Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7J374

Protein Details
Accession A0A1J7J374    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-62LSLPEPPSKKAKRLLKKGKTLPPKPTSDHydrophilic
124-151ITRVHMPSNKPEKKEKRKKGAQNKGFAYHydrophilic
345-387EDDQSRYKKRFGKDRPERKAGDKPARPGKTERKAERSWKDRRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-57PSKKAKRLLKKGKTLPP
133-144KPEKKEKRKKGA
352-386KKRFGKDRPERKAGDKPARPGKTERKAERSWKDRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTTDDIEVPEATASSPAPTNSKKRKTSVPEIAVDLSLPEPPSKKAKRLLKKGKTLPPKPTSDDEGADDDPEKAAAAAEAKKAAAKKERSPYGVWIGNLRFHVTKTQLREWLISNSGGVITEELITRVHMPSNKPEKKEKRKKGAQNKGFAYVDFSTLEANVAAIALSENDLAGRKLLIKDAKSYDGRPAKVEPEPVAADPNAPAKSGKKVDENASKVTKVFVGNLSFNTTEDELWAHFEKCGPIRWVKVATFEDTGKCKGYGWVNFQEPEGAQWASKGFVKIKEVIETIEDFMEEGNGAKTADSDDETDGDEQKEGKSQLVRREKVRKWWVNQLNGRQLKLELAEDDQSRYKKRFGKDRPERKAGDKPARPGKTERKAERSWKDRRDEDNAADPGPLAAEAPKKAKEPSMSYHDDIQVARMTGAAVKPQGKKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.14
4 0.2
5 0.27
6 0.37
7 0.47
8 0.56
9 0.61
10 0.64
11 0.73
12 0.75
13 0.79
14 0.8
15 0.76
16 0.69
17 0.66
18 0.62
19 0.52
20 0.42
21 0.33
22 0.22
23 0.18
24 0.15
25 0.14
26 0.15
27 0.18
28 0.29
29 0.33
30 0.4
31 0.47
32 0.57
33 0.64
34 0.74
35 0.82
36 0.82
37 0.86
38 0.89
39 0.9
40 0.9
41 0.87
42 0.86
43 0.82
44 0.79
45 0.74
46 0.69
47 0.65
48 0.58
49 0.52
50 0.45
51 0.42
52 0.36
53 0.31
54 0.27
55 0.21
56 0.17
57 0.15
58 0.12
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.1
63 0.12
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.17
68 0.19
69 0.24
70 0.3
71 0.33
72 0.4
73 0.48
74 0.55
75 0.56
76 0.56
77 0.56
78 0.54
79 0.52
80 0.44
81 0.41
82 0.36
83 0.36
84 0.34
85 0.32
86 0.25
87 0.22
88 0.26
89 0.26
90 0.3
91 0.33
92 0.38
93 0.4
94 0.41
95 0.42
96 0.4
97 0.38
98 0.35
99 0.29
100 0.23
101 0.18
102 0.16
103 0.14
104 0.12
105 0.08
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.12
115 0.14
116 0.17
117 0.26
118 0.38
119 0.43
120 0.45
121 0.55
122 0.63
123 0.71
124 0.8
125 0.81
126 0.8
127 0.85
128 0.91
129 0.92
130 0.92
131 0.88
132 0.86
133 0.78
134 0.73
135 0.64
136 0.53
137 0.47
138 0.36
139 0.3
140 0.21
141 0.19
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.07
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.12
164 0.15
165 0.16
166 0.2
167 0.22
168 0.27
169 0.27
170 0.27
171 0.32
172 0.34
173 0.34
174 0.32
175 0.31
176 0.29
177 0.29
178 0.31
179 0.23
180 0.2
181 0.21
182 0.19
183 0.19
184 0.15
185 0.14
186 0.12
187 0.15
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.17
193 0.2
194 0.22
195 0.22
196 0.25
197 0.31
198 0.38
199 0.39
200 0.38
201 0.37
202 0.34
203 0.3
204 0.28
205 0.23
206 0.16
207 0.15
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.17
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.13
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.07
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.17
229 0.16
230 0.18
231 0.19
232 0.22
233 0.24
234 0.22
235 0.27
236 0.25
237 0.25
238 0.24
239 0.24
240 0.24
241 0.23
242 0.24
243 0.19
244 0.18
245 0.15
246 0.17
247 0.21
248 0.23
249 0.27
250 0.31
251 0.32
252 0.32
253 0.32
254 0.3
255 0.24
256 0.2
257 0.17
258 0.12
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.15
267 0.18
268 0.22
269 0.23
270 0.25
271 0.23
272 0.22
273 0.21
274 0.19
275 0.17
276 0.12
277 0.11
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.15
302 0.14
303 0.16
304 0.21
305 0.25
306 0.34
307 0.44
308 0.48
309 0.51
310 0.61
311 0.62
312 0.67
313 0.73
314 0.72
315 0.67
316 0.74
317 0.73
318 0.73
319 0.76
320 0.74
321 0.73
322 0.68
323 0.64
324 0.54
325 0.46
326 0.38
327 0.32
328 0.25
329 0.16
330 0.15
331 0.19
332 0.18
333 0.21
334 0.24
335 0.27
336 0.3
337 0.31
338 0.36
339 0.39
340 0.45
341 0.53
342 0.59
343 0.66
344 0.73
345 0.82
346 0.84
347 0.85
348 0.82
349 0.78
350 0.77
351 0.76
352 0.76
353 0.71
354 0.71
355 0.73
356 0.73
357 0.7
358 0.69
359 0.69
360 0.69
361 0.73
362 0.73
363 0.71
364 0.74
365 0.81
366 0.82
367 0.8
368 0.8
369 0.79
370 0.79
371 0.79
372 0.78
373 0.76
374 0.72
375 0.68
376 0.67
377 0.6
378 0.52
379 0.44
380 0.37
381 0.28
382 0.22
383 0.17
384 0.08
385 0.1
386 0.14
387 0.17
388 0.22
389 0.25
390 0.27
391 0.3
392 0.35
393 0.38
394 0.4
395 0.43
396 0.47
397 0.51
398 0.51
399 0.54
400 0.51
401 0.47
402 0.41
403 0.37
404 0.32
405 0.26
406 0.24
407 0.18
408 0.16
409 0.17
410 0.18
411 0.19
412 0.21
413 0.28
414 0.32
415 0.39
416 0.47