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKAEKKSGSKAGTKDKKASKAAKSASSSGTAPPPQLMDLVENFLSENDFSDAHRAFKKQRAEKGLPKSKGGEKVHHSLVGVFQAWETSLNKPEGSAQKLKVEKVTTVSSSSSDSDDVDMKDVPEADDSSSSDSSSSDSSSDSDSDSEDEQEAREAAAKTQIAQAAAQVADQPKSTAVKRKAESDSESSSSESESDSSDSSSDSSSESSSEDEKPQAKKQKVVAASSSDSSSESSSEESSSEESSSEEESSSEEESSSDEDSSSDSDSDAESEIEEAVQVPLPESDSSSSSSDSDSDSDSSSSDSSDSESSSAKQVKKEAKEAKKQEKKESSGSDTSATVGKASPDVFPVSTFAPLPPDPTIKANNRGKKGTERREPPKPFSRIKDDVVVDPRLSSNAFAGHEWGQKAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKKGSYHGGRIDTFARGGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.72
3 0.73
4 0.75
5 0.77
6 0.79
7 0.75
8 0.75
9 0.75
10 0.73
11 0.7
12 0.65
13 0.58
14 0.53
15 0.46
16 0.39
17 0.4
18 0.34
19 0.3
20 0.27
21 0.26
22 0.23
23 0.23
24 0.21
25 0.17
26 0.16
27 0.19
28 0.18
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.15
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.17
39 0.18
40 0.21
41 0.25
42 0.28
43 0.32
44 0.4
45 0.49
46 0.51
47 0.59
48 0.64
49 0.69
50 0.73
51 0.78
52 0.81
53 0.74
54 0.69
55 0.66
56 0.63
57 0.64
58 0.59
59 0.56
60 0.52
61 0.55
62 0.55
63 0.51
64 0.45
65 0.36
66 0.33
67 0.28
68 0.23
69 0.16
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.18
80 0.25
81 0.29
82 0.33
83 0.37
84 0.35
85 0.41
86 0.44
87 0.45
88 0.44
89 0.39
90 0.35
91 0.33
92 0.33
93 0.27
94 0.26
95 0.26
96 0.22
97 0.22
98 0.21
99 0.19
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.17
148 0.18
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.13
162 0.15
163 0.22
164 0.27
165 0.34
166 0.35
167 0.42
168 0.44
169 0.45
170 0.46
171 0.42
172 0.4
173 0.34
174 0.33
175 0.27
176 0.24
177 0.2
178 0.17
179 0.12
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.15
200 0.19
201 0.22
202 0.28
203 0.36
204 0.35
205 0.38
206 0.41
207 0.44
208 0.43
209 0.42
210 0.37
211 0.32
212 0.31
213 0.27
214 0.24
215 0.17
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.17
299 0.23
300 0.23
301 0.25
302 0.32
303 0.39
304 0.42
305 0.51
306 0.55
307 0.58
308 0.66
309 0.73
310 0.77
311 0.79
312 0.8
313 0.81
314 0.79
315 0.75
316 0.73
317 0.69
318 0.65
319 0.59
320 0.55
321 0.46
322 0.37
323 0.34
324 0.28
325 0.21
326 0.15
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.13
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.15
342 0.15
343 0.18
344 0.19
345 0.21
346 0.21
347 0.25
348 0.32
349 0.33
350 0.43
351 0.49
352 0.54
353 0.57
354 0.6
355 0.6
356 0.63
357 0.68
358 0.69
359 0.7
360 0.71
361 0.73
362 0.8
363 0.83
364 0.81
365 0.8
366 0.78
367 0.75
368 0.73
369 0.74
370 0.69
371 0.65
372 0.65
373 0.57
374 0.56
375 0.53
376 0.49
377 0.4
378 0.35
379 0.32
380 0.26
381 0.24
382 0.18
383 0.14
384 0.15
385 0.16
386 0.15
387 0.18
388 0.21
389 0.25
390 0.25
391 0.25
392 0.22
393 0.22
394 0.24
395 0.22
396 0.2
397 0.16
398 0.16
399 0.23
400 0.25
401 0.24
402 0.24
403 0.24
404 0.24
405 0.29
406 0.33
407 0.37
408 0.44
409 0.55
410 0.64
411 0.73
412 0.82
413 0.85
414 0.9
415 0.9
416 0.89
417 0.9
418 0.9
419 0.89
420 0.88
421 0.85
422 0.75
423 0.68
424 0.6
425 0.51
426 0.41
427 0.33
428 0.27
429 0.21