FuNGI

A0A1J7J8T6

Protein Details

Accession

A0A1J7J8T6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
55-78	ASSSRAKFKPKANRRTEEERQRIA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
59-72	RAKFKPKANRRTEE
83-113	KIQNKKAADDARRARGRGRGRGRGRGRGGFR
317-320	KKIR

Subcellular Location(s)

mito 18, cyto_nucl 5, nucl 4, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSAPRRGTRRAGAAAGSESIAPQPSGTPAQISTSLDTTARVTRAPSTSTRGAAAASSSRAKFKPKANRRTEEERQRIADEQLKIQNKKAADDARRARGRGRGRGRGRGRGGFREFEAGRGGGMFGPAGSASRGGGFGGGGGGGVLGGGGFGSRSGGPSGTGSAYNFADGRVEDDRINADELRGNQHDRDDEDTYTSTGAKVTTTKKKRAILPIGIKREEVQEGGVELTTAEDIAAGEKAAEADADGSDSESMWVDDHDSKIVPGLKKDDEVWGHVAPKPREKIMVKNEQGELVEAAIDEIVAAKEAKEEEEKKELLKKIRKGPTKDTEDEHIAEDMARLAHLLTIGDRQDQTPDAEGKPPANPLEGALFLFQLPPVLPRLQITRQPKPRDAKDGKVDLVKDEPTDDVVMLDQPASNIDLTGTSETPDRGVKAEDGFEIDDEPPKDGKDLPYPPEGGYVGKLVVRRSGKVELDWGGQTLEMAPGIESNFLTTAVVVEETNPMARAGEAAGVAYSMGKIHGKFILAPKWGDEEEWIVDPSELEVDEEML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.35
3	0.29
4	0.21
5	0.16
6	0.15
7	0.15
8	0.12
9	0.1
10	0.1
11	0.13
12	0.16
13	0.17
14	0.17
15	0.17
16	0.2
17	0.23
18	0.24
19	0.23
20	0.21
21	0.22
22	0.2
23	0.21
24	0.2
25	0.21
26	0.2
27	0.19
28	0.19
29	0.23
30	0.26
31	0.29
32	0.3
33	0.33
34	0.36
35	0.36
36	0.36
37	0.31
38	0.28
39	0.24
40	0.23
41	0.19
42	0.18
43	0.22
44	0.22
45	0.27
46	0.29
47	0.35
48	0.39
49	0.46
50	0.54
51	0.59
52	0.68
53	0.73
54	0.79
55	0.8
56	0.84
57	0.85
58	0.84
59	0.83
60	0.78
61	0.72
62	0.66
63	0.61
64	0.56
65	0.52
66	0.44
67	0.41
68	0.43
69	0.48
70	0.47
71	0.48
72	0.47
73	0.41
74	0.41
75	0.42
76	0.42
77	0.39
78	0.47
79	0.51
80	0.57
81	0.61
82	0.6
83	0.56
84	0.56
85	0.59
86	0.59
87	0.61
88	0.62
89	0.63
90	0.73
91	0.76
92	0.77
93	0.74
94	0.72
95	0.68
96	0.67
97	0.64
98	0.56
99	0.51
100	0.49
101	0.43
102	0.36
103	0.34
104	0.24
105	0.2
106	0.18
107	0.17
108	0.09
109	0.1
110	0.08
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.06
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.06
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.04
126	0.03
127	0.03
128	0.03
129	0.02
130	0.02
131	0.02
132	0.02
133	0.02
134	0.02
135	0.02
136	0.02
137	0.02
138	0.04
139	0.04
140	0.05
141	0.06
142	0.07
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.11
148	0.1
149	0.12
150	0.12
151	0.12
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.09
156	0.12
157	0.11
158	0.13
159	0.12
160	0.13
161	0.14
162	0.14
163	0.16
164	0.13
165	0.12
166	0.13
167	0.14
168	0.19
169	0.2
170	0.2
171	0.19
172	0.21
173	0.22
174	0.21
175	0.25
176	0.22
177	0.2
178	0.21
179	0.21
180	0.19
181	0.18
182	0.16
183	0.11
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.11
188	0.18
189	0.28
190	0.34
191	0.41
192	0.47
193	0.53
194	0.58
195	0.63
196	0.63
197	0.62
198	0.66
199	0.67
200	0.66
201	0.62
202	0.56
203	0.47
204	0.42
205	0.34
206	0.24
207	0.16
208	0.1
209	0.09
210	0.1
211	0.09
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.06
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.11
248	0.15
249	0.13
250	0.13
251	0.17
252	0.17
253	0.18
254	0.19
255	0.2
256	0.17
257	0.18
258	0.2
259	0.17
260	0.18
261	0.19
262	0.25
263	0.22
264	0.27
265	0.27
266	0.24
267	0.3
268	0.3
269	0.36
270	0.38
271	0.47
272	0.43
273	0.44
274	0.44
275	0.39
276	0.37
277	0.29
278	0.21
279	0.11
280	0.09
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.03
285	0.02
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.04
292	0.05
293	0.06
294	0.11
295	0.13
296	0.16
297	0.2
298	0.21
299	0.21
300	0.28
301	0.31
302	0.35
303	0.41
304	0.45
305	0.5
306	0.58
307	0.65
308	0.64
309	0.68
310	0.69
311	0.69
312	0.65
313	0.58
314	0.53
315	0.48
316	0.44
317	0.36
318	0.26
319	0.19
320	0.16
321	0.13
322	0.1
323	0.07
324	0.06
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.08
332	0.09
333	0.1
334	0.11
335	0.11
336	0.12
337	0.13
338	0.14
339	0.14
340	0.16
341	0.16
342	0.18
343	0.19
344	0.19
345	0.19
346	0.2
347	0.18
348	0.16
349	0.15
350	0.13
351	0.14
352	0.13
353	0.12
354	0.1
355	0.1
356	0.08
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.09
363	0.09
364	0.1
365	0.11
366	0.17
367	0.2
368	0.28
369	0.35
370	0.42
371	0.5
372	0.57
373	0.63
374	0.66
375	0.67
376	0.7
377	0.68
378	0.66
379	0.65
380	0.64
381	0.58
382	0.54
383	0.49
384	0.4
385	0.38
386	0.31
387	0.23
388	0.19
389	0.17
390	0.14
391	0.14
392	0.12
393	0.09
394	0.08
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.08
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.11
411	0.11
412	0.13
413	0.14
414	0.13
415	0.12
416	0.14
417	0.15
418	0.16
419	0.17
420	0.16
421	0.16
422	0.16
423	0.15
424	0.15
425	0.14
426	0.17
427	0.16
428	0.18
429	0.16
430	0.16
431	0.18
432	0.18
433	0.22
434	0.26
435	0.31
436	0.32
437	0.36
438	0.37
439	0.36
440	0.37
441	0.34
442	0.26
443	0.21
444	0.19
445	0.15
446	0.16
447	0.17
448	0.15
449	0.22
450	0.23
451	0.24
452	0.27
453	0.33
454	0.33
455	0.32
456	0.35
457	0.3
458	0.31
459	0.3
460	0.26
461	0.19
462	0.17
463	0.16
464	0.12
465	0.1
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.07
470	0.08
471	0.09
472	0.08
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.07
482	0.08
483	0.09
484	0.1
485	0.11
486	0.11
487	0.11
488	0.1
489	0.1
490	0.1
491	0.09
492	0.1
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.08
498	0.07
499	0.06
500	0.05
501	0.07
502	0.1
503	0.11
504	0.13
505	0.16
506	0.17
507	0.21
508	0.28
509	0.34
510	0.34
511	0.34
512	0.34
513	0.37
514	0.36
515	0.32
516	0.27
517	0.23
518	0.22
519	0.24
520	0.22
521	0.18
522	0.18
523	0.17
524	0.16
525	0.14
526	0.11
527	0.1

A0A1J7J8T6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer