Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C0NQD1

Protein Details
Accession C0NQD1    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-82PVAPKKRTTSRAKIVRKPAAHydrophilic
93-137DTSTFRTNKKDKRQIKHSVFISRIEKPRTKTLKRRRPSKKLVANLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-132KKDKRQIKHSVFISRIEKPRTKTLKRRRPSKK
175-192SLKHKPGAMKRKEMLDRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.333, cyto_mito 4.833, mito 4.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MDNSSQNPPLGIWAKISTRVPESLNLKLVLMARPFGGRTFLDVLGFSTVPEPSFARDPTDAAPVAPKKRTTSRAKIVRKPAAIPIPSSSPFSDTSTFRTNKKDKRQIKHSVFISRIEKPRTKTLKRRRPSKKLVANLDSLIDALPDAGDENNNPNHSDGHREMIAGQVNIIRQKSLKHKPGAMKRKEMLDRRERERFARNLAQMAVVAPSPPIDAEFSNHTQPHPRPQPGAESVPTSNRWAALRSFITQTIDQNPEFNKAARPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.33
4 0.29
5 0.3
6 0.32
7 0.31
8 0.34
9 0.36
10 0.35
11 0.37
12 0.34
13 0.3
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.25
18 0.21
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.17
23 0.18
24 0.14
25 0.17
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.18
30 0.19
31 0.18
32 0.18
33 0.14
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.16
41 0.16
42 0.19
43 0.19
44 0.21
45 0.21
46 0.25
47 0.22
48 0.18
49 0.24
50 0.26
51 0.3
52 0.32
53 0.33
54 0.34
55 0.41
56 0.5
57 0.52
58 0.56
59 0.62
60 0.68
61 0.75
62 0.78
63 0.8
64 0.79
65 0.72
66 0.64
67 0.61
68 0.57
69 0.49
70 0.43
71 0.35
72 0.32
73 0.31
74 0.31
75 0.25
76 0.2
77 0.21
78 0.22
79 0.23
80 0.19
81 0.23
82 0.29
83 0.3
84 0.3
85 0.38
86 0.43
87 0.49
88 0.59
89 0.65
90 0.66
91 0.73
92 0.8
93 0.82
94 0.79
95 0.78
96 0.71
97 0.67
98 0.59
99 0.55
100 0.5
101 0.45
102 0.45
103 0.42
104 0.42
105 0.39
106 0.48
107 0.52
108 0.55
109 0.6
110 0.66
111 0.71
112 0.75
113 0.82
114 0.82
115 0.83
116 0.85
117 0.85
118 0.82
119 0.79
120 0.78
121 0.7
122 0.62
123 0.52
124 0.43
125 0.32
126 0.24
127 0.16
128 0.09
129 0.06
130 0.04
131 0.03
132 0.02
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.07
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.19
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.14
153 0.13
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.15
158 0.12
159 0.11
160 0.16
161 0.25
162 0.33
163 0.39
164 0.41
165 0.47
166 0.55
167 0.65
168 0.72
169 0.68
170 0.66
171 0.61
172 0.65
173 0.67
174 0.65
175 0.64
176 0.63
177 0.65
178 0.64
179 0.7
180 0.64
181 0.61
182 0.61
183 0.56
184 0.54
185 0.55
186 0.49
187 0.44
188 0.42
189 0.38
190 0.29
191 0.26
192 0.19
193 0.11
194 0.1
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.11
203 0.16
204 0.19
205 0.24
206 0.25
207 0.26
208 0.32
209 0.34
210 0.43
211 0.46
212 0.47
213 0.46
214 0.47
215 0.54
216 0.51
217 0.54
218 0.45
219 0.4
220 0.38
221 0.39
222 0.39
223 0.35
224 0.3
225 0.28
226 0.27
227 0.25
228 0.24
229 0.27
230 0.28
231 0.27
232 0.29
233 0.29
234 0.33
235 0.32
236 0.34
237 0.34
238 0.35
239 0.32
240 0.33
241 0.33
242 0.34
243 0.34
244 0.32