Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C0NEM5

Protein Details
Accession C0NEM5    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-70SRSERRDRDRDLDRERKRRDRSRERRHERDADGDEBasic
81-114SANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDRDDPYRSSGBasic
148-175ERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSRBasic
459-479EPTPDEKRKVPKPQVNAKPLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-106RRDRDRDLDRERKRRDRSRERRHERDADGDEEMKSPKSDRASANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDR
143-175RSRRDERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12283  RRM1_RBM39_like  
cd12284  RRM2_RBM23_RBM39  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSGIDVEALLESTAAPAAPPHPEETPDKSHDESNGSRSERRDRDRDLDRERKRRDRSRERRHERDADGDEEMKSPKSDRASANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDRDDPYRSSGGDYYRGPGRTTRSRSRSPYDDRYYRPTGRSRRDERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSRSPEPQLTEDERDRRTVFVQQLAARLRTKELIAFFEKVGPVKEAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKNEESVPLAIQLTGQKLLGIPIIAQLTEAEKNRQARNPEANVSGNQNSIPFHRLYVGNIHFSITESDLQKVFEPFGELDFVQLQKEEGGRSRGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRPIRVGLGNDKFTPESTANLLQRFQGQGAHHNFQGSLFSGHGGRGAQAGGSGHFDRAGGRDNDKAAGGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPAVEPTPDEKRKVPKPQVNAKPLPVSVNMASRCVLLRNMFDPAEEEGESWIKELEDDVRAECEDKYGHVVHIALDPNTQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGRQISAQPVVDAVYSSLFTRSKAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.08
5 0.13
6 0.15
7 0.17
8 0.19
9 0.23
10 0.28
11 0.34
12 0.39
13 0.39
14 0.42
15 0.41
16 0.42
17 0.42
18 0.44
19 0.4
20 0.39
21 0.43
22 0.42
23 0.44
24 0.46
25 0.53
26 0.56
27 0.6
28 0.62
29 0.61
30 0.66
31 0.71
32 0.76
33 0.76
34 0.77
35 0.8
36 0.82
37 0.85
38 0.86
39 0.87
40 0.88
41 0.89
42 0.89
43 0.91
44 0.92
45 0.93
46 0.93
47 0.93
48 0.92
49 0.9
50 0.82
51 0.8
52 0.73
53 0.65
54 0.59
55 0.51
56 0.42
57 0.36
58 0.33
59 0.25
60 0.21
61 0.19
62 0.21
63 0.24
64 0.29
65 0.3
66 0.35
67 0.4
68 0.47
69 0.54
70 0.58
71 0.58
72 0.62
73 0.65
74 0.67
75 0.67
76 0.69
77 0.72
78 0.73
79 0.77
80 0.78
81 0.84
82 0.85
83 0.89
84 0.9
85 0.9
86 0.89
87 0.91
88 0.9
89 0.9
90 0.88
91 0.88
92 0.88
93 0.87
94 0.86
95 0.8
96 0.77
97 0.71
98 0.62
99 0.55
100 0.47
101 0.4
102 0.36
103 0.32
104 0.28
105 0.29
106 0.3
107 0.28
108 0.29
109 0.33
110 0.38
111 0.46
112 0.53
113 0.54
114 0.61
115 0.67
116 0.7
117 0.72
118 0.7
119 0.72
120 0.71
121 0.71
122 0.67
123 0.68
124 0.69
125 0.64
126 0.61
127 0.6
128 0.61
129 0.63
130 0.69
131 0.7
132 0.72
133 0.75
134 0.78
135 0.75
136 0.77
137 0.74
138 0.7
139 0.71
140 0.67
141 0.66
142 0.66
143 0.67
144 0.66
145 0.68
146 0.73
147 0.75
148 0.81
149 0.85
150 0.86
151 0.84
152 0.79
153 0.81
154 0.8
155 0.8
156 0.8
157 0.79
158 0.75
159 0.78
160 0.8
161 0.79
162 0.8
163 0.79
164 0.78
165 0.74
166 0.71
167 0.69
168 0.66
169 0.62
