Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L0DM87

Protein Details
Accession A0A1L0DM87    Localization Confidence High Confidence Score 24.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-88VEVEEEKSRKKKKEDDNEDLESAcidic
90-118YFSKILSEDKKEKKEKKLKKETKESEETQHydrophilic
132-152DSDKEEKPKSKKESKAKSVDLBasic
336-361MEPVSDDKKKKGRKLRILRAKANAKPBasic
423-455GIKGLKSAKGKVKKPRITDRSSRFKKERSELSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-77KK
99-110KKEKKEKKLKKE
139-146PKSKKESK
343-458KKKKGRKLRILRAKANAKPSVLSPNHVENVKKAKPSKARLTDEQKTKLGRAKALLGRADRSTAGKLVAEGSRATKGQRIAGIKGLKSAKGKVKKPRITDRSSRFKKERSELSKMAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSAFSSLFGSAKIDEDVASVLKSSAGPVGRQDLKARTLVEVPARPESSSESSEEEDVEESDEANKVVEVEEEKSRKKKKEDDNEDLESQYFSKILSEDKKEKKEKKLKKETKESEETQEGSEESKDSDSDSDSDKEEKPKSKKESKAKSVDLKEEELQKAERTVFVGNVSNNVIKSKLTYKLFKKLFSNVGKVQSIRFRSIAFDEAVPRKVAFVKRSLHDNRDTVNAYVVFKEKEPSTKAAARLNATVFDHHHIRVDHVAHPAPKDNKRTIFVGNLDFEEREEALWRYFNAKVDDDVESVRIVRDSKTNLGKGFALVQFKDTLSVNKALMLNDKVMEPVSDDKKKKGRKLRILRAKANAKPSVLSPNHVENVKKAKPSKARLTDEQKTKLGRAKALLGRADRSTAGKLVAEGSRATKGQRIAGIKGLKSAKGKVKKPRITDRSSRFKKERSELSKMAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.18
15 0.26
16 0.29
17 0.32
18 0.36
19 0.36
20 0.37
21 0.4
22 0.39
23 0.33
24 0.31
25 0.33
26 0.35
27 0.35
28 0.35
29 0.38
30 0.38
31 0.36
32 0.34
33 0.36
34 0.34
35 0.31
36 0.3
37 0.26
38 0.26
39 0.27
40 0.26
41 0.21
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.11
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.13
57 0.21
58 0.26
59 0.32
60 0.4
61 0.48
62 0.54
63 0.6
64 0.67
65 0.7
66 0.77
67 0.81
68 0.81
69 0.8
70 0.78
71 0.71
72 0.62
73 0.52
74 0.41
75 0.32
76 0.23
77 0.15
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.15
82 0.21
83 0.28
84 0.37
85 0.46
86 0.55
87 0.64
88 0.71
89 0.76
90 0.8
91 0.83
92 0.85
93 0.87
94 0.88
95 0.88
96 0.92
97 0.89
98 0.88
99 0.85
100 0.77
101 0.72
102 0.67
103 0.58
104 0.47
105 0.39
106 0.31
107 0.24
108 0.21
109 0.15
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.2
121 0.21
122 0.27
123 0.31
124 0.39
125 0.43
126 0.5
127 0.58
128 0.64
129 0.71
130 0.75
131 0.79
132 0.8
133 0.82
134 0.8
135 0.8
136 0.75
137 0.72
138 0.65
139 0.57
140 0.51
141 0.48
142 0.41
143 0.34
144 0.31
145 0.24
146 0.23
147 0.2
148 0.18
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.13
155 0.14
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.13
161 0.1
162 0.12
163 0.15
164 0.2
165 0.22
166 0.3
167 0.33
168 0.42
169 0.45
170 0.46
171 0.45
172 0.43
173 0.48
174 0.45
175 0.47
176 0.41
177 0.43
178 0.41
179 0.39
180 0.36
181 0.33
182 0.32
183 0.28
184 0.25
185 0.21
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.17
190 0.15
191 0.17
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.16
196 0.15
197 0.18
198 0.21
199 0.19
200 0.22
201 0.25
202 0.26
203 0.35
204 0.38
205 0.38
206 0.38
207 0.37
208 0.33
209 0.33
210 0.33
211 0.24
212 0.23
213 0.2
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.12
218 0.11
219 0.13
220 0.11
221 0.14
222 0.16
223 0.18
224 0.21
225 0.24
226 0.27
227 0.29
228 0.31
229 0.28
230 0.28
231 0.26
232 0.23
233 0.19
234 0.18
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.14
239 0.16
240 0.15
241 0.16
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.23
247 0.21
248 0.22
249 0.26
250 0.29
251 0.33
252 0.35
253 0.38
254 0.39
255 0.4
256 0.41
257 0.37
258 0.35
259 0.32
260 0.29
261 0.25
262 0.23
263 0.21
264 0.19
265 0.17
266 0.14
267 0.12
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.14
276 0.18
277 0.19
278 0.19
279 0.19
280 0.2
281 0.22
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.13
292 0.16
293 0.22
294 0.28
295 0.31
296 0.3
297 0.31
298 0.3
299 0.27
300 0.28
301 0.24
302 0.22
303 0.19
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.2
308 0.16
309 0.15
310 0.15
311 0.18
312 0.16
313 0.18
314 0.2
315 0.19
316 0.22
317 0.21
318 0.19
319 0.17
320 0.17
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.16
326 0.22
327 0.3
328 0.32
329 0.38
330 0.47
331 0.55
332 0.62
333 0.67
334 0.7
335 0.73
336 0.82
337 0.86
338 0.88
339 0.89
340 0.87
341 0.86
342 0.84
343 0.78
344 0.75
345 0.67
346 0.57
347 0.49
348 0.44
349 0.45
350 0.37
351 0.35
352 0.31
353 0.33
354 0.35
355 0.37
356 0.36
357 0.31
358 0.4
359 0.42
360 0.45
361 0.43
362 0.49
363 0.56
364 0.64
365 0.69
366 0.69
367 0.71
368 0.74
369 0.79
370 0.79
371 0.78
372 0.76
373 0.7
374 0.62
375 0.6
376 0.57
377 0.52
378 0.47
379 0.42
380 0.45
381 0.44
382 0.47
383 0.48
384 0.44
385 0.43
386 0.4
387 0.39
388 0.32
389 0.3
390 0.27
391 0.23
392 0.21
393 0.18
394 0.18
395 0.19
396 0.19
397 0.18
398 0.17
399 0.18
400 0.2
401 0.21
402 0.21
403 0.22
404 0.24
405 0.27
406 0.32
407 0.33
408 0.32
409 0.39
410 0.44
411 0.4
412 0.44
413 0.43
414 0.41
415 0.41
416 0.46
417 0.48
418 0.52
419 0.6
420 0.63
421 0.72
422 0.75
423 0.8
424 0.84
425 0.83
426 0.83
427 0.85
428 0.84
429 0.84
430 0.85
431 0.86
432 0.82
433 0.81
434 0.82
435 0.8
436 0.81
437 0.79
438 0.79