Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7JCE6

Protein Details
Accession A0A1J7JCE6    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MPKNKGKGGKNRRRGKNESDKEKRELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-23KNKGKGGKNRRRGKNESDKEK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
IPR018104  TIF_eIF-1A_CS  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01176  eIF-1a  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01262  IF1A  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MPKNKGKGGKNRRRGKNESDKEKRELTFKEEGQEYAQVIKMLGNGRLESMCFDGVKRLAHIRGKLRKKVWINQGDIILLSLRDYQDEKGDVILKYTADEARSLKAYGELPESAKINETDTYGADGDGDCGFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.86
3 0.86
4 0.85
5 0.86
6 0.86
7 0.81
8 0.77
9 0.75
10 0.66
11 0.61
12 0.53
13 0.48
14 0.46
15 0.42
16 0.41
17 0.37
18 0.36
19 0.32
20 0.31
21 0.25
22 0.19
23 0.19
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.16
46 0.2
47 0.24
48 0.3
49 0.38
50 0.44
51 0.5
52 0.49
53 0.53
54 0.54
55 0.57
56 0.58
57 0.56
58 0.53
59 0.48
60 0.47
61 0.39
62 0.35
63 0.27
64 0.18
65 0.1
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.16
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.12
82 0.14
83 0.13
84 0.11
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.16
90 0.14
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.19
95 0.18
96 0.18
97 0.2
98 0.21
99 0.19
100 0.2
101 0.18
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.15
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.13
111 0.12
112 0.12