Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7J6N2

Protein Details
Accession A0A1J7J6N2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
614-642EDIEKIQKQMPRKTKKKRRLDDDTWEEYTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
624-632PRKTKKKRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences METVHGPPRVKNKAAAPVQISAEQLLREAVDRQEVALQAPQQRFADLEELHEFQARKRREFENYIQRNRVRLDNWTKYAQWELEQKEFARARSIFERALDVHPNSIQVWIRYIESELKNRNINHARNVLDRAVTRLPRVDKLWYKYLYVEEMLGNIPGVRQVFDRWMKWEPDEQAFNAYIRLEKRYGEYDRARDIFRLFTMIHPEPRNWIKWAKFEEEFGTSDLVREVFQTAIESLGDELVDEKLFIAYARYEAKLKDYDRARAIYKFGLDNLPRSRSMLLHKEYTTFEKQFGDKEGVEDVVLSKRRRHYEEQVKENPKNYDIWFDYARLEEASGNVDRIRDVYEKAVAQVPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEELEAKDIERARQIYDTCLSLIPHKKFTFAKIWLHKAYFEIRQGQLTTARKTLGRAIGMCPKDKIFKGYIDLEQKLYEFDRCRTLYEKHVLYNPANCQTWVKWAELERGLDDLDRTRSIFELGIAQPILDMPEVVWKAYIDFEEEEGEYEKTRALYERLLEKANHPKVWISYAQFEINIPEGADEEEEEEVERPISEEAKARARAVFERAHKNMKERELKNERVTILNAWLAFERTHGSEEDIEKIQKQMPRKTKKKRRLDDDTWEEYTDYVFPADDQQTKNLSNLLAMAQAWKQTGGSIQAGGGGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.54
4 0.5
5 0.5
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.23
24 0.26
25 0.28
26 0.3
27 0.33
28 0.3
29 0.3
30 0.29
31 0.27
32 0.29
33 0.22
34 0.25
35 0.25
36 0.26
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.35
42 0.36
43 0.36
44 0.4
45 0.45
46 0.49
47 0.57
48 0.62
49 0.64
50 0.69
51 0.73
52 0.76
53 0.73
54 0.7
55 0.65
56 0.61
57 0.52
58 0.52
59 0.54
60 0.54
61 0.56
62 0.56
63 0.54
64 0.5
65 0.53
66 0.44
67 0.38
68 0.37
69 0.37
70 0.38
71 0.41
72 0.39
73 0.43
74 0.44
75 0.4
76 0.4
77 0.35
78 0.35
79 0.37
80 0.4
81 0.33
82 0.31
83 0.34
84 0.29
85 0.33
86 0.34
87 0.29
88 0.28
89 0.27
90 0.28
91 0.24
92 0.26
93 0.24
94 0.18
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.2
100 0.24
101 0.26
102 0.33
103 0.35
104 0.39
105 0.44
106 0.44
107 0.52
108 0.53
109 0.53
110 0.52
111 0.53
112 0.51
113 0.49
114 0.52
115 0.44
116 0.38
117 0.35
118 0.33
119 0.33
120 0.32
121 0.3
122 0.32
123 0.34
124 0.35
125 0.36
126 0.4
127 0.41
128 0.44
129 0.51
130 0.46
131 0.45
132 0.43
133 0.42
134 0.36
135 0.29
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.18
150 0.23
151 0.24
152 0.27
153 0.31
154 0.32
155 0.34
156 0.38
157 0.34
158 0.35
159 0.36
160 0.32
161 0.31
162 0.29
163 0.27
164 0.22
165 0.19
166 0.17
167 0.16
168 0.19
169 0.16
170 0.17
171 0.19
172 0.25
173 0.28
174 0.33
175 0.37
176 0.38
177 0.43
178 0.44
179 0.42
180 0.37
181 0.35
182 0.29
183 0.24
184 0.23
185 0.17
186 0.16
187 0.23
188 0.24
189 0.29
190 0.28
191 0.28
192 0.32
193 0.35
194 0.36
195 0.31
196 0.35
197 0.33
198 0.38
199 0.42
200 0.41
201 0.38
202 0.37
203 0.36
204 0.32
205 0.3
206 0.24
207 0.21
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.16
242 0.2
243 0.21
244 0.26
245 0.26
246 0.31
247 0.32
248 0.35
249 0.34
250 0.3
251 0.31
252 0.26
253 0.25
254 0.2
255 0.18
256 0.22
257 0.2
258 0.24
259 0.26
260 0.27
261 0.25
262 0.26
263 0.26
264 0.22
265 0.26
266 0.29
267 0.28
268 0.29
269 0.29
270 0.3
271 0.31
272 0.34
273 0.34
274 0.27
275 0.25
276 0.23
277 0.24
278 0.23
279 0.24
280 0.22
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.16
290 0.16
291 0.2
