FuNGI

A0A1L0DXA2

Protein Details

Accession

A0A1L0DXA2

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
73-92	VKNFTKPVRLHRKDPQNIQF	Hydrophilic
135-166	APDGGARRHRRNLFKRKTKQVHMMDEKKRKLR	Basic
470-492	QTFDTPSPKKTKRDEKSPSASPP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
140-155	ARRHRRNLFKRKTKQV
161-163	KKR
369-375	KEGKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQPSVKKDPGIKPEPETGSPATSASPQMSPTPKSSAGGEWNVIPLKACSREELKDTRNHIMRFQTKQDVDIVKNFTKPVRLHRKDPQNIQFHLSREEMDKRRKEGGGISQTVTEPTYVDEEGNIIQPADMSQVAPDGGARRHRRNLFKRKTKQVHMMDEKKRKLRYEEYYPWVIEDYDGKNVYVGSYEAGLSESTHVLFVFDKDGFKMVPAEKVYKFTPRNRYATLTLEEAEAKMEKNQSAPRWLMKHMDEEGGDARFRNSGYSAPVRPLELSQSSTGSRYRMRTVQGGSSSNGRDSDHDDLDFEEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSEKKIKKEMLKAATFEGQLDGDDSGDDLNDLFEVEKSRKVDKEGKKLKKVLNRTEGGVYDSDDNEQINPYVSQSDLESEEESESEFNVKTEPTDEVAGSDPLRPRSFFVSSAANGYIVIKAPKQFLRGFQPGEWNPQAKKRSQTFDTPSPKKTKRDEKSPSASPPPDNSAAGDLNNAGPNGELVTTWEVLDIVRNNPLTTKELLLKLKSRISTHKDNKLRIITIVKLNFRLVDGKLTLKEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.63
3	0.56
4	0.53
5	0.45
6	0.4
7	0.36
8	0.32
9	0.25
10	0.22
11	0.22
12	0.2
13	0.19
14	0.18
15	0.24
16	0.29
17	0.31
18	0.32
19	0.36
20	0.35
21	0.35
22	0.36
23	0.34
24	0.36
25	0.36
26	0.34
27	0.28
28	0.31
29	0.3
30	0.28
31	0.24
32	0.19
33	0.21
34	0.26
35	0.26
36	0.26
37	0.3
38	0.33
39	0.39
40	0.45
41	0.45
42	0.47
43	0.51
44	0.56
45	0.59
46	0.57
47	0.55
48	0.57
49	0.59
50	0.57
51	0.58
52	0.59
53	0.52
54	0.52
55	0.54
56	0.49
57	0.45
58	0.45
59	0.45
60	0.38
61	0.4
62	0.4
63	0.35
64	0.37
65	0.37
66	0.42
67	0.47
68	0.5
69	0.55
70	0.63
71	0.72
72	0.73
73	0.8
74	0.79
75	0.75
76	0.72
77	0.69
78	0.63
79	0.54
80	0.5
81	0.41
82	0.33
83	0.3
84	0.37
85	0.41
86	0.46
87	0.5
88	0.5
89	0.55
90	0.54
91	0.51
92	0.48
93	0.5
94	0.49
95	0.46
96	0.42
97	0.38
98	0.37
99	0.36
100	0.3
101	0.2
102	0.12
103	0.1
104	0.12
105	0.11
106	0.1
107	0.09
108	0.1
109	0.11
110	0.13
111	0.11
112	0.09
113	0.08
114	0.08
115	0.08
116	0.09
117	0.08
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.09
125	0.12
126	0.22
127	0.28
128	0.34
129	0.43
130	0.51
131	0.61
132	0.68
133	0.76
134	0.78
135	0.83
136	0.86
137	0.88
138	0.9
139	0.86
140	0.86
141	0.83
142	0.82
143	0.81
144	0.81
145	0.8
146	0.81
147	0.8
148	0.77
149	0.73
150	0.66
151	0.63
152	0.62
153	0.6
154	0.6
155	0.61
156	0.6
157	0.59
158	0.55
159	0.49
160	0.41
161	0.33
162	0.24
163	0.2
164	0.16
165	0.17
166	0.18
167	0.17
168	0.16
169	0.16
170	0.16
171	0.12
172	0.1
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.13
196	0.12
197	0.16
198	0.17
199	0.22
200	0.21
201	0.25
202	0.25
203	0.3
204	0.35
205	0.38
206	0.46
207	0.48
208	0.52
209	0.52
210	0.55
211	0.49
212	0.48
213	0.42
214	0.33
215	0.27
216	0.23
217	0.2
218	0.16
219	0.14
220	0.1
221	0.08
222	0.09
223	0.1
224	0.1
225	0.13
226	0.18
227	0.19
228	0.22
229	0.24
230	0.26
231	0.27
232	0.28
233	0.29
234	0.26
235	0.28
236	0.25
237	0.25
