FuNGI

A0A1L0DDM8

Protein Details

Accession

A0A1L0DDM8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
202-223	TCKTYISKAKTSRRLIRRTLNH	Hydrophilic
512-533	AAEKRFLTRKSKNSNRLRKLLR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
520-535	RKSKNSNRLRKLLRSR

Subcellular Location(s)

mito 16.5, cyto_mito 11, nucl 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MKPAQKYLLHTLCKRYHSTKLGTRHLAISAISRSSSTSEPFSLQNDMKIYASLVDELRKPQKDSKSQVSLSGKAFNEIKPIGDKIAESDRREVSWSSNYDPVTRSPFAKDVVHLLSLLDALLSSKNFARAENILVAIHPLLDQPEGFVSFMNKYLEAYAMEESSTIEELESFLAKMQKEFRAYPNDRTYAIMIAKSIDDKDTCKTYISKAKTSRRLIRRTLNHLDILTVEDLTRLFEEPSLEECHIPTDLIPLFQDVRTGQNPEVSEEEVPEYFKVDGKEAPMIEKDAAELRAVDSFGLKVIRHTLLGLESKTEIDLDKLFNDLDEDLKQHILHNSRSNKKRNYHEIYKTLKTPEDKRKFDEALDVFNESRQRELESKGIDAAREKWKHEFEDLQLRGGLPINKNLNVQLYQWYLDMLPFVQEEVDLCRKLLSNEIMLSSLSGDEKKQMKDRSFYAPYLVLIPPKKLTVITILELLKLNSTGGIVDGMRTARAVISVGKAIELEYKSQSLVAAEKRFLTRKSKNSNRLRKLLRSRKPTVEDALNTEWDYPVYAKLGSVLTSLLLHVAKVQVTGTDPSTGKAVKGKQPAFHHTYQFVNGQRLGIIRLHKNLVRQLASNTLINSVQPQFLPMLLPPTDWSSHNNGGYKFTPSTLVRIKDSAETVAYVKAAAEANNLDDVYAGLNVLGRTPWTVNAKVLEVVSQCWNTGEAFLDIPPIVDEPELPAPLPFNAEPLEKVEYQKKVRHILNEAAAFRSQRCDTNYKLEIARAFVGEKMYFPHNVDFRGRAYPLAPHLNHLGNDLTRSLFLFWEGRELGERGLEWLKIHLANVYGMDKAPLKQRAEFVEANLENVFDSARDPLGGNRWWTKGDKPWQILGVCFELAEAYKLTDPTKYVSHCPVHQDGTCNGLQHYAALGGDVEGAKQVNLVPADRPQDVYKFVAGLVEKRLESEAEAGNKYAIFLKNKISRKVVKQTVMTNVYGVTFVGAVAQIEKQLTHLFEKDDFDSVTLYARYLTSLVFASMRELFEGAHLIQDWLGESAKRISKSVRIDYEEKSAKNANKPSHLSSVIWTTPLGLPCVQPYRATKRQIVSTNLQDITISDPFGATQVDSRKQLTAFPPNFIHSLDATHMLMTAAACGEQGLHFASVHDSYWTHAANVDVMSANIRDQFVRLHEENLIVKLRDEFERRYKGFLQVMSIPGDHEVALKIKAVRRKIVKDLGRALTVADEIYIEKKRQELLESPDAREVQMGKEMVSTVSVTEGYDLNEIAVSASSSKALQILAPLTFPEIPTRGSLDVGVVKESPYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.61
3	0.62
4	0.62
5	0.66
6	0.65
7	0.68
8	0.72
9	0.7
10	0.67
11	0.6
12	0.54
13	0.46
14	0.39
15	0.34
16	0.28
17	0.24
18	0.22
19	0.2
20	0.2
21	0.21
22	0.23
23	0.21
24	0.22
25	0.23
26	0.24
27	0.26
28	0.28
29	0.31
30	0.29
31	0.31
32	0.29
33	0.29
34	0.27
35	0.25
36	0.23
37	0.18
38	0.18
39	0.17
40	0.16
41	0.18
42	0.2
43	0.27
44	0.35
45	0.37
46	0.41
47	0.47
48	0.55
49	0.61
50	0.67
51	0.69
52	0.7
53	0.67
54	0.71
55	0.69
56	0.65
57	0.58
58	0.57
59	0.48
60	0.43
61	0.44
62	0.35
63	0.36
64	0.31
65	0.31
66	0.27
67	0.28
68	0.26
69	0.24
70	0.23
71	0.21
72	0.31
73	0.35
74	0.34
75	0.39
76	0.39
77	0.39
78	0.41
79	0.38
80	0.33
81	0.34
82	0.35
83	0.33
84	0.36
85	0.36
86	0.36
87	0.37
88	0.36
89	0.35
90	0.34
91	0.32
92	0.32
93	0.34
94	0.35
95	0.35
96	0.32
97	0.3
98	0.31
99	0.3
100	0.25
101	0.22
102	0.19
103	0.16
104	0.14
105	0.08
106	0.05
107	0.05
108	0.08
109	0.08
110	0.09
111	0.11
112	0.17
113	0.17
114	0.18
115	0.22
116	0.21
117	0.25
118	0.26
119	0.26
120	0.2
121	0.2
122	0.2
123	0.16
124	0.14
125	0.1
126	0.08
127	0.08
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.11
132	0.12
133	0.12
134	0.12
135	0.13
136	0.13
137	0.17
138	0.17
139	0.15
140	0.15
141	0.16
142	0.17
143	0.15
144	0.16
145	0.14
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.09
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.08
159	0.1
160	0.13
161	0.14
162	0.17
163	0.22
164	0.26
165	0.3
166	0.33
167	0.37
168	0.44
169	0.48
170	0.54
171	0.57
172	0.54
173	0.5
174	0.49
175	0.45
176	0.39
177	0.36
178	0.28
179	0.2
180	0.19
181	0.18
182	0.18
183	0.17
184	0.15
185	0.14
186	0.16
187	0.2
188	0.23
189	0.23
190	0.24
191	0.25
192	0.3
193	0.38
194	0.42
195	0.47
196	0.52
197	0.61
198	0.68
199	0.76
200	0.79
201	0.79
202	0.81
203	0.8
204	0.81
205	0.79
206	0.78
207	0.78
208	0.72
209	0.65
210	0.56
211	0.49
212	0.39
213	0.33
214	0.25
215	0.17
216	0.12
217	0.1
218	0.1
219	0.11
220	0.11
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.11
225	0.12
226	0.15
227	0.18
228	0.18
229	0.18
230	0.17
231	0.18
232	0.17
233	0.15
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.14
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.18
243	0.13
244	0.18
245	0.19
246	0.23
247	0.21
248	0.24
249	0.24
250	0.25
251	0.26
252	0.22
253	0.2
254	0.18
255	0.19
256	0.15
257	0.16
258	0.13
259	0.13
260	0.12
261	0.14
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.17
266	0.21
267	0.19
268	0.21
269	0.2
270	0.21
271	0.19
272	0.17
273	0.16
274	0.15
275	0.15
276	0.13
277	0.12
278	0.11
279	0.12
280	0.12
281	0.11
282	0.09
283	0.08
284	0.09
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.14
289	0.15
290	0.15
291	0.15
292	0.14
293	0.16
294	0.19
295	0.18
296	0.16
297	0.15
298	0.15
299	0.15
300	0.15
301	0.11
302	0.09
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.11
315	0.13
316	0.13
317	0.14
318	0.19
319	0.21
320	0.25
321	0.32
322	0.4
323	0.49
324	0.57
325	0.64
326	0.68
327	0.71
328	0.76
329	0.78
330	0.78
331	0.78
332	0.77
333	0.77
334	0.76
335	0.72
336	0.66
337	0.59
338	0.54
339	0.5
340	0.51
341	0.53
342	0.56
343	0.56
344	0.58
345	0.62
346	0.59
347	0.54
348	0.54
349	0.43
350	0.38
351	0.36
352	0.33
353	0.25
354	0.26
355	0.29
356	0.2
357	0.21
358	0.16
359	0.19
360	0.19
361	0.22
362	0.25
363	0.23
364	0.23
365	0.25
366	0.25
367	0.22
368	0.22
369	0.24
370	0.29
371	0.3
372	0.31
373	0.33
374	0.36
375	0.38
376	0.39
377	0.37
378	0.32
379	0.4
380	0.39
381	0.34
382	0.31
383	0.29
384	0.26
385	0.26
386	0.26
387	0.16
388	0.22
389	0.24
390	0.25
391	0.25
392	0.26
393	0.26
394	0.23
395	0.22
396	0.2
397	0.18
398	0.18
399	0.17
400	0.16
401	0.13
402	0.12
403	0.12
404	0.08
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.1
412	0.14
413	0.13
414	0.14
415	0.15
416	0.15
417	0.16
418	0.2
419	0.17
420	0.15
421	0.16
422	0.17
423	0.16
424	0.15
425	0.15
426	0.1
427	0.09
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.12
432	0.17
433	0.2
434	0.27
435	0.32
436	0.35
437	0.38
438	0.41
439	0.44
440	0.44
441	0.41
442	0.36
443	0.31
444	0.28
445	0.28
446	0.25
447	0.21
448	0.18
449	0.2
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.14
454	0.15
455	0.15
456	0.16
457	0.15
458	0.19
459	0.18
460	0.19
461	0.19
462	0.18
463	0.13
464	0.11
465	0.1
466	0.06
467	0.06
468	0.05
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.13
493	0.12
494	0.13
495	0.12
496	0.09
497	0.12
498	0.15
499	0.16
500	0.16
501	0.18
502	0.2
503	0.23
504	0.25
505	0.31
506	0.34
507	0.41
508	0.51
509	0.59
510	0.67
511	0.75
512	0.83
513	0.8
514	0.82
515	0.78
516	0.77
517	0.78
518	0.78
519	0.76
520	0.74
521	0.73
522	0.72
523	0.71
524	0.64
525	0.57
526	0.51
527	0.43
528	0.4
529	0.36
530	0.29
531	0.25
532	0.22
533	0.18
534	0.13
535	0.13
536	0.08
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.07
545	0.07
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.05
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.05
558	0.07
559	0.08
560	0.08
561	0.11
562	0.11
563	0.11
564	0.13
565	0.13
566	0.12
567	0.15
568	0.18
569	0.21
570	0.3
571	0.31
572	0.35
573	0.4
574	0.45
575	0.47
576	0.46
577	0.42
578	0.35
579	0.34
580	0.31
581	0.31
582	0.27
583	0.23
584	0.2
585	0.18
586	0.17
587	0.16
588	0.15
589	0.14
590	0.15
591	0.15
592	0.17
593	0.19
594	0.19
595	0.22
596	0.23
597	0.25
598	0.23
599	0.21
600	0.21
601	0.23
602	0.23
603	0.21
604	0.18
605	0.15
606	0.14
607	0.13
608	0.14
609	0.11
610	0.1
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.08
615	0.09
616	0.07
617	0.09
618	0.08
619	0.09
620	0.09
621	0.11
622	0.12
623	0.12
624	0.15
625	0.17
626	0.2
627	0.23
628	0.25
629	0.23
630	0.25
631	0.25
632	0.25
633	0.2
634	0.17
635	0.19
636	0.16
637	0.21
638	0.22
639	0.23
640	0.21
641	0.21
642	0.22
643	0.19
644	0.19
645	0.15
646	0.11
647	0.1
648	0.1
649	0.09
650	0.08
651	0.07
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.06
656	0.07
657	0.06
658	0.07
659	0.08
660	0.08
661	0.06
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.04
667	0.03
668	0.04
669	0.04
670	0.05
671	0.04
672	0.04
673	0.05
674	0.06
675	0.09
676	0.12
677	0.13
678	0.14
679	0.15
680	0.15
681	0.15
682	0.15
683	0.13
684	0.1
685	0.11
686	0.12
687	0.11
688	0.11
689	0.1
690	0.11
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.06
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.06
706	0.08
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.08
711	0.08
712	0.11
713	0.08
714	0.08
715	0.09
716	0.1
717	0.1
718	0.12
719	0.15
720	0.13
721	0.16
722	0.19
723	0.24
724	0.28
725	0.32
726	0.35
727	0.39
728	0.4
729	0.42
730	0.41