292 0.25
293 0.3
294 0.35
295 0.4
296 0.46
297 0.52
298 0.59
299 0.64
300 0.68
301 0.7
302 0.67
303 0.65
304 0.56
305 0.46
306 0.41
307 0.32
308 0.28
309 0.23
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.17
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.11
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.16
335 0.13
336 0.13
337 0.16
338 0.16
339 0.21
340 0.23
341 0.24
342 0.24
343 0.35
344 0.42
345 0.5
346 0.54
347 0.5
348 0.52
349 0.56
350 0.62
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.36
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.06
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.15
378 0.15
379 0.14
380 0.17
381 0.24
382 0.24
383 0.3
384 0.29
385 0.32
386 0.32
387 0.35
388 0.37
389 0.34
390 0.4
391 0.4
392 0.46
393 0.45
394 0.45
395 0.41
396 0.36
397 0.35
398 0.3
399 0.26
400 0.25
401 0.23
402 0.24
403 0.24
404 0.23
405 0.27
406 0.27
407 0.26
408 0.23
409 0.24
410 0.22
411 0.23
412 0.27
413 0.24
414 0.22
415 0.21
416 0.22
417 0.29
418 0.3
419 0.3
420 0.26
421 0.24
422 0.26
423 0.26
424 0.27
425 0.21
426 0.21
427 0.24
428 0.27
429 0.3
430 0.32
431 0.32
432 0.29
433 0.27
434 0.25
435 0.23
436 0.2
437 0.19
438 0.16
439 0.17
440 0.23
441 0.23
442 0.26
443 0.28
444 0.3
445 0.33
446 0.37
447 0.37
448 0.32
449 0.36
450 0.38
451 0.35
452 0.38
453 0.35
454 0.33
455 0.31
456 0.3
457 0.28
458 0.25
459 0.31
460 0.28
461 0.25
462 0.23
463 0.24
464 0.29
465 0.3
466 0.3
467 0.23
468 0.22
469 0.21
470 0.18
471 0.17
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.11
481 0.14
482 0.14
483 0.16
484 0.15
485 0.14
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.07
490 0.07
491 0.04
492 0.11
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.14
499 0.14
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.12
509 0.11
510 0.12
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.16
516 0.19
517 0.24
518 0.26
519 0.29
520 0.28
521 0.32
522 0.41
523 0.44
524 0.41
525 0.36
526 0.36
527 0.35
528 0.39
529 0.37
530 0.3
531 0.28
532 0.29
533 0.29
534 0.27
535 0.26
536 0.23
537 0.2
538 0.17
539 0.13
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.08
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.07
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.15
558 0.18
559 0.26
560 0.28
561 0.29
562 0.3
563 0.32
564 0.33
565 0.33
566 0.37
567 0.36
568 0.44
569 0.47
570 0.54
571 0.53
572 0.57
573 0.6
574 0.62
575 0.65
576 0.58
577 0.64
578 0.64
579 0.7
580 0.68
581 0.67
582 0.59
583 0.52
584 0.51
585 0.42
586 0.37
587 0.32
588 0.26
589 0.21
590 0.21
591 0.19
592 0.17
593 0.16
594 0.15
595 0.14
596 0.16
597 0.15
598 0.17
599 0.21
600 0.23
601 0.26
602 0.27
603 0.27
604 0.26
605 0.28
606 0.29
607 0.28
608 0.35
609 0.41
610 0.48
611 0.58
612 0.67
613 0.76
614 0.83
615 0.9
616 0.93
617 0.93
618 0.93
619 0.92
620 0.9
621 0.9
622 0.87
623 0.84
624 0.76
625 0.66
626 0.56
627 0.45
628 0.38
629 0.27
630 0.19
631 0.12
632 0.1
633 0.09
634 0.15
635 0.2
636 0.24
637 0.26
638 0.29
639 0.34
640 0.35
641 0.36
642 0.32
643 0.27
644 0.22
645 0.21
646 0.18
647 0.15
648 0.14
649 0.16
650 0.15
651 0.17
652 0.17
653 0.16
654 0.15
655 0.14
656 0.17
657 0.18
658 0.18
659 0.16
660 0.15