238	0.2
239	0.19
240	0.19
241	0.16
242	0.14
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.12
251	0.16
252	0.16
253	0.17
254	0.18
255	0.18
256	0.17
257	0.17
258	0.16
259	0.13
260	0.14
261	0.13
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.15
266	0.14
267	0.16
268	0.16
269	0.18
270	0.2
271	0.22
272	0.24
273	0.24
274	0.26
275	0.26
276	0.26
277	0.23
278	0.24
279	0.22
280	0.19
281	0.18
282	0.15
283	0.13
284	0.15
285	0.18
286	0.16
287	0.15
288	0.15
289	0.14
290	0.15
291	0.14
292	0.11
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.04
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.08
315	0.15
316	0.19
317	0.24
318	0.33
319	0.4
320	0.44
321	0.51
322	0.59
323	0.59
324	0.56
325	0.52
326	0.45
327	0.41
328	0.37
329	0.29
330	0.21
331	0.14
332	0.11
333	0.11
334	0.09
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.04
346	0.04
347	0.07
348	0.09
349	0.12
350	0.15
351	0.18
352	0.2
353	0.25
354	0.34
355	0.4
356	0.5
357	0.57
358	0.64
359	0.69
360	0.75
361	0.75
362	0.74
363	0.75
364	0.73
365	0.71
366	0.64
367	0.58
368	0.54
369	0.48
370	0.41
371	0.32
372	0.24
373	0.17
374	0.15
375	0.14
376	0.12
377	0.11
378	0.1
379	0.1
380	0.09
381	0.09
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.08
386	0.09
387	0.08
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.11
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.09
397	0.08
398	0.09
399	0.08
400	0.07
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.1
405	0.11
406	0.11
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.14
411	0.15
412	0.14
413	0.17
414	0.18
415	0.22
416	0.24
417	0.23
418	0.23
419	0.27
420	0.29
421	0.26
422	0.25
423	0.26
424	0.25
425	0.27
426	0.25
427	0.2
428	0.18
429	0.17
430	0.15
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.14
435	0.19
436	0.21
437	0.25
438	0.26
439	0.3
440	0.36
441	0.41
442	0.42
443	0.39
444	0.46
445	0.43
446	0.49
447	0.49
448	0.44
449	0.41
450	0.46
451	0.49
452	0.44
453	0.52
454	0.51
455	0.55
456	0.54
457	0.61
458	0.61
459	0.66
460	0.72
461	0.68
462	0.68
463	0.7
464	0.73
465	0.72
466	0.74
467	0.75
468	0.73
469	0.78
470	0.8
471	0.8
472	0.82
473	0.81
474	0.78
475	0.76
476	0.72
477	0.65
478	0.6
479	0.56
480	0.51
481	0.44
482	0.38
483	0.33
484	0.3
485	0.26
486	0.23
487	0.17
488	0.17
489	0.18
490	0.17
491	0.12
492	0.11
493	0.11
494	0.11
495	0.1
496	0.07
497	0.09
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.12
502	0.11
503	0.11
504	0.16
505	0.16
506	0.15
507	0.2
508	0.2
509	0.21
510	0.23
511	0.26
512	0.25
513	0.24
514	0.26
515	0.27
516	0.33
517	0.38
518	0.41
519	0.43
520	0.45
521	0.49
522	0.5
523	0.49
524	0.52
525	0.55
526	0.61
527	0.65
528	0.7
529	0.72
530	0.73
531	0.77
532	0.74
533	0.68
534	0.62
535	0.58
536	0.53
537	0.54
538	0.55
539	0.51
540	0.46
541	0.46
542	0.42
543	0.38
544	0.37
545	0.29
546	0.28
547	0.26
548	0.29

A0A1L0DXA2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer