FuNGI

A0A1J7I7F8

Protein Details

Accession

A0A1J7I7F8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-49	MEEQKSEKKHKRSKSEHKKRPREEDEAATPRHHKKSKKHQDNEPSSEDD	Basic
56-83	GSVNGDSKKKSKKHKKSKDVTNGKDVKT	Basic
90-114	EVEELSKKSKKKHKKHLEAEPEVEH	Basic
119-168	APQDAEQTPKKRKKDKSKKREEDQEPAEEAQSKRKSKKKRKEREEAAVAT	Basic
434-458	RAMGRQEREIERRRREKQNPGGLLR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-38	SEKKHKRSKSEHKKRPREEDEAATPRHHKKSKK
63-73	KKKSKKHKKSK
96-105	KKSKKKHKKH
127-161	PKKRKKDKSKKREEDQEPAEEAQSKRKSKKKRKER

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MEEQKSEKKHKRSKSEHKKRPREEDEAATPRHHKKSKKHQDNEPSSEDDHAVKQEGSVNGDSKKKSKKHKKSKDVTNGKDVKTEADAPSEVEELSKKSKKKHKKHLEAEPEVEHEASDAPQDAEQTPKKRKKDKSKKREEDQEPAEEAQSKRKSKKKRKEREEAAVATDDGAEPMDVDQPRTTAATSEPSSDSGFPFYTQTVSLYVPFFPIGFDKPITNVTSQHLEPLLNHYSPLLRGVLLAYRNVNLSERPVRPNLKNLPDDHTPALLESLDEYAVGFGWLTADVDLFIPSRGAWMEGTVNLQSEGHIGVVCWNKFNASIEAKRLPAGWRWVDLNENGDNSNANGRAKGKHTFLSADPDTPDADPENEGTDTLDDSPLELAELHTTGYWVDEAGARVSAKPLRFRIKNFDVGVAGDYGYISIEGTTLNDEEERAMGRQEREIERRRREKQNPGGLLRPMLRRVPEFSLTSFGKEEQEEDSIKKTVLYQGSRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.91
2	0.93
3	0.93
4	0.95
5	0.96
6	0.94
7	0.94
8	0.91
9	0.88
10	0.83
11	0.8
12	0.79
13	0.75
14	0.68
15	0.61
16	0.6
17	0.6
18	0.64
19	0.62
20	0.61
21	0.65
22	0.74
23	0.81
24	0.85
25	0.85
26	0.86
27	0.9
28	0.92
29	0.88
30	0.81
31	0.74
32	0.64
33	0.57
34	0.48
35	0.39
36	0.31
37	0.25
38	0.23
39	0.19
40	0.19
41	0.22
42	0.22
43	0.24
44	0.25
45	0.26
46	0.28
47	0.34
48	0.36
49	0.38
50	0.46
51	0.49
52	0.58
53	0.66
54	0.73
55	0.79
56	0.88
57	0.91
58	0.92
59	0.95
60	0.95
61	0.95
62	0.89
63	0.88
64	0.85
65	0.75
66	0.68
67	0.58
68	0.49
69	0.42
70	0.4
71	0.31
72	0.27
73	0.26
74	0.22
75	0.24
76	0.22
77	0.17
78	0.14
79	0.14
80	0.14
81	0.22
82	0.27
83	0.29
84	0.38
85	0.48
86	0.59
87	0.68
88	0.76
89	0.79
90	0.85
91	0.9
92	0.92
93	0.92
94	0.88
95	0.81
96	0.72
97	0.63
98	0.53
99	0.43
100	0.32
101	0.21
102	0.16
103	0.12
104	0.1
105	0.08
106	0.08
107	0.08
108	0.1
109	0.11
110	0.17
111	0.23
112	0.3
113	0.39
114	0.47
115	0.55
116	0.63
117	0.73
118	0.78
119	0.83
120	0.87
121	0.88
122	0.91
123	0.93
124	0.93
125	0.93
126	0.88
127	0.86
128	0.8
129	0.73
130	0.64
131	0.55
132	0.47
133	0.41
134	0.35
135	0.35
136	0.38
137	0.39
138	0.44
139	0.51
140	0.62
141	0.68
142	0.78
143	0.8
144	0.83
145	0.87
146	0.9
147	0.91
148	0.9
149	0.87
150	0.78
151	0.69
152	0.59
153	0.49
154	0.38
155	0.29
156	0.19
157	0.1
158	0.08
159	0.05
160	0.04
161	0.05
162	0.09
163	0.09
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.12
170	0.08
171	0.09
172	0.13
173	0.14
174	0.16
175	0.16
176	0.17
177	0.18
178	0.18
179	0.17
180	0.14
181	0.13
182	0.11
183	0.12
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.09
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.14
204	0.15
205	0.14
206	0.14
207	0.14
208	0.17
209	0.17
210	0.17
211	0.15
212	0.14
213	0.13
214	0.17
215	0.18
216	0.14
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.14
222	0.09
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.08
235	0.11
236	0.17
237	0.19
238	0.21
239	0.26
240	0.3
241	0.3
242	0.38
243	0.41
244	0.41
245	0.42
246	0.41
247	0.41
248	0.39
249	0.41
250	0.34
251	0.28
252	0.21
253	0.17
254	0.16
255	0.11
256	0.08
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.03
266	0.02
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.05
281	0.06
282	0.05
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.1
298	0.15
299	0.15
300	0.15
301	0.15
302	0.15
303	0.16
304	0.18
305	0.18
306	0.19
307	0.21
308	0.25
309	0.28
310	0.28
311	0.27
312	0.26
313	0.23
314	0.22
315	0.26
316	0.23
317	0.22
318	0.23
319	0.24
320	0.25
321	0.24
322	0.24
323	0.18
324	0.18
325	0.16
326	0.15
327	0.14
328	0.12
329	0.15
330	0.14
331	0.13
332	0.14
333	0.16
334	0.19
335	0.23
336	0.26
337	0.25
338	0.26
339	0.28
340	0.28
341	0.28
342	0.33
343	0.3
344	0.28
345	0.25
346	0.24
347	0.23
348	0.2
349	0.2
350	0.13
351	0.13
352	0.11
353	0.11
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.06
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.06
377	0.05
378	0.06
379	0.07
380	0.09
381	0.09
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.15
386	0.19
387	0.2
388	0.26
389	0.32
390	0.4
391	0.44
392	0.49
393	0.55
394	0.57
395	0.62
396	0.57
397	0.52
398	0.43
399	0.39
400	0.36
401	0.27
402	0.2
403	0.12
404	0.1
405	0.08
406	0.07
407	0.06
408	0.05
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.07
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.1
420	0.11
421	0.1
422	0.13
423	0.17
424	0.18
425	0.22
426	0.29
427	0.35
428	0.42
429	0.52
430	0.59
431	0.65
432	0.74
433	0.78
434	0.82
435	0.84
436	0.85
437	0.86
438	0.87
439	0.85
440	0.8
441	0.77
442	0.69
443	0.65
444	0.6
445	0.54
446	0.48
447	0.44
448	0.42
449	0.39
450	0.42
451	0.43
452	0.42
453	0.39
454	0.37
455	0.4
456	0.37
457	0.37
458	0.33
459	0.29
460	0.27
461	0.25
462	0.25
463	0.21
464	0.24
465	0.24
466	0.24
467	0.27
468	0.25
469	0.25
470	0.24
471	0.23
472	0.26
473	0.32
474	0.35
475	0.35
476	0.44
477	0.49
478	0.49

A0A1J7I7F8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer