Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7IYM5

Protein Details
Accession A0A1J7IYM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46SSATSSTTVRPRNRRPAPSNSTSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-146KDGRGKSRAGSRKSSGLAG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MPEPPSNPALQRTTSTSGLAPESSATSSTTVRPRNRRPAPSNSTSLLSTPSGSPSRGASPIPSARIGSVTGRNNAGVGRAGSPASFSGGLGQGVSSWAAPTWSSLQGLASSFLGGTIGGADGPGDDRKDGRGKSRAGSRKSSGLAGRRTPSGLGNGSAASGAWGPEPPDAKPRLNDVAAGCLAEREAKLKAMKTASVLQSHEGVNGGLDVSGRFKKRRSDEDLRGSGAAQSEETEEHLVYIHHVQPSDTYAGIVLKYRCREDAFRKANGLWSRDNTYIQVRKWLALPVDACEIRGRPCEAPSYYNSNNVDLLAPIPDATAQDDPFSTGKAPEHHHQPNQTFDEDRPWTHVRWVTIDNFTAPVEIARVPRKALGYFPPRRKKSLQHTVSSLSTPRGSMDVPSITLGSEPHDHAQSPASTTATSRRMSMLSATGTRSVGDLDNPHRPAWMRRPGGVGSLHGKVRGPERDYFNSWTKKHLPGLNIESLPSMSVMGSESARFGFDEAVVGNDSPGLPAGIVESPFEDGRDVEGVSRAGGGANGTGLDKAAAAVETWLRGAFAKPGTGTPVLGPRGRGYGPGGGHQGQGGRLVEGDLIELTDTNSDDDGRPGGGGALGDLLDAGLLGSGGFGSSGRSEGDGGGAVRGRGVSAGKGKKAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.32
4 0.3
5 0.3
6 0.27
7 0.21
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.16
12 0.14
13 0.14
14 0.16
15 0.21
16 0.29
17 0.35
18 0.44
19 0.53
20 0.62
21 0.71
22 0.79
23 0.84
24 0.82
25 0.85
26 0.84
27 0.81
28 0.76
29 0.68
30 0.61
31 0.51
32 0.45
33 0.38
34 0.29
35 0.24
36 0.2
37 0.23
38 0.23
39 0.23
40 0.23
41 0.22
42 0.25
43 0.26
44 0.26
45 0.23
46 0.28
47 0.33
48 0.35
49 0.34
50 0.3
51 0.28
52 0.29
53 0.28
54 0.25
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.31
59 0.3
60 0.29
61 0.28
62 0.24
63 0.19
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.13
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.09
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.06
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.15
115 0.22
116 0.24
117 0.3
118 0.36
119 0.38
120 0.43
121 0.52
122 0.57
123 0.55
124 0.6
125 0.56
126 0.55
127 0.53
128 0.53
129 0.48
130 0.47
131 0.48
132 0.46
133 0.45
134 0.41
135 0.4
136 0.36
137 0.32
138 0.29
139 0.24
140 0.2
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.14
145 0.12
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.2
156 0.24
157 0.26
158 0.27
159 0.31
160 0.33
161 0.32
162 0.34
163 0.27
164 0.28
165 0.25
166 0.24
167 0.18
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.08
173 0.09
174 0.13
175 0.16
176 0.17
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.24
181 0.29
182 0.29
183 0.3
184 0.29
185 0.26
186 0.26
187 0.25
188 0.23
189 0.17
190 0.13
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.08
198 0.13
199 0.16
200 0.18
201 0.22
202 0.3
203 0.36
204 0.45
205 0.51
206 0.56
207 0.62
208 0.69
209 0.68
210 0.62
211 0.55
212 0.47
213 0.39
214 0.3
215 0.21
216 0.12
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.16
234 0.15
235 0.12
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.13
241 0.12
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.2
246 0.22
247 0.27
248 0.31
249 0.4
250 0.41
251 0.41
252 0.42
253 0.41
254 0.45
255 0.43
256 0.39
257 0.31
258 0.28
259 0.3
260 0.3
261 0.3
262 0.25
263 0.28
264 0.29
265 0.27
266 0.32
267 0.28
268 0.27
269 0.28
270 0.29
271 0.22
272 0.2
273 0.2
274 0.14
275 0.18
276 0.17
277 0.17
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.16
282 0.17
283 0.13
284 0.15
285 0.18
286 0.19
287 0.21
288 0.22
289 0.28
290 0.26
291 0.31
292 0.31
293 0.27
294 0.26
295 0.24
296 0.21
297 0.13
298 0.12
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.12
317 0.16
318 0.17
319 0.26
320 0.3
321 0.32
322 0.36
323 0.37
324 0.39
325 0.38
326 0.36
327 0.29
328 0.25
329 0.29
330 0.25
331 0.24
332 0.24
333 0.23
334 0.22
335 0.25
336 0.27
337 0.21
338 0.23
339 0.25
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.18
344 0.17
345 0.16
346 0.13
347 0.1
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.11
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.17
356 0.18
357 0.17
358 0.18
359 0.23
360 0.3
361 0.37
362 0.47
363 0.55
364 0.56
365 0.61
366 0.62
367 0.63
368 0.64
369 0.66
370 0.62
371 0.55
372 0.56
373 0.55
374 0.52
375 0.44
376 0.35
377 0.26
378 0.2
379 0.17
380 0.14
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.1
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.13
399 0.15
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.13
406 0.18
407 0.2
408 0.2
409 0.19
410 0.19
411 0.19
412 0.2
413 0.2
414 0.17
415 0.14
416 0.16
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.14
422 0.13
423 0.11
424 0.1
425 0.13
426 0.16
427 0.23
428 0.24
429 0.24
430 0.24
431 0.26
432 0.3
433 0.35
434 0.41
435 0.37
436 0.37
437 0.4
438 0.4
439 0.42
440 0.37
441 0.3
442 0.24
443 0.25
444 0.23
445 0.21
446 0.2
447 0.18
448 0.24
449 0.27
450 0.27
451 0.3
452 0.36
453 0.4
454 0.44
455 0.48
456 0.5
457 0.52
458 0.49
459 0.5
460 0.48
461 0.48
462 0.5
463 0.49
464 0.43
465 0.42
466 0.47
467 0.46
468 0.41
469 0.37
470 0.31
471 0.27
472 0.25
473 0.17
474 0.12
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.09
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.1
510 0.09
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.09
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.06
533 0.05
534 0.05
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.13
544 0.13
545 0.15
546 0.16
547 0.17
548 0.21
549 0.21
550 0.21
551 0.19
552 0.24
553 0.26
554 0.26
555 0.27
556 0.24
557 0.27
558 0.27
559 0.27
560 0.23
561 0.25
562 0.24
563 0.27
564 0.3
565 0.27
566 0.27
567 0.26
568 0.25
569 0.2
570 0.23
571 0.2
572 0.15
573 0.14
574 0.14
575 0.13
576 0.12
577 0.12
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.11
588 0.11
589 0.13
590 0.13
591 0.12
592 0.12
593 0.11
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.02
607 0.02
608 0.02
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.05
615 0.06
616 0.08
617 0.08
618 0.1
619 0.11
620 0.11
621 0.12
622 0.13
623 0.12
624 0.15
625 0.15
626 0.14
627 0.14
628 0.14
629 0.13
630 0.12
631 0.13
632 0.16
633 0.24
634 0.31