Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C0NJ21

Protein Details
Accession C0NJ21    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28ATPSDSPPTTRKRKLDQVPALEHydrophilic
31-57LSAPEPPSKKALRKAKKKSAASQISDPHydrophilic
286-316SSEESKSTRTKEKKKKKLKMKRVWVNKIMGRHydrophilic
371-398GDDRSFQKPKAGKRQRPSKKGEPGSGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-49PSKKALRKAKKKS
294-310RTKEKKKKKLKMKRVWV
378-393KPKAGKRQRPSKKGEP
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSPKEATPSDSPPTTRKRKLDQVPALEIDLSAPEPPSKKALRKAKKKSAASQISDPSAQTSTINPTSKPQAAEQAEKPSKRSDYGVWVGNLPFVVKKDDIRAFFTSSGTLKSSDITRIHLPEGPKQNGKAQNKGFAYVDFTSNEAMETAIAMSEQLINGRRALIKNAKSFVGRPDKPNDEATSNKASKLSAHAPSRRVFVGNLGFDVTKEILEEHFKPCGVIEHIQLATFQDSGKCKGYAWIEFEGIDAAEVAMRGFVNVPEKDEDGDDDSEKDMDGSNADAASSSEESKSTRTKEKKKKKLKMKRVWVNKIMGRSLRMEFAEDKATRYKKRFGKDGTSKDKFGTEPERGDGQVGGNDIEALAIEEVSEGDDRSFQKPKAGKRQRPSKKGEPGSGGRYGQDVVHRLRGAIVESQGKKTTFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.59
3 0.62
4 0.64
5 0.68
6 0.74
7 0.8
8 0.83
9 0.83
10 0.8
11 0.77
12 0.71
13 0.63
14 0.53
15 0.43
16 0.32
17 0.24
18 0.17
19 0.11
20 0.11
21 0.13
22 0.15
23 0.17
24 0.24
25 0.3
26 0.36
27 0.45
28 0.56
29 0.63
30 0.72
31 0.81
32 0.85
33 0.88
34 0.88
35 0.87
36 0.87
37 0.86
38 0.8
39 0.77
40 0.71
41 0.64
42 0.58
43 0.49
44 0.4
45 0.32
46 0.26
47 0.2
48 0.17
49 0.2
50 0.27
51 0.28
52 0.26
53 0.29
54 0.35
55 0.38
56 0.38
57 0.33
58 0.36
59 0.38
60 0.43
61 0.43
62 0.47
63 0.51
64 0.5
65 0.5
66 0.46
67 0.45
68 0.41
69 0.4
70 0.33
71 0.34
72 0.38
73 0.41
74 0.35
75 0.35
76 0.33
77 0.3
78 0.27
79 0.19
80 0.16
81 0.12
82 0.15
83 0.14
84 0.16
85 0.22
86 0.28
87 0.29
88 0.33
89 0.34
90 0.33
91 0.33
92 0.32
93 0.27
94 0.23
95 0.23
96 0.19
97 0.17
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.2
102 0.2
103 0.21
104 0.24
105 0.24
106 0.26
107 0.28
108 0.28
109 0.3
110 0.38
111 0.39
112 0.38
113 0.38
114 0.44
115 0.5
116 0.52
117 0.53
118 0.47
119 0.5
120 0.48
121 0.48
122 0.41
123 0.32
124 0.33
125 0.25
126 0.25
127 0.17
128 0.17
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.09
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.14
150 0.2
151 0.26
152 0.29
153 0.33
154 0.34
155 0.34
156 0.33
157 0.33
158 0.36
159 0.38
160 0.34
161 0.34
162 0.39
163 0.41
164 0.42
165 0.44
166 0.38
167 0.31
168 0.31
169 0.31
170 0.33
171 0.3
172 0.28
173 0.26
174 0.23
175 0.21
176 0.24
177 0.25
178 0.24
179 0.3
180 0.33
181 0.36
182 0.37
183 0.38
184 0.34
185 0.3
186 0.23
187 0.21
188 0.21
189 0.18
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.11
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.18
226 0.21
227 0.21
228 0.23
229 0.22
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.16
234 0.13
235 0.09
236 0.06
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.11
247 0.11
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.13
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.14
278 0.19
279 0.21
280 0.3
281 0.39
282 0.5
283 0.6
284 0.71
285 0.78
286 0.84
287 0.9
288 0.92
289 0.93
290 0.94
291 0.94
292 0.94
293 0.93
294 0.92
295 0.91
296 0.87
297 0.83
298 0.75
299 0.68
300 0.62
301 0.54
302 0.45
303 0.39
304 0.34
305 0.3
306 0.27
307 0.26
308 0.22
309 0.22
310 0.28
311 0.25
312 0.26
313 0.31
314 0.37
315 0.41
316 0.45
317 0.51
318 0.5
319 0.57
320 0.63
321 0.62
322 0.66
323 0.7
324 0.76
325 0.77
326 0.75
327 0.69
328 0.62
329 0.58
330 0.47
331 0.43
332 0.4
333 0.35
334 0.33
335 0.34
336 0.36
337 0.33
338 0.33
339 0.28
340 0.22
341 0.18
342 0.16
343 0.13
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.11
360 0.14
361 0.19
362 0.25
363 0.24
364 0.33
365 0.39
366 0.48
367 0.55
368 0.64
369 0.69
370 0.74
371 0.84
372 0.87
373 0.9
374 0.9
375 0.89
376 0.88
377 0.87
378 0.83
379 0.8
380 0.76
381 0.72
382 0.69
383 0.6
384 0.49
385 0.43
386 0.36
387 0.3
388 0.29
389 0.29
390 0.27
391 0.34
392 0.33
393 0.32
394 0.33
395 0.32
396 0.29
397 0.27
398 0.28
399 0.3
400 0.32
401 0.37
402 0.4