Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L0DCX8

Protein Details
Accession A0A1L0DCX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-135QMEAERRQSSRKRRPRAGQLYDSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-126RKRRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
IPR027113  Transc_fact_NFYB/HAP3  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MKSENVSESQLRNCDYEIKEQDRYLPIANVARVMKLALPQQAKLSKESKECVQECVSEFISFITSQAIDRCTLEKRKTLNGEDILWAMFTLGFEHYAETLKIYLAKYREFEQMEAERRQSSRKRRPRAGQLYDSESDSEVMSTENFEFEDSPEEPYVNFEGFNFANSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.38
4 0.41
5 0.42
6 0.44
7 0.43
8 0.47
9 0.43
10 0.43
11 0.35
12 0.29
13 0.27
14 0.27
15 0.27
16 0.26
17 0.23
18 0.21
19 0.19
20 0.18
21 0.16
22 0.15
23 0.18
24 0.2
25 0.21
26 0.22
27 0.27
28 0.31
29 0.32
30 0.33
31 0.33
32 0.31
33 0.33
34 0.35
35 0.34
36 0.38
37 0.38
38 0.38
39 0.36
40 0.34
41 0.32
42 0.33
43 0.29
44 0.2
45 0.19
46 0.15
47 0.15
48 0.12
49 0.11
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.14
59 0.2
60 0.22
61 0.25
62 0.27
63 0.33
64 0.37
65 0.37
66 0.38
67 0.34
68 0.33
69 0.29
70 0.26
71 0.2
72 0.15
73 0.13
74 0.07
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.09
89 0.09
90 0.12
91 0.13
92 0.15
93 0.16
94 0.18
95 0.24
96 0.23
97 0.23
98 0.26
99 0.3
100 0.33
101 0.34
102 0.33
103 0.29
104 0.29
105 0.36
106 0.39
107 0.44
108 0.5
109 0.58
110 0.67
111 0.74
112 0.82
113 0.86
114 0.88
115 0.85
116 0.82
117 0.76
118 0.72
119 0.64
120 0.56
121 0.46
122 0.35
123 0.27
124 0.2
125 0.15
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.15
137 0.13
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.19
143 0.21
144 0.16
145 0.16
146 0.12
147 0.16
148 0.16