Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7JWK7

Protein Details
Accession A0A1J7JWK7    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-90KDFPNWHKKNYAPKNPRSWYRVHydrophilic
357-399LNFKPSTQKRAPPPPPKPSTEPARTPKQSSPPPKPRQPVQSSAHydrophilic
424-449GSPPPAMMRKRKQPAVFMRQIKKPRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
360-391KPSTQKRAPPPPPKPSTEPARTPKQSSPPPKP
432-436RKRKQ
445-446KK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAPPSLVDICIRKCIKHASMIHDLGDLPFHLAKPILRKIDNADQLREIELNSPHFTDETPEIWKKLIAKDFPNWHKKNYAPKNPRSWYRVYARYKQENAAELAAAADRLKNAFSTLKAQKDSKTTGTIATKDLKLLPSLPRDGRPVGGTRGPGRGLPDHLTWGGGSRTKLTDGQSFLRKAKREAREVAYRRQLATPTGKLKVPQGQIKKAPEAMVQQYRVQRQEELRIRPPRRKSEQQLAEEAERREKEARLIKIKNPSGARPAQMVSDSEEDDDDDDEEDDGKSYRGLADLIGYDEDDAELFGDGDEGATSEPQRPSKTEPQKKPATTAYHSDSSPAPPRRPALLSNSRKPGGGLLNFKPSTQKRAPPPPPKPSTEPARTPKQSSPPPKPRQPVQSSAPPPPPVETQPVQSSPPLRPQPTAAGSPPPAMMRKRKQPAVFMRQIKKPRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.46
4 0.49
5 0.47
6 0.55
7 0.56
8 0.52
9 0.45
10 0.41
11 0.32
12 0.28
13 0.21
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.18
20 0.24
21 0.32
22 0.36
23 0.35
24 0.38
25 0.44
26 0.52
27 0.58
28 0.54
29 0.49
30 0.44
31 0.44
32 0.44
33 0.37
34 0.28
35 0.24
36 0.24
37 0.25
38 0.24
39 0.24
40 0.22
41 0.22
42 0.22
43 0.21
44 0.2
45 0.18
46 0.24
47 0.26
48 0.26
49 0.26
50 0.28
51 0.28
52 0.32
53 0.37
54 0.36
55 0.38
56 0.45
57 0.54
58 0.62
59 0.69
60 0.64
61 0.6
62 0.61
63 0.62
64 0.66
65 0.66
66 0.68
67 0.67
68 0.73
69 0.8
70 0.81
71 0.83
72 0.78
73 0.72
74 0.69
75 0.67
76 0.68
77 0.65
78 0.67
79 0.68
80 0.72
81 0.69
82 0.66
83 0.62
84 0.55
85 0.5
86 0.42
87 0.32
88 0.23
89 0.2
90 0.15
91 0.12
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.11
100 0.13
101 0.2
102 0.26
103 0.31
104 0.35
105 0.37
106 0.38
107 0.41
108 0.44
109 0.39
110 0.37
111 0.32
112 0.34
113 0.36
114 0.34
115 0.31
116 0.31
117 0.28
118 0.26
119 0.27
120 0.22
121 0.19
122 0.21
123 0.23
124 0.23
125 0.28
126 0.29
127 0.3
128 0.32
129 0.32
130 0.31
131 0.28
132 0.26
133 0.24
134 0.25
135 0.25
136 0.23
137 0.25
138 0.24
139 0.23
140 0.23
141 0.22
142 0.22
143 0.23
144 0.21
145 0.21
146 0.2
147 0.19
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.14
155 0.15
156 0.18
157 0.19
158 0.21
159 0.22
160 0.26
161 0.29
162 0.31
163 0.34
164 0.37
165 0.36
166 0.37
167 0.43
168 0.45
169 0.45
170 0.47
171 0.49
172 0.54
173 0.56
174 0.58
175 0.57
176 0.52
177 0.48
178 0.44
179 0.39
180 0.33
181 0.34
182 0.32
183 0.28
184 0.29
185 0.28
186 0.27
187 0.29
188 0.32
189 0.31
190 0.33
191 0.35
192 0.38
193 0.43
194 0.45
195 0.43
196 0.38
197 0.34
198 0.29
199 0.27
200 0.27
201 0.26
202 0.25
203 0.27
204 0.29
205 0.31
206 0.32
207 0.29
208 0.27
209 0.25
210 0.32
211 0.35
212 0.37
213 0.42
214 0.5
215 0.52
216 0.57
217 0.62
218 0.62
219 0.63
220 0.67
221 0.65
222 0.66
223 0.7
224 0.66
225 0.63
226 0.56
227 0.51
228 0.46
229 0.4
230 0.35
231 0.26
232 0.26
233 0.24
234 0.22
235 0.25
236 0.28
237 0.33
238 0.37
239 0.4
240 0.42
241 0.49
242 0.51
243 0.5
244 0.45
245 0.41
246 0.39
247 0.38
248 0.35
249 0.27
250 0.26
251 0.21
252 0.2
253 0.19
254 0.16
255 0.15
256 0.14
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.1
300 0.14
301 0.17
302 0.19
303 0.21
304 0.29
305 0.39
306 0.49
307 0.55
308 0.61
309 0.67
310 0.74
311 0.73
312 0.7
313 0.67
314 0.63
315 0.56
316 0.53
317 0.49
318 0.43
319 0.42
320 0.39
321 0.33
322 0.31
323 0.37
324 0.37
325 0.34
326 0.35
327 0.38
328 0.4
329 0.42
330 0.4
331 0.4
332 0.45
333 0.51
334 0.54
335 0.59
336 0.56
337 0.53
338 0.5
339 0.45
340 0.41
341 0.39
342 0.38
343 0.34
344 0.43
345 0.43
346 0.43
347 0.47
348 0.42
349 0.45
350 0.44
351 0.49
352 0.48
353 0.59
354 0.7
355 0.72
356 0.79
357 0.81
358 0.81
359 0.8
360 0.77
361 0.74
362 0.73
363 0.7
364 0.7
365 0.67
366 0.71
367 0.69
368 0.68
369 0.67
370 0.68
371 0.69
372 0.7
373 0.74
374 0.74
375 0.8
376 0.84
377 0.84
378 0.83
379 0.83
380 0.81
381 0.77
382 0.73
383 0.73
384 0.69
385 0.69
386 0.68
387 0.6
388 0.54
389 0.5
390 0.48
391 0.41
392 0.44
393 0.38
394 0.36
395 0.4
396 0.41
397 0.4
398 0.39
399 0.39
400 0.36
401 0.44
402 0.47
403 0.43
404 0.43
405 0.44
406 0.49
407 0.5
408 0.5
409 0.43
410 0.42
411 0.41
412 0.41
413 0.39
414 0.34
415 0.35
416 0.37
417 0.45
418 0.47
419 0.56
420 0.64
421 0.71
422 0.72
423 0.76
424 0.8
425 0.81
426 0.81
427 0.8
428 0.78
429 0.79