170 0.56
171 0.51
172 0.42
173 0.4
174 0.37
175 0.33
176 0.3
177 0.31
178 0.28
179 0.27
180 0.3
181 0.28
182 0.33
183 0.33
184 0.35
185 0.3
186 0.28
187 0.25
188 0.22
189 0.21
190 0.18
191 0.17
192 0.19
193 0.2
194 0.21
195 0.2
196 0.21
197 0.21
198 0.19
199 0.18
200 0.15
201 0.13
202 0.12
203 0.17
204 0.16
205 0.18
206 0.25
207 0.26
208 0.25
209 0.31
210 0.31
211 0.3
212 0.33
213 0.33
214 0.27
215 0.31
216 0.31
217 0.26
218 0.26
219 0.25
220 0.24
221 0.26
222 0.26
223 0.22
224 0.21
225 0.21
226 0.2
227 0.17
228 0.15
229 0.12
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.15
255 0.19
256 0.22
257 0.26
258 0.27
259 0.3
260 0.36
261 0.37
262 0.36
263 0.35
264 0.33
265 0.3
266 0.31
267 0.26
268 0.19
269 0.16
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.18
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.1
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.23
322 0.23
323 0.22
324 0.31
325 0.31
326 0.27
327 0.28
328 0.29
329 0.24
330 0.26
331 0.27
332 0.19
333 0.21
334 0.19
335 0.18
336 0.15
337 0.14
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.15
350 0.18
351 0.21
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.21
356 0.24
357 0.17
358 0.14
359 0.15
360 0.21
361 0.22
362 0.23
363 0.23
364 0.2
365 0.21
366 0.21
367 0.18
368 0.17
369 0.15
370 0.22
371 0.28
372 0.29
373 0.28
374 0.27
375 0.27
376 0.22
377 0.23
378 0.16
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.1
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.17
401 0.15
402 0.17
403 0.2
404 0.2
405 0.21
406 0.21
407 0.19
408 0.13
409 0.11
410 0.09
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.11
430 0.15
431 0.15
432 0.17
433 0.24
434 0.27
435 0.27
436 0.3
437 0.31
438 0.3
439 0.34
440 0.36
441 0.32
442 0.31
443 0.32
444 0.29
445 0.28
446 0.26
447 0.24
448 0.29
449 0.29
450 0.29
451 0.32
452 0.4
453 0.48
454 0.59
455 0.66
456 0.64
457 0.7
458 0.77
459 0.82
460 0.82
461 0.78
462 0.72
463 0.66
464 0.59
465 0.53
466 0.43
467 0.38
468 0.3
469 0.33
470 0.29
471 0.26
472 0.26
473 0.23
474 0.23
475 0.2
476 0.21
477 0.16
478 0.19
479 0.19
480 0.23
481 0.22
482 0.22
483 0.22
484 0.21
485 0.21
486 0.18
487 0.17
488 0.15
489 0.17
490 0.17
491 0.15
492 0.13
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.15
500 0.16
501 0.17
502 0.18
503 0.17
504 0.16
505 0.14
506 0.14
507 0.18
508 0.17
509 0.17
510 0.18
511 0.18
512 0.17
513 0.21
514 0.23
515 0.19
516 0.18
517 0.18
518 0.17
519 0.17
520 0.15
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.16
525 0.2
526 0.21
527 0.21
528 0.23
529 0.26
530 0.26
531 0.27
532 0.24
533 0.27
534 0.28
535 0.27
536 0.27
537 0.24
538 0.23
539 0.21
540 0.22
541 0.19
542 0.17
543 0.19
544 0.18
545 0.19
546 0.26
547 0.28
548 0.26
549 0.25
550 0.28
551 0.3
552 0.31
553 0.31
554 0.24
555 0.2
556 0.2
557 0.17
558 0.14
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.15
564 0.15