Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L0C0I1

Protein Details
Accession A0A1L0C0I1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-29ISANKSGKQKVKSKQYHVVYDNHydrophilic
174-209AEERQKKLAKKQNNKVKEKKKKKKEKLNIEKSKEGKBasic
213-243ETTVTDPELKKKKKKRSKKKKTGGQTPDLHNBasic
266-324SHNAGSGSKSKKKNKSKKKAPEAKDNTEQINSPAEGLKKKKKNKPPKEKHDDQKQNGSEHydrophilic
339-389GAETNGQKKKVQKKKKPNKKDKDGGSRENVSTENGQKPKNIENPTKNREKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-212RQKKLAKKQNNKVKEKKKKKKEKLNIEKSKEGKQER
219-234PELKKKKKKRSKKKKT
273-289SKSKKKNKSKKKAPEAK
299-314AEGLKKKKKNKPPKEK
346-362KKKVQKKKKPNKKDKDG
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.499, cyto_nucl 11.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MAAVAPEISANKSGKQKVKSKQYHVVYDNPELKVVVRLLPPSLNQDQFLEQLIQKGIFSKENSPYTKFYYEPGSRNVKLFEEPVFSRAYFQFPSKQLANNYMNELNNLTFEESDTGDHFMCQTMKSIFGAVGQSLNSSESEDFSTIPLYTRYLQVREEKGPAVNLAEVQRELQAEERQKKLAKKQNNKVKEKKKKKKEKLNIEKSKEGKQERETTVTDPELKKKKKKRSKKKKTGGQTPDLHNEANGSVTADVGKDTGAVLGAEESHNAGSGSKSKKKNKSKKKAPEAKDNTEQINSPAEGLKKKKKNKPPKEKHDDQKQNGSETQQQQNGSVSMPANGAETNGQKKKVQKKKKPNKKDKDGGSRENVSTENGQKPKNIENPTKNREKSDAATPAEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.52
3 0.59
4 0.64
5 0.74
6 0.78
7 0.79
8 0.8
9 0.8
10 0.81
11 0.76
12 0.74
13 0.69
14 0.68
15 0.65
16 0.56
17 0.49
18 0.4
19 0.37
20 0.33
21 0.29
22 0.25
23 0.21
24 0.22
25 0.23
26 0.25
27 0.26
28 0.29
29 0.33
30 0.3
31 0.29
32 0.3
33 0.29
34 0.28
35 0.29
36 0.25
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.19
41 0.17
42 0.2
43 0.2
44 0.21
45 0.24
46 0.27
47 0.33
48 0.4
49 0.44
50 0.44
51 0.45
52 0.47
53 0.47
54 0.41
55 0.36
56 0.38
57 0.4
58 0.4
59 0.43
60 0.46
61 0.44
62 0.45
63 0.45
64 0.38
65 0.34
66 0.32
67 0.28
68 0.25
69 0.24
70 0.24
71 0.24
72 0.22
73 0.23
74 0.22
75 0.24
76 0.2
77 0.22
78 0.28
79 0.27
80 0.33
81 0.32
82 0.35
83 0.33
84 0.4
85 0.41
86 0.36
87 0.38
88 0.37
89 0.35
90 0.31
91 0.3
92 0.22
93 0.19
94 0.17
95 0.14
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.14
138 0.16
139 0.17
140 0.2
141 0.26
142 0.29
143 0.3
144 0.31
145 0.28
146 0.26
147 0.25
148 0.22
149 0.17
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.15
161 0.21
162 0.25
163 0.27
164 0.29
165 0.33
166 0.37
167 0.43
168 0.47
169 0.5
170 0.56
171 0.64
172 0.71
173 0.77
174 0.82
175 0.83
176 0.85
177 0.86
178 0.87
179 0.88
180 0.89
181 0.91
182 0.92
183 0.93
184 0.92
185 0.93
186 0.93
187 0.93
188 0.92
189 0.86
190 0.82
191 0.74
192 0.71
193 0.66
194 0.58
195 0.52
196 0.47
197 0.5
198 0.45
199 0.47
200 0.41
201 0.36
202 0.35
203 0.31
204 0.32
205 0.25
206 0.31
207 0.36
208 0.41
209 0.49
210 0.55
211 0.65
212 0.7
213 0.8
214 0.84
215 0.86
216 0.91
217 0.94
218 0.95
219 0.93
220 0.93
221 0.92
222 0.89
223 0.86
224 0.8
225 0.73
226 0.68
227 0.6
228 0.49
229 0.38
230 0.31
231 0.23
232 0.17
233 0.12
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.13
259 0.21
260 0.28
261 0.38
262 0.47
263 0.57
264 0.68
265 0.78
266 0.83
267 0.87
268 0.9
269 0.92
270 0.94
271 0.94
272 0.9
273 0.9
274 0.87
275 0.84
276 0.8
277 0.72
278 0.63
279 0.54
280 0.48
281 0.38
282 0.34
283 0.26
284 0.19
285 0.19
286 0.2
287 0.24
288 0.31
289 0.4
290 0.45
291 0.55
292 0.64
293 0.72
294 0.81
295 0.86
296 0.9
297 0.91
298 0.93
299 0.93
300 0.94
301 0.93
302 0.93
303 0.92
304 0.86
305 0.86
306 0.77
307 0.72
308 0.64
309 0.58
310 0.55
311 0.5
312 0.52
313 0.45
314 0.43
315 0.4
316 0.4
317 0.37
318 0.29
319 0.25
320 0.18
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.16
329 0.24
330 0.28
331 0.31
332 0.34
333 0.43
334 0.53
335 0.61
336 0.67
337 0.69
338 0.77
339 0.85
340 0.93
341 0.95
342 0.96
343 0.96
344 0.96
345 0.95
346 0.94
347 0.94
348 0.92
349 0.88
350 0.85
351 0.79
352 0.69
353 0.62
354 0.52
355 0.44
356 0.41
357 0.39
358 0.4
359 0.4
360 0.41
361 0.42
362 0.45
363 0.5
364 0.53
365 0.56
366 0.57
367 0.63
368 0.71
369 0.76
370 0.83
371 0.77
372 0.74
373 0.71
374 0.66
375 0.6
376 0.59
377 0.59