731	0.39
732	0.4
733	0.4
734	0.36
735	0.3
736	0.28
737	0.25
738	0.21
739	0.21
740	0.17
741	0.16
742	0.19
743	0.21
744	0.23
745	0.3
746	0.32
747	0.31
748	0.3
749	0.29
750	0.25
751	0.24
752	0.22
753	0.15
754	0.13
755	0.12
756	0.13
757	0.11
758	0.1
759	0.11
760	0.12
761	0.12
762	0.13
763	0.16
764	0.16
765	0.18
766	0.2
767	0.19
768	0.2
769	0.21
770	0.2
771	0.17
772	0.16
773	0.16
774	0.19
775	0.24
776	0.23
777	0.21
778	0.24
779	0.25
780	0.25
781	0.24
782	0.21
783	0.14
784	0.15
785	0.14
786	0.11
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.07
791	0.08
792	0.09
793	0.08
794	0.12
795	0.12
796	0.11
797	0.12
798	0.13
799	0.12
800	0.11
801	0.11
802	0.09
803	0.11
804	0.11
805	0.09
806	0.1
807	0.11
808	0.11
809	0.11
810	0.1
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.11
815	0.09
816	0.09
817	0.1
818	0.1
819	0.11
820	0.17
821	0.22
822	0.23
823	0.24
824	0.28
825	0.3
826	0.35
827	0.34
828	0.28
829	0.31
830	0.29
831	0.28
832	0.25
833	0.21
834	0.15
835	0.15
836	0.14
837	0.05
838	0.06
839	0.05
840	0.05
841	0.06
842	0.06
843	0.08
844	0.13
845	0.15
846	0.17
847	0.2
848	0.21
849	0.23
850	0.25
851	0.27
852	0.31
853	0.38
854	0.42
855	0.42
856	0.43
857	0.45
858	0.43
859	0.4
860	0.34
861	0.27
862	0.19
863	0.16
864	0.13
865	0.09
866	0.09
867	0.09
868	0.07
869	0.06
870	0.07
871	0.09
872	0.09
873	0.1
874	0.11
875	0.13
876	0.17
877	0.18
878	0.2
879	0.26
880	0.29
881	0.3
882	0.35
883	0.36
884	0.35
885	0.34
886	0.34
887	0.28
888	0.29
889	0.28
890	0.23
891	0.2
892	0.18
893	0.16
894	0.12
895	0.12
896	0.08
897	0.07
898	0.06
899	0.06
900	0.05
901	0.06
902	0.06
903	0.05
904	0.05
905	0.05
906	0.05
907	0.06
908	0.06
909	0.08
910	0.09
911	0.1
912	0.11
913	0.15
914	0.19
915	0.19
916	0.21
917	0.19
918	0.21
919	0.23
920	0.23
921	0.19
922	0.16
923	0.15
924	0.16
925	0.15
926	0.15
927	0.15
928	0.16
929	0.16
930	0.16
931	0.17
932	0.14
933	0.15
934	0.16
935	0.16
936	0.17
937	0.18
938	0.17
939	0.17
940	0.17
941	0.16
942	0.18
943	0.18
944	0.18
945	0.19
946	0.27
947	0.36
948	0.42
949	0.46
950	0.48
951	0.51
952	0.56
953	0.64
954	0.63
955	0.6
956	0.58
957	0.58
958	0.59
959	0.56
960	0.48
961	0.38
962	0.31
963	0.25
964	0.21
965	0.17
966	0.09
967	0.05
968	0.05
969	0.05
970	0.05
971	0.04
972	0.05
973	0.06
974	0.06
975	0.07
976	0.07
977	0.08
978	0.1
979	0.12
980	0.14
981	0.15
982	0.16
983	0.19
984	0.22
985	0.21
986	0.21
987	0.2
988	0.17
989	0.16
990	0.14
991	0.15
992	0.12
993	0.11
994	0.1
995	0.09
996	0.1
997	0.09
998	0.09
999	0.08
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.09
1003	0.09
1004	0.11
1005	0.12
1006	0.12
1007	0.11
1008	0.11
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.13
1012	0.1
1013	0.09
1014	0.09
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.09
1019	0.08
1020	0.09
1021	0.07
1022	0.09
1023	0.15
1024	0.19
1025	0.2
1026	0.21
1027	0.23
1028	0.29
1029	0.37
1030	0.43
1031	0.44
1032	0.45
1033	0.48
1034	0.49
1035	0.55
1036	0.54
1037	0.47
1038	0.43
1039	0.43
1040	0.42
1041	0.46
1042	0.51
1043	0.47
1044	0.5
1045	0.54
1046	0.55
1047	0.54
1048	0.52
1049	0.44
1050	0.39
1051	0.4
1052	0.33
1053	0.29
1054	0.24
1055	0.2
1056	0.21
1057	0.22
1058	0.22
1059	0.16
1060	0.16
1061	0.2
1062	0.25
1063	0.24
1064	0.24
1065	0.3
1066	0.37
1067	0.44
1068	0.49
1069	0.5
1070	0.5
1071	0.57
1072	0.59
1073	0.59
1074	0.56
1075	0.54
1076	0.56
1077	0.5
1078	0.45
1079	0.37
1080	0.31
1081	0.3
1082	0.25
1083	0.19
1084	0.12
1085	0.11
1086	0.11
1087	0.12
1088	0.12
1089	0.07
1090	0.11
1091	0.17
1092	0.22
1093	0.24
1094	0.26
1095	0.28
1096	0.28
1097	0.33
1098	0.35
1099	0.39
1100	0.36
1101	0.39
1102	0.39
1103	0.39
1104	0.4
1105	0.35
1106	0.31
1107	0.21
1108	0.21
1109	0.18
1110	0.19
1111	0.16
1112	0.15
1113	0.15
1114	0.12
1115	0.12
1116	0.1
1117	0.09
1118	0.06
1119	0.06
1120	0.06
1121	0.05
1122	0.06
1123	0.05
1124	0.07
1125	0.07
1126	0.08
1127	0.08
1128	0.09
1129	0.12
1130	0.12
1131	0.13
1132	0.13
1133	0.12
1134	0.12
1135	0.17
1136	0.17
1137	0.14
1138	0.15
1139	0.15
1140	0.15
1141	0.15
1142	0.15
1143	0.11
1144	0.1
1145	0.12
1146	0.11
1147	0.11
1148	0.12
1149	0.13
1150	0.11
1151	0.12
1152	0.15
1153	0.16
1154	0.24
1155	0.24
1156	0.24
1157	0.25
1158	0.28
1159	0.29
1160	0.3
1161	0.31
1162	0.24
1163	0.23
1164	0.24
1165	0.25
1166	0.28
1167	0.31
1168	0.33
1169	0.39
1170	0.48
1171	0.49
1172	0.52
1173	0.52
1174	0.53
1175	0.53
1176	0.48
1177	0.44
1178	0.38
1179	0.39
1180	0.36
1181	0.33
1182	0.26
1183	0.22
1184	0.21
1185	0.16
1186	0.13
1187	0.12
1188	0.12
1189	0.13
1190	0.15
1191	0.19
1192	0.23
1193	0.3
1194	0.34
1195	0.41
1196	0.48
1197	0.54
1198	0.6
1199	0.65
1200	0.67
1201	0.69
1202	0.72
1203	0.67
1204	0.6
1205	0.53
1206	0.45
1207	0.36
1208	0.3
1209	0.21
1210	0.13
1211	0.09
1212	0.09
1213	0.14
1214	0.17
1215	0.17
1216	0.18
1217	0.21
1218	0.24
1219	0.26
1220	0.3
1221	0.32
1222	0.37
1223	0.46
1224	0.48
1225	0.48
1226	0.5
1227	0.48
1228	0.42
1229	0.39
1230	0.32
1231	0.24
1232	0.27
1233	0.25
1234	0.19
1235	0.2
1236	0.21
1237	0.18
1238	0.18
1239	0.16
1240	0.1
1241	0.11
1242	0.11
1243	0.09
1244	0.1
1245	0.11
1246	0.11
1247	0.12
1248	0.12
1249	0.1
1250	0.1
1251	0.1
1252	0.09
1253	0.09
1254	0.08
1255	0.07
1256	0.08
1257	0.09
1258	0.09
1259	0.09
1260	0.1
1261	0.1
1262	0.1
1263	0.13
1264	0.15
1265	0.15
1266	0.15
1267	0.15
1268	0.17
1269	0.18
1270	0.18
1271	0.2
1272	0.19
1273	0.19
1274	0.21
1275	0.24
1276	0.22
1277	0.22
1278	0.21
1279	0.2
1280	0.23
1281	0.22
1282	0.23
1283	0.19
1284	0.19
1285	0.21

A0A1L0DDM8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer