Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J7JSP8

Protein Details
Accession A0A1J7JSP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-241AGAGGKAKRERERKQKQFVELEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-100PRGGRGARVRGGRGARRPPPGD
224-235GKAKRERERKQK
247-306APREGGERRGGRGGARGEFSGRGRGEGGRGRGEGRGRGGPRGGARGDFRGDFRGGRGGAR
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 12, nucl 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLYDLLGNDIEDPDAAPKAPTKIVEKATTHTVKRNADGVAPAKAAGADAGFRDRQSGNASNNTRARNDADQAPRGGRGARVRGGRGARRPPPGDERHSRNVPSGGSDKQAALSWGATEGEAELKDEIVGEQIAKADQKEAVTEDATAPEELPVEEEDKSISYADYLVQQAEKKLALEQENALKVRKANEGSKADKKWANAKELVKSEEEEVLFAGAGGKAKRERERKQKQFVELENRFIEAPREGGERRGGRGGARGEFSGRGRGEGGRGRGEGRGRGGPRGGARGDFRGDFRGGRGGARAGGAAPVNPNDQSAFPSLGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.13
11 0.16
12 0.19
13 0.22
14 0.25
15 0.31
16 0.37
17 0.43
18 0.42
19 0.42
20 0.49
21 0.52
22 0.5
23 0.5
24 0.52
25 0.49
26 0.49
27 0.49
28 0.41
29 0.36
30 0.39
31 0.34
32 0.3
33 0.27
34 0.24
35 0.2
36 0.19
37 0.17
38 0.11
39 0.09
40 0.06
41 0.07
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.15
46 0.15
47 0.17
48 0.22
49 0.27
50 0.28
51 0.36
52 0.39
53 0.43
54 0.49
55 0.49
56 0.44
57 0.4
58 0.41
59 0.35
60 0.36
61 0.37
62 0.37
63 0.38
64 0.39
65 0.38
66 0.34
67 0.31
68 0.28
69 0.25
70 0.25
71 0.26
72 0.29
73 0.31
74 0.32
75 0.37
76 0.43
77 0.45
78 0.47
79 0.51
80 0.52
81 0.56
82 0.57
83 0.56
84 0.58
85 0.58
86 0.58
87 0.57
88 0.58
89 0.59
90 0.61
91 0.57
92 0.51
93 0.47
94 0.39
95 0.35
96 0.31
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.14
104 0.11
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.18
172 0.21
173 0.21
174 0.2
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.23
179 0.22
180 0.22
181 0.29
182 0.34
183 0.39
184 0.46
185 0.44
186 0.44
187 0.43
188 0.42
189 0.43
190 0.41
191 0.4
192 0.39
193 0.41
194 0.42
195 0.43
196 0.43
197 0.35
198 0.32
199 0.28
200 0.25
201 0.22
202 0.16
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.05
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.13
213 0.19
214 0.28
215 0.36
216 0.45
217 0.54
218 0.66
219 0.73
220 0.8
221 0.81
222 0.8
223 0.79
224 0.77
225 0.76
226 0.67
227 0.63
228 0.53
229 0.47
230 0.4
231 0.32
232 0.27
233 0.17
234 0.16
235 0.12
236 0.16
237 0.15
238 0.18
239 0.25
240 0.25
241 0.27
242 0.29
243 0.28
244 0.25
245 0.31
246 0.32
247 0.27
248 0.27
249 0.25
250 0.23
251 0.26
252 0.27
253 0.28
254 0.24
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.26
259 0.28
260 0.31
261 0.27
262 0.28
263 0.28
264 0.31
265 0.33
266 0.31
267 0.3
268 0.34
269 0.32
270 0.35
271 0.35
272 0.35
273 0.35
274 0.37
275 0.34
276 0.3
277 0.32
278 0.32
279 0.34
280 0.31
281 0.3
282 0.29
283 0.3
284 0.26
285 0.25
286 0.28
287 0.25
288 0.24
289 0.25
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.2
294 0.13
295 0.15
296 0.15
297 0.13
298 0.15
299 0.16
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.17
305 0.19
306 